Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 3pnu-A 62.6 0.0 338 338 100 PDB MOLECULE: DIHYDROOROTASE;
2
DSSP LLLLLLLLLEEEELLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLHHHHHH Query ENLYFQSNAMKLKNPLDMHLHLRDNQMLELIAPLSARDFCAAVIMPNLIPPLCNLEDLKA 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ENLYFQSNAMKLKNPLDMHLHLRDNQMLELIAPLSARDFCAAVIMPNLIPPLCNLEDLKA 60 DSSP LLLLLLLLLEEEELLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLLLLLHHHHHH DSSP HHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLH Query YKMRILKACKDENFTPLMTLFFKNYDEKFLYSAKDEIFGIXLYPAGITTNSNGGVSSFDI 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct YKMRILKACKDENFTPLMTLFFKNYDEKFLYSAKDEIFGIXLYPAGITTNSNGGVSSFDI 120 DSSP HHHHHHHHHLLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLH DSSP HHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLHHH Query EYLKPTLEAMSDLNIPLLVHGETNDFVMDRESNFAKIYEKLAKHFPRLKIVMEHITTKTL 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct EYLKPTLEAMSDLNIPLLVHGETNDFVMDRESNFAKIYEKLAKHFPRLKIVMEHITTKTL 180 DSSP HHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLHHH DSSP HHHHHHLLLEEEEELLHHHLLLHHHHHLLLLLHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLL Query CELLKDYENLYATITLHHLIITLDDVIGGKMNPHLFCKPIAKRYEDKEALCELAFSGYEK 240 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct CELLKDYENLYATITLHHLIITLDDVIGGKMNPHLFCKPIAKRYEDKEALCELAFSGYEK 240 DSSP HHHHHHLLLEEEEELLHHHLLLHHHHHLLLLLHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLL DSSP EEELLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLLLL Query VMFGSDSAPHPKGCAAGVFSAPVILPVLAELFKQNSSEENLQKFLSDNTCKIYDLKFKED 300 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct VMFGSDSAPHPKGCAAGVFSAPVILPVLAELFKQNSSEENLQKFLSDNTCKIYDLKFKED 300 DSSP EEELLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLLLL DSSP LEEEEELLLEELLLLEELLLLEELLLLLLLEELLEELL Query KILTLEEKEWQVPNVYEDKYNQVVPYMAGEILKFQLKH 338 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct KILTLEEKEWQVPNVYEDKYNQVVPYMAGEILKFQLKH 338 DSSP LEEEEELLLEELLLLEELLLLEELLLLLLLEELLEELL
DSSP -------------LLLL--------------------------llLLLEEEELLEEEEEL Query -------------ENLY--------------------------fqSNAMKLKNPLDMHLH 21 ident | | | | Sbjct xklikngkvlqngELQQadilidgkvikqiapaiepsngvdiidaKGHFVSPGFVDVHVH 60 DSSP leeeelleeeellEEEEleeeeelleeeeeellllllllleeeelLLLEEEELEEEEEEL DSSP LLLH-----hHHHHHHHHHHL-LLLEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHlllLLE Query LRDN-----qMLELIAPLSAR-DFCAAVIMPNLIPPLCNLEDLKAYKMRILKACkdeNFT 75 ident || | || | || | | | | Sbjct LREPggeykeTIETGTKAAARgGFTTVCPXPNTRPVPDSVEHFEALQKLIDDNA---QVR 117 DSSP LLLLllllllLHHHHHHHHHHlLEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL---LLE DSSP EEEEEELL------LLLHhhHHHHLL-LLLEEEELLLllllllllLLLLLLhhHHHHHHH Query PLMTLFFK------NYDEkfLYSAKD-EIFGIXLYPAgittnsngGVSSFDieYLKPTLE 128 ident | | || Sbjct VLPYASITtrqlgkELVD--FPALVKeGAFAFTDDGV--------GVQTAS--XXYEGXI 165 DSSP ELLLEELLhhhlllLLLL--HHHHHLlLLLLEEELLL--------LLLLHH--HHHHHHH DSSP HHHHLLLLEEELLLLLL-------------------LHHH-LLHHHHHHHHHHHHHLLlL Query AMSDLNIPLLVHGETND-------------------FVMD-RESNFAKIYEKLAKHFPrL 168 ident | | | | || || Sbjct EAAKVNKAIVAHCEDNSliyggaxhegkrskelgipGIPNiCESVQIARDVLLAEAAG-C 224 DSSP HHHHHLLLEEELLLLHHhllllleellhhhhhhlllEELLhHHHHHHHHHHHHHHHHL-L DSSP LEEELLLLLHHHHHHHHHL----LLEEEEELLHHHLLLHHHHhlLLLLHHHLLLLLLLLH Query KIVMEHITTKTLCELLKDY----ENLYATITLHHLIITLDDVigGKMNPHLFCKPIAKRY 224 ident | || | | | ||| | || | | Sbjct HYHVCHVSTKESVRVIRDAkragIHVTAEVTPHHLLLTEDDI--PGNNAIYKXNPPLRST 282 DSSP LEEELLLLLHHHHHHHHHHhhllLLEEEEELHHHHHLLHHHL--LLLLHHHLLLLLLLLH DSSP HHHHHHHHHHHLlLLLEEELLLLLLLLL--------LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH--H Query EDKEALCELAFSgYEKVMFGSDSAPHPK--------GCAAGVFSAPVILPVLAELFK--Q 274 ident || ||| | | ||| | | | | Sbjct EDREALLEGLLD-GTIDCIATDHAPHARdekaqpxeKAPFGIVGSETAFPLLYTHFVknG 341 DSSP HHHHHHHHHHHL-LLLLEELLLLLLLLHhhhlllllLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLllL DSSP HLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLL------LLLLEEEEEL-LLEELLLLEellllEELLL- Query NSSEENLQKFLSDNTCKIYDLKF------KEDKILTLEE-KEWQVPNVYedkynQVVPY- 326 ident | | | | | Sbjct DWTLQQLVDYLTIKPCETFNLEYgtlkenGYADLTIIDLdSEQEIKGED--flsKADNTp 399 DSSP LLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLllllllLLLLEEEEELlLLEELLHHH--lllLLLLLl DSSP LLLLEELLEELL----------- Query MAGEILKFQLKH----------- 338 ident | Sbjct FIGYKVYGNPILtxvegevkfeg 422 DSSP LLLLEELLEEEEeeelleeeeel
DSSP ----------------------------------------lllLLLLlLEEEELLEEEEE Query ----------------------------------------enlYFQSnAMKLKNPLDMHL 20 ident | | Sbjct sfdliikngtvilenearvvdiavkggkiaaigqdlgdakevxDASG-LVVSPGXVDAHT 59 DSSP leeeeeelleeelllleeeleeeeelleeeeeellllleeeeeELLL-LEEEELEEEEEE DSSP LLllhhHHHHHHHHHHL-LLLEEEELLL-LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHlllLLEEEE Query HLrdnqMLELIAPLSAR-DFCAAVIMPN-LIPPLCNLEDLKAYKMRILKACkdeNFTPLM 78 ident | | | | | Sbjct HI----GYETGTRAAAKgGITTXIEXPLnQLPATVDRASIELKFDAAKGKL---TIDAAQ 112 DSSP LL----LHHHHHHHHHHlLEEEEEELLLlLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLL---LLEEEE DSSP EEELL-LLLHhHHHHHLL-LLLEEEELLllllllllLLLLLllhHHHHHHHHHHHHLLLL Query TLFFK-NYDEkFLYSAKD-EIFGIXLYPagittnsnGGVSSfdiEYLKPTLEAMSDLNIP 136 ident | | | | | | Sbjct LGGLVsYNID-RLHELDEvGVVGFXCFV--------RDVND---WQFFKGAQKLGELGQP 160 DSSP LEELLlLLLL-LHHHHHHhLLLLEEEEL--------LLLLH---HHHHHHHHHHHHHLLL DSSP EEELLLLLL----------------------LHHH-LLHHHHHHHHHHHHHLlLLLEEEL Query LLVHGETND----------------------FVMD-RESNFAKIYEKLAKHFpRLKIVME 173 ident ||| | | ||| Sbjct VLVHCENALicdelgeeakregrvtahdyvaSRPVfTEVEAIRRVLYLAKVA-GCRLHVC 219 DSSP EEEELLLHHhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHH-LLLEEEL DSSP LLLLHHHHHHHHHL----LLEEEEELLHHHLLLHHHHHllLLLHHHLLLLLLLLHHHHHH Query HITTKTLCELLKDY----ENLYATITLHHLIITLDDVIggKMNPHLFCKPIAKRYEDKEA 229 ident | | | | | | | Sbjct HVSSPEGVEEVTRArqegQDITCESCPHYFVLDTDQFE--EIGTLAKCSPPIRDLENQKG 277 DSSP LLLLHHHHHHHHHHhhllLLEEEEELLHHHHLLHHHHH--HHLHHHLLLLLLLLHHHHHH DSSP HHHHHHLLLlLEEELLLLLLLLL--------LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH--HHLLHH Query LCELAFSGYeKVMFGSDSAPHPK--------GCAAGVFSAPVILPVLAELFK--QNSSEE 279 ident | | | || | | | | | Sbjct XWEKLFNGE-IDCLVSDHSPCPPexkagnixKAWGGIAGLQSCXDVXFDEAVqkRGXSLP 336 DSSP HHHHHHLLL-LLEELLLLLLLLLllllllllLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLLHH DSSP HHHHHHLHHHHHHHLLLL-------LLLLEEEEEL-LLEELLLLEelllLEELLLLLLLE Query NLQKFLSDNTCKIYDLKF-------KEDKILTLEE-KEWQVPNVYedkyNQVVPYMAGEI 331 ident | | | | | | | | Sbjct XFGKLXATNAADIFGLQQkgriapgKDADFVFIQPnSSYVLTNDD-leyRHKVSPYVGRT 395 DSSP HHHHHHLHHHHHHLLLLLlllllllLLLLEEEEELlLLEELLHHH-lllLLLLLLLLLLE DSSP ELLEELL--------------------------- Query LKFQLKH--------------------------- 338 ident Sbjct IGARITKtilrgdviydieqgfpvapkgqfilkh 429 DSSP ELLEEEEeeelleeeeelllllllllllleelll
DSSP ----------------------------------------lllLLLLlLEEEELLEEEEE Query ----------------------------------------enlYFQSnAMKLKNPLDMHL 20 ident | | Sbjct pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgteviDATG-KYVFPGFIDPHV 59 DSSP leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeELLL-LEEEELEEEEEE DSSP LLLL-------hhHHHHHHHHHHL-LLLEEEELLLLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHlll Query HLRD-------nqMLELIAPLSAR-DFCAAVIMPNLIpplCNLEDLKAYKMRILKACkde 72 ident | | | || | Sbjct HIYLpfmatfakdTHETGSKAALMgGTTTYIEMCCPSrndDALEGYQLWKSKAEGNS--- 116 DSSP LLLLeelleelllLHHHHHHHHHHlLEEEEEEEELLLlllLHHHHHHHHHHHHLLLL--- DSSP LLEEEEEEEL-LLLL--HHHHHHHL-LLLLEEEELLLLllllLLLLLLLLLhhHHHHHHH Query NFTPLMTLFF-KNYD--EKFLYSAK-DEIFGIXLYPAGittnSNGGVSSFDieYLKPTLE 128 ident | | | | | | | || Sbjct YCDYTFHMAVsKFDEktEGQLREIVaDGISSFXIFLSY----KNFFGVDDG--EMYQTLR 170 DSSP LLEEEEEEELlLLLLlhHHHHHHHHhLLLLEEEEEELL----LLLLLLLHH--HHHHHHH DSSP HHHHLLLLEEELLLLLL----------------------LHHH-LLHHHHHHHHHHHHHL Query AMSDLNIPLLVHGETND----------------------FVMD-RESNFAKIYEKLAKHF 165 ident | | | | Sbjct LAKELGVIVTAHCENAElvgrlqqkllsegktgpewhepSRPEaVEAEGTARFATFLETT 230 DSSP HHHHHLLEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllllhhhlllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHH DSSP LlLLEEELLLLLHHHHHHHHHL----LLEEEEELLHHHLLLHHHHHLLL-LLHHHLLLLL Query PrLKIVMEHITTKTLCELLKDY----ENLYATITLHHLIITLDDVIGGK-MNPHLFCKPI 220 ident | | | | | | Sbjct G-ATGYVVHLSCKPALDAAMAAkargVPIYIESVIPHFLLDKTYAERGGvEAMKYIMSPP 289 DSSP L-LEEEELLLLLHHHHHHHHHHhhllLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHLLHhHHHLLLLLLL DSSP LLLHHHHHHHHHHHHLLLlLEEELLLLLLLLLL-----------LLLLLLLHHHHHHHHH Query AKRYEDKEALCELAFSGYeKVMFGSDSAPHPKG-----------CAAGVFSAPVILPVLA 269 ident | | | | | | | Sbjct LRDKRNQKVLWDALAQGF-IDTVGTDHCPFDTEqkllgkeaftaIPNGIPAIEDRVNLLY 348 DSSP LLLLHHHHHHHHHHHLLL-LLEEELLLLLLLHHhhhhhlllhhhLLLLLLLLLLHHHHHH DSSP HHHH--HHLLHHHHHHHHLHHHHHH-HLLLL-------LLLLEEEEEL-LLEELLLLEel Query ELFK--QNSSEENLQKFLSDNTCKI-YDLKF-------KEDKILTLEE-KEWQVPNVYed 318 ident | | Sbjct TYGVsrGRLDIHRFVDAASTKAAKLfGLFPRkgtiavgSDADLVVYDPqYRGTISVKT-q 407 DSSP HHHLllLLLLHHHHHHHHLHHHHHHlLLLLLlllllllLLLLEEEEELlLLEELLHHH-l DSSP llLEELLLLLLLEELLEELL------------------------------- Query kyNQVVPYMAGEILKFQLKH------------------------------- 338 ident | | Sbjct hvNNDYNGFEGFEIDGRPSVvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf 458 DSSP llLLLLLLLLLLEELLEEEEeeelleeeeelleelllllllllllllllll
DSSP -----------------------------------------lllLLLLlLEEEELLEEEE Query -----------------------------------------enlYFQSnAMKLKNPLDMH 19 ident | | Sbjct drllikggriinddqslyadvyledglikqigenlivpggvktiEANG-RMVIPGGIDVN 59 DSSP leeeeeeeeeelllleeeeeeeeelleeeeeellllllllleeeELLL-LEEEELEEEEE DSSP ELLLLHH--HHHHHHHHHHL-LLLEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHlllLLEE Query LHLRDNQ--MLELIAPLSAR-DFCAAVIMPNLIPPLCNLEDLKAYKMRILKACkdeNFTP 76 ident | | | Sbjct TYLQKTAadDFFQGTRAALVgGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKS---CCDY 116 DSSP ELLLLLLllLHHHHHHHHHHlLEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLL---LLEE DSSP EEEEE-LLLL--LHHHHHHHL--LLLLEEEELLLLlllllLLLLLLLLhhHHHHHHHHHH Query LMTLF-FKNY--DEKFLYSAK--DEIFGIXLYPAGittnsNGGVSSFDieYLKPTLEAMS 131 ident | | | | | | Sbjct SLHVDiTSWYdgVREELEVLVqdKGVNSFQVYMAY----kDVYQMSDS--QLYEAFTFLK 170 DSSP EEEEElLLLLllHHHHHHHHHhlLLLLEEEEELLL----lLLLLLLHH--HHHHHHHHHH DSSP HLLLLEEELLLLLL----------------------LHHH-LLHHHHHHHHHHHHHLLlL Query DLNIPLLVHGETND----------------------FVMD-RESNFAKIYEKLAKHFPrL 168 ident | ||| | | | | Sbjct GLGAVILVHAENGDliaqeqkrilemgitgpeghalSRPEeLEAEAVFRAITIAGRIN-C 229 DSSP HHLLEEEEELLLHHhhhhhhhhhhhllllllhhhhhHLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHL-L DSSP LEEELLLLLHHHHHHHHHL----LLEEEEELLHHHLLLHHHHHLLLL--LHHHLLLLLLL Query KIVMEHITTKTLCELLKDY----ENLYATITLHHLIITLDDVIGGKM--NPHLFCKPIAK 222 ident | | | Sbjct PVYITKVMSKSAADIIALArkkgPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWakAAAFVTSPPLS 289 DSSP LEEEEEELLHHHHHHHHHHhhhlLLEEEEELHHHHHLLLHHHHLLLHhhHHHLLLLLLLL DSSP -LHHHHHHHHHHHHLlLLLEEELLLLLLLLL-----------LLLLLLLLHHHHHHHHHH Query -RYEDKEALCELAFSgYEKVMFGSDSAPHPK-----------GCAAGVFSAPVILPVLAE 270 ident | | || | || | Sbjct pDPTTPDYLTSLLAC-GDLQVTGSGHCPYSTaqkavgkdnftLIPEGVNGIEERMTVVWD 348 DSSP lLLLHHHHHHHHHHH-LLLLLLLLLLLLLLHhhhhhhlllhhHLLLLLLLLLLHHHHHHH DSSP -HHHH-HLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLL--------LLLLEEEEE-LLLEELLL--LEE Query -LFKQ-NSSEENLQKFLSDNTCKIYDLKF--------KEDKILTLE-EKEWQVPN--VYE 317 ident | | | || | | Sbjct kAVATgKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPrkgriavgSDADVVIWDpDKLKTITAksHKS 408 DSSP hHLLLlLLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLllllllllLLLLEEEEEeEEEEELLLllLLL DSSP LlllEELLLLLLLEELLEELL--------------------------------------- Query DkynQVVPYMAGEILKFQLKH--------------------------------------- 338 ident | Sbjct A---VEYNIFEGMECHGSPLVvisqgkivfedgninvnkgmgrfiprkafpehlyqrvki 465 DSSP L---LLLLLLLLLEEEEEEEEeeelleeeeelleellllllllllllllllhhhhhhhhh DSSP ------------ Query ------------ 338 ident Sbjct rnkvfglqgvsr 477 DSSP hhhhllllllll
DSSP -------------------------------------------llllllLLLEEEELLEE Query -------------------------------------------enlyfqSNAMKLKNPLD 17 ident | | Sbjct ekldfkitggwiidgtgaprrradlgvrdgriaaigelgahparhawdaSGKIVAPGFID 60 DSSP lleeeeeelleelllllllleeleeeeelleeeeeelllllleeeeeelLLLEEEELEEE DSSP EEELL--LLHHHHHhhHHHHHL-LLLEEEELlllllLLLL-------------------- Query MHLHL--RDNQMLEliAPLSAR-DFCAAVIMpnlipPLCN-------------------- 54 ident | | | Sbjct VHGHDdlMFVEKPD--LRWKTSqGITTVVVG-ncgvSAAPaplpgntaaalallgetplf 117 DSSP LLLLLllHHHHLLL--LHHHHLlLEEEEEEL-llllLLLLllllllllhhhhhhllllll DSSP --HHHHHHHHHHhHHHHllllLEEEEEEELLLL-------------------LHHHHHHH Query --LEDLKAYKMRiLKACkdenFTPLMTLFFKNY-------------------DEKFLYSA 93 ident | | | | Sbjct adVPAYFAALDA-QRPM----INVAALVGHANLrlaamrdpqaaptaaeqqaMQDMLQAA 172 DSSP llHHHHHHHHHH-LLLL----LEEEEEEEHHHHhhhhlllllllllhhhhhhHHHHHHHH DSSP L-LLLLEEEELLLLllllllLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLlllhHHLLH Query K-DEIFGIXLYPAGittnsnGGVSSFDIEYLKPTLEAMSDLNIPLLVHGETndfvMDRES 152 ident | | | | | Sbjct LeAGAVGFSTGLAY------QPGAVAQAAELEGLARVAAERRRLHTSHIRN---eADGVE 223 DSSP HhHLLLEEEEELLL------LLHHHLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL---lLLLHH DSSP HHHHHHHHHHHHLlLLLEEELLLLL---------HHHHHHHHHLL----LEEEEELLHH- Query NFAKIYEKLAKHFpRLKIVMEHITT---------KTLCELLKDYE----NLYATITLHH- 198 ident | | | Sbjct AAVEEVLAIGRGT-GCATVVSHHKCmmpqnwgrsRATLANIDRAReqgvEVALDIYPYPg 282 DSSP HHHHHHHHHHHHH-LLEEEELLLLLllhhhlllhHHHHHHHHHHHhlllLEEEEELLLLe DSSP ---hlllhhhhHLLLLLH-----------------------------------HHLLlll Query ---liitlddvIGGKMNP-----------------------------------HLFCkpi 220 ident Sbjct sstiliperaeTIDDIRItwstphpecsgeyladiaarwgcdkttaarrlapaGAIY--- 339 DSSP eeeellhhhllLLLLLEEeeelllhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhlleEEEE--- DSSP LLLHhhHHHHHHHHHllLLLEEELLLLLLLLLllllLLLLHHHHHHHHH-HHHH--HHLL Query AKRYedKEALCELAFsgYEKVMFGSDSAPHPKgcaaGVFSAPVILPVLA-ELFK--QNSS 277 ident | ||| | Sbjct FAMD--EDEVKRIFQ--HPCCMVGSDGLPNDA---rPHPRLWGSFTRVLgRYVReaRLMT 392 DSSP ELLL--HHHHHHHHH--LLLEEELLLLLLLLL---lLLLHHHHHHHHHHhHHHHhlLLLL DSSP HHHHHHHHLHHHHHHHLLLL-------LLLLEEEEELLLeelllleelllleeLLLLlll Query EENLQKFLSDNTCKIYDLKF-------KEDKILTLEEKEwqvpnvyedkynqvVPYMage 330 ident | | Sbjct LEQAVARMTALPARVFGFAErgvlqpgAWADVVVFDPDT------vadratwdEPTL--- 443 DSSP HHHHHHHHLHHHHHHHLLLLlllllllLLLLEEEELLLL------llllllllLLLL--- DSSP eelLEELL------------------------- Query ilkFQLKH------------------------- 338 ident Sbjct -asVGIAGvlvngaevfpqppadgrpgqvlrax 475 DSSP -llLLEEEeeelleeeellllllllllllllll
DSSP llllllllleeeELLEEEEELLLL-------------------------------hHHHH Query enlyfqsnamklKNPLDMHLHLRD-------------------------------nQMLE 29 ident | | || Sbjct ------------LKIIDFRLRPPAmgflnariytrpdirnrftrqlgfepapsaeeKSLE 48 DSSP ------------LLLEELLLLLLLhhhhhlhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhLLHH DSSP HHHHHHHL-LLLEEEELLL---llLLLLLHhHHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEELLL- Query LIAPLSAR-DFCAAVIMPN---liPPLCNLeDLKAYKMRILkackdenFTPLMTLFFKN- 84 ident | | | | | | Sbjct LMFEEMAAaGIEQGVCVGRnssvlGSVSNA-DVAAVAKAYP-------DKFHPVGSIEAa 100 DSSP HHHHHHHHlLLLEEEEELLeelllEELLHH-HHHHHHHHLL-------LLEEEEEELLLl DSSP ---LLHHHHHHHLL-LLLEEEELLLLllllllLLLLLL-lHHHHHHHHHHHHHLLLLEEE Query ---YDEKFLYSAKD-EIFGIXLYPAGittnsnGGVSSF-dIEYLKPTLEAMSDLNIPLLV 139 ident | | | | | | | || Sbjct trkEAMAQMQEILDlGIRIVNLEPGV------WATPMHvdDRRLYPLYAFCEDNGIPVIM 154 DSSP lhhHHHHHHHHHHHlLLLLEEELHHH------LLLLLLllLHHHHHHHHHHHHLLLLEEE DSSP LL---LLLLlhHHLLhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEL-LLLL--HHHHHHHHHLLLEEEE Query HG---ETNDfvMDREsnFAKIYEKLAKHFPRLKIVME-HITT--KTLCELLKDYENLYAT 193 ident | || | | ||| Sbjct MTggnAGPD--ITYT--NPEHIDRVLGDFPDLTVVSShGNWPwvQEIIHVAFRRPNLYLS 210 DSSP ELlllLLLL--HHHH--LHHHHHHHHHHLLLLLEEEEhHHLLlhHHHHHHHHHLLLEEEE DSSP ELlHHHLLLhhhhhlllllhhhllllllllhHHHHHHHHHHHL-lLLLEEELLLLLllll Query ITlHHLIITlddviggkmnphlfckpiakryEDKEALCELAFS-gYEKVMFGSDSAphpk 252 ident | | | || Sbjct PD-MYLYNL----------------------PGHADFIQAANSflADRMLFGTAYP---- 243 DSSP LH-HHHLLL----------------------LLHHHHHHHHLLhhHHLLLLLLLLL---- DSSP lllllLLLHHHHHHHHHHHhhhHLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLlllllleeeeellleel Query gcaagVFSAPVILPVLAELfkqNSSEENLQKFLSDNTCKIYDLkfkedkiltleekewqv 312 ident | | | | Sbjct -----MCPLKEYTEWFLTL---PIKPDAMEKILHGNAERLLAQ----------------- 278 DSSP -----LLLHHHHHHHHHLL---LLLHHHHHHHHLHHHHHHHHH----------------- DSSP llleelllleellllllleelleell Query pnvyedkynqvvpymageilkfqlkh 338 ident Sbjct -----------------------agr 281 DSSP -----------------------lll
DSSP llllllllleeeeLLEEEEELLLLhhHHHHHHHHHHLL-LLEEEELLLL----------- Query enlyfqsnamklkNPLDMHLHLRDnqMLELIAPLSARD-FCAAVIMPNL----------- 48 ident | | | | Sbjct -------------LIIDGHTHVIL--PVEKHIKIMDEAgVDKTILFSTSihpetavnlrd 45 DSSP -------------LLEEEEEELLL--LHHHHHHHHHHHlLLEEEEELLLllhhhlllhhh DSSP -----------------------LLLLllhHHHHHHHHHHHhhhllllLEEEEEEELLL- Query -----------------------IPPLcnlEDLKAYKMRILkackdenFTPLMTLFFKN- 84 ident | Sbjct vkkemkklndvvngktnsmidvrRNSI---KELTNVIQAYP-------SRYVGFGNVPVg 95 DSSP hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhHHHH---HHHHHHHHHLL-------LLEEEEELLLLl DSSP ----lLHHHHHHHLL--LLLEEE-ELLLllllllllllLLLLhhHHHHHHHHHHHL-LLL Query ----yDEKFLYSAKD--EIFGIX-LYPAgittnsnggvSSFDieYLKPTLEAMSDL-NIP 136 ident || | || ||| | | Sbjct lsendTNSYIEENIVnnKLVGIGeLTPA---------sGQIK--SLKPIFKYSMDSgSLP 144 DSSP llhhhHHHHHHHHLLllLLLEEEeELLL---------lLLHH--HHHHHHHHHHHLlLLL DSSP EEELLLLLllhhhLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLL---LHHHHHHHHHLLLEEEE Query LLVHGETNdfvmdRESNFAKIYEKLAKHFPRLKIVMEHIT---TKTLCELLKDYENLYAT 193 ident | | | | || | | || | ||| Sbjct IWIHAFNP-----LVLQDIKEIAELCKAFPKVPVILGHMGgsnWMTAVELAKEIQNLYLD 199 DSSP EEELLLLL-----LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEHHHHhhhHHHHHHHHHHLLLEEEE DSSP ELlHHHLllhhhhhlllllhhhllllllllhhhHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLlllll Query ITlHHLIitlddviggkmnphlfckpiakryedKEALCELAFSGYEKVMFGSDSAphpkg 253 ident | | || | Sbjct TS-AYFS--------------------------TFVLKIVINELPLKCIFGTDMP----- 227 DSSP LL-LLLL--------------------------HHHHHHHHHHLLLLEELLLLLL----- DSSP llllLLLHHHHHHHHHHHHhhhLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLlllllleeeeellleell Query caagVFSAPVILPVLAELFkqnSSEENLQKFLSDNTCKIYDLkfkedkiltleekewqvp 313 ident | || Sbjct ----FGDLQLSIEAIKKMS---NDSYVANAVLGDNISRLLNI------------------ 262 DSSP ----LLLHHHHHHHHHHHL---LLHHHHHHHHLHHHHHHHLL------------------ DSSP lleelllleellllllleelleell Query nvyedkynqvvpymageilkfqlkh 338 ident Sbjct ------------------------- 262 DSSP -------------------------
DSSP --------------------------------------------------llllLLLLLe Query --------------------------------------------------enlyFQSNAm 10 ident Sbjct midytaagftllqgahlyapedrgicdvlvangkiiavasnipsdivpnctvvdLSGQI- 59 DSSP llllhhhlleeeeeeeeellleeeeeeeeeelleeeeeellllllllllleeeeLLLLE- DSSP EEELLEEEEELLLL---------HHHHhhHHHHHHL-LLLEEEELLL--LLLLLllHHHH Query KLKNPLDMHLHLRD---------NQMLelIAPLSAR-DFCAAVIMPN--LIPPLcnLEDL 58 ident | | || | | | | Sbjct LCPGFIDQHVHLIGgggeagpttRTPE-vALSRLTEaGVTSVVGLLGtdSISRH--PESL 116 DSSP EEELEEEEEELLLLllllllhhhLLLL-lLHHHHHHlLEEEEEELLLllLLLLL--HHHH DSSP HHHHHHHHHHhlllLLEEEEEEE--LLLL--lhHHHHHHL---LLLLEEEELL-LLLLll Query KAYKMRILKAckdeNFTPLMTLF--FKNY--deKFLYSAK---DEIFGIXLYP-AGITtn 110 ident | | | | | Sbjct LAKTRALNEE----GISAWMLTGayHVPSrtitGSVEKDVaiiDRVIGVXCAIsDHRS-- 170 DSSP HHHHHHHHHH----LLEEEEEEEllLLLLllllLLHHHHHhhlLLEEEEEEEElLLLL-- DSSP llllllLLLHHHHHHHHHHHHHLL------LLEEELLLLLLlhhhllhHHHHHHHHHHH- Query snggvsSFDIEYLKPTLEAMSDLN------IPLLVHGETNDfvmdresNFAKIYEKLAK- 163 ident | | | | Sbjct -----aAPDVYHLANMAAESRVGGllggkpGVTVFHMGDSK-------KALQPIYDLLEn 218 DSSP -----lLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLEEEEEELLLL-------LLLHHHHHHHHl DSSP HLLLL-LEEELLLL-----LHHHHHHHHHLllEEEEELLHHhLLLHhhhhlllllhhhll Query HFPRL-KIVMEHIT-----TKTLCELLKDYenLYATITLHHlIITLddviggkmnphlfc 217 ident | | | || Sbjct CDVPIsKLLPTHVNrnvplFEQALEFARKG--GTIDITSSI-DEPV-------------- 261 DSSP LLLLHhHEEEELHHhlhhhHHHHHHHHHLL--LLEEEELLL-LLLL-------------- DSSP llllllhhhhHHHHHH--hhllLLLEEELLLLLLL--------llLLLLLlLLHHHHHhH Query kpiakryedkEALCEL--afsgYEKVMFGSDSAPH--------pkGCAAGvFSAPVILpV 267 ident | | || | Sbjct -------apaEGIARAvqagipLARVTLSSDGNGSqpffddegnlTHIGV-AGFETLL-E 312 DSSP -------lhhHHHHHHhhllllHHHEEEELLLLLEeeeellllleEEEEE-LLLHHHH-H DSSP HHHHHHH--HLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLL-------LLLLEEEEELLleelllleel Query LAELFKQ--NSSEENLQKFLSDNTCKIYDLKF-------KEDKILTLEEKewqvpnvyed 318 ident | | | | Sbjct TVQVLVKdyDFSISDALRPLTSSVAGFLNLTGkgeilpgNDADLLVMTPE---------- 362 DSSP HHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLlllllllLLLLEEEELLL---------- DSSP llleellllllleelLEELL----------------------- Query kynqvvpymageilkFQLKH----------------------- 338 ident Sbjct ---------------LRIEQvyargklmvkdgkacvkgtfetd 390 DSSP ---------------LLEEEeeelleeeeelleelllllllll
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