Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 3icj-A 66.0 0.0 468 468 100 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED METAL-DEPENDENT HYDROLASE;
2: 3mtw-A 30.1 3.1 315 404 20 PDB MOLECULE: L-ARGININE CARBOXYPEPTIDASE CC2672;
3: 3ls9-A 29.6 2.7 326 453 16 PDB MOLECULE: TRIAZINE HYDROLASE;
4: 2paj-A 28.8 2.8 310 421 16 PDB MOLECULE: PUTATIVE CYTOSINE/GUANINE DEAMINASE;
5: 3mkv-A 28.7 3.0 309 414 19 PDB MOLECULE: PUTATIVE AMIDOHYDROLASE;
6: 4c5y-A 28.4 3.2 323 436 16 PDB MOLECULE: OCHRATOXINASE;
7: 2uz9-A 28.4 3.1 320 444 16 PDB MOLECULE: GUANINE DEAMINASE;
8: 1j6p-A 28.1 2.8 315 407 16 PDB MOLECULE: METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF
9: 2oof-A 28.1 2.9 325 403 18 PDB MOLECULE: 4-IMIDAZOLONE-5-PROPANOATE AMIDOHYDROLASE;
10: 4cqb-A 27.6 2.6 311 402 17 PDB MOLECULE: N-ISOPROPYLAMMELIDE ISOPROPYL AMIDOHYDROLASE;
11: 1k6w-A 26.7 3.5 319 423 16 PDB MOLECULE: CYTOSINE DEAMINASE;
12: 4rdv-B 24.9 3.3 317 451 13 PDB MOLECULE: N-FORMIMINO-L-GLUTAMATE IMINOHYDROLASE;
13: 3ooq-A 24.5 3.0 277 384 20 PDB MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;
14: 2vun-A 23.7 3.0 284 385 16 PDB MOLECULE: ENAMIDASE;
15: 3giq-A 23.6 3.5 294 475 17 PDB MOLECULE: N-ACYL-D-GLUTAMATE DEACYLASE;
16: 1onx-A 23.0 3.2 289 390 16 PDB MOLECULE: ISOASPARTYL DIPEPTIDASE;
17: 1yrr-B 22.8 3.3 283 334 18 PDB MOLECULE: N-ACETYLGLUCOSAMINE-6-PHOSPHATE DEACETYLASE;
18: 1gkp-A 22.7 3.2 296 458 17 PDB MOLECULE: HYDANTOINASE;
19: 3e74-A 22.6 3.3 282 429 18 PDB MOLECULE: ALLANTOINASE;
20: 3gri-A 22.1 3.3 288 422 19 PDB MOLECULE: DIHYDROOROTASE;
21: 4b3z-D 21.9 3.6 300 477 15 PDB MOLECULE: DIHYDROPYRIMIDINASE-RELATED PROTEIN 1;
22: 3nqb-A 21.7 3.3 280 587 16 PDB MOLECULE: ADENINE DEAMINASE 2;
23: 2imr-A 21.0 5.6 279 380 17 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN DR_0824;
24: 2ogj-A 20.3 3.8 274 379 18 PDB MOLECULE: DIHYDROOROTASE;
25: 1a4m-A 17.7 3.4 264 349 15 PDB MOLECULE: ADENOSINE DEAMINASE;
26: 1a5k-C 17.2 3.4 279 566 16 PDB MOLECULE: UREASE (GAMMA SUBUNIT);
27: 2y1h-B 16.6 2.9 215 265 17 PDB MOLECULE: PUTATIVE DEOXYRIBONUCLEASE TATDN3;
28: 2ffi-A 15.3 3.6 219 273 15 PDB MOLECULE: 2-PYRONE-4,6-DICARBOXYLIC ACID HYDROLASE, PUTATIV
29: 3cjp-A 15.2 2.9 201 262 16 PDB MOLECULE: PREDICTED AMIDOHYDROLASE, DIHYDROOROTASE FAMILY;
30: 3gg7-A 15.1 3.1 204 243 15 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED METALLOPROTEIN;
31: 4dlf-A 14.7 4.2 221 287 10 PDB MOLECULE: AMIDOHYDROLASE 2;
32: 3pnu-A 14.6 3.9 239 338 16 PDB MOLECULE: DIHYDROOROTASE;
33: 2ob3-A 14.5 3.7 222 329 13 PDB MOLECULE: PARATHION HYDROLASE;
34: 1bf6-A 14.3 3.7 219 291 13 PDB MOLECULE: PHOSPHOTRIESTERASE HOMOLOGY PROTEIN;
35: 3irs-A 14.2 3.5 210 281 10 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN BB4693;
36: 3k2g-B 14.2 4.1 227 358 12 PDB MOLECULE: RESINIFERATOXIN-BINDING, PHOSPHOTRIESTERASE-
37: 2vc5-A 13.7 4.0 222 314 14 PDB MOLECULE: ARYLDIALKYLPHOSPHATASE;
38: 4mup-B 13.6 3.4 220 286 13 PDB MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;
39: 4hk5-D 13.4 3.7 230 380 14 PDB MOLECULE: URACIL-5-CARBOXYLATE DECARBOXYLASE;
40: 2a3l-A 13.3 3.7 275 616 8 PDB MOLECULE: AMP DEAMINASE;
41: 1v77-A 13.1 3.4 178 202 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1877;
42: 2dvt-A 12.7 3.3 205 325 12 PDB MOLECULE: THERMOPHILIC REVERSIBLE GAMMA-RESORCYLATE DECARBO
43: 4ofc-A 12.6 4.1 217 335 15 PDB MOLECULE: 2-AMINO-3-CARBOXYMUCONATE-6-SEMIALDEHYDE DECARBOX
44: 3qy6-A 12.5 3.6 188 247 10 PDB MOLECULE: TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE YWQE;
45: 4qrn-A 12.2 3.5 211 352 8 PDB MOLECULE: 5-CARBOXYVANILLATE DECARBOXYLASE;
46: 1itq-A 12.2 3.9 223 369 12 PDB MOLECULE: RENAL DIPEPTIDASE;
47: 2gwg-A 12.0 4.2 225 329 13 PDB MOLECULE: 4-OXALOMESACONATE HYDRATASE;
48: 4dzi-C 11.1 4.4 209 388 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE TIM-BARREL METAL-DEPENDENT HYDROLASE;
49: 2qpx-A 11.0 4.4 220 376 11 PDB MOLECULE: PREDICTED METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF THE TIM-BA
50: 1j5s-A 9.7 3.8 216 451 14 PDB MOLECULE: URONATE ISOMERASE;
51: 3iac-A 9.6 3.6 206 469 13 PDB MOLECULE: GLUCURONATE ISOMERASE;
52: 3f2b-A 9.1 8.3 181 994 8 PDB MOLECULE: DNA-DIRECTED DNA POLYMERASE III ALPHA CHAIN;
53: 3dcp-A 9.0 3.3 165 277 11 PDB MOLECULE: HISTIDINOL-PHOSPHATASE;
54: 3au2-A 8.6 8.3 178 575 15 PDB MOLECULE: DNA POLYMERASE BETA FAMILY (X FAMILY);
55: 1m65-A 7.5 3.8 163 234 10 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCDX;
56: 2yb1-A 5.1 4.0 149 284 11 PDB MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;
57: 2anu-A 4.4 3.8 135 224 13 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0559;
58: 3e38-A 4.2 3.9 144 342 10 PDB MOLECULE: TWO-DOMAIN PROTEIN CONTAINING PREDICTED PHP-LIKE
59: 1bks-A 4.1 4.2 145 255 4 PDB MOLECULE: TRYPTOPHAN SYNTHASE;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=3icjA Sbjct=3icjA Z-score=66.0
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DSSP LEEEEELLEEEEEELLEEEELEEEEELLEEEEEELHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLEEEE Query CMKALINGTIYTSFSPVKKVSGLVISNERVLYAGDSSTALRIAELAGGEIIDLKGKFVMP 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct CMKALINGTIYTSFSPVKKVSGLVISNERVLYAGDSSTALRIAELAGGEIIDLKGKFVMP 60 DSSP LEEEEELLEEEEEELLEEEELEEEEELLEEEEEELHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLEEEE DSSP LEEEEEELHHHHHHHHHLEELLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELHHHHLLLLLHHH Query AFFDSHLHLDELGMSLEMVDLRGVKSMEELVERVKKGRGRIIFGFGWDQDELGRWPTRED 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct AFFDSHLHLDELGMSLEMVDLRGVKSMEELVERVKKGRGRIIFGFGWDQDELGRWPTRED 120 DSSP LEEEEEELHHHHHHHHHLEELLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELHHHHLLLLLHHH DSSP HLLLLLLEEEEELLLLEEEELHHHHHHHLLLLLLLEELLLLEEEHHHHHHHHHHHHHLLL Query LDVIDRPVFLYRRCFHVAVMNSKMIDLLNLKPSKDFDESTGIVRERALEESRKIINEKIL 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct LDVIDRPVFLYRRCFHVAVMNSKMIDLLNLKPSKDFDESTGIVRERALEESRKIINEKIL 180 DSSP HLLLLLLEEEEELLLLEEEELHHHHHHHLLLLLLLEELLLLEEEHHHHHHHHHHHHHLLL DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELHHHHH Query TVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGEKALKALFELEREGRLKMNVFAYLSPELLD 240 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct TVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGEKALKALFELEREGRLKMNVFAYLSPELLD 240 DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELHHHHH DSSP HHHHHLLLLEELLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHH Query KLEELNLGKFEGRRLRIWGVXLFVDGSLGARTALLSEPYTDNPTTSGELVMNKDEIVEVI 300 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct KLEELNLGKFEGRRLRIWGVXLFVDGSLGARTALLSEPYTDNPTTSGELVMNKDEIVEVI 300 DSSP HHHHHLLLLEELLLEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHH DSSP HHHLLLLLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEL Query ERAKPLGLDVAVHAIGDKAVDVALDAFEEAEFSGRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQ 360 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ERAKPLGLDVAVHAIGDKAVDVALDAFEEAEFSGRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQ 360 DSSP HHHLLLLLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEL DSSP LLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL Query PHFIVSDWWIVNRVGEERAKWAYRLKTLSSITKLGFSTDSPIEPADPWVSIDAAVNRYVV 420 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct PHFIVSDWWIVNRVGEERAKWAYRLKTLSSITKLGFSTDSPIEPADPWVSIDAAVNRYVV 420 DSSP LLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL DSSP LHHHLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLL Query DPGERVSREEALHLYTHGSAQVTLAEDLGKLERGFRAEYIILDRDPLK 468 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct DPGERVSREEALHLYTHGSAQVTLAEDLGKLERGFRAEYIILDRDPLK 468 DSSP LHHHLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLL
DSSP -LEEEEELLEEEeEELLEEEE--LEEEEELLEEEEEELHHhhHHHHhhHLLEEEELLLLE Query -CMKALINGTIYtSFSPVKKV--SGLVISNERVLYAGDSStaLRIAelAGGEIIDLKGKF 57 ident || | | | | || || | Sbjct aEIKAVSAARLL-DVASGKYVdnPLVIVTDGRITSIGKKG--DAVP--AGATAVDLPGVT 55 DSSP lLEEEEEEEEEE-ELLLLEEEelEEEEEELLEEEEEEELL--LLLL--LLLEEEEEEEEE DSSP EEELEEEEEELHHHhhHHHHleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllll Query VMPAFFDSHLHLDElgMSLEmvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwpt 117 ident | | | ||| Sbjct LLPGLIDMHVHLDS--LAEV---------------------------------------- 73 DSSP EEELEEEEEELLLL--LLLL---------------------------------------- DSSP hhhhlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhHHHHhh Query redldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesRKIIne 177 ident Sbjct -----------------------------------------------------gGYNS-- 78 DSSP -----------------------------------------------------lHHHH-- DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELHHH-HHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEL- Query KILTVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGEKA-LKALFELEREGRLKMNVFAYLS- 235 ident | | | Sbjct LEYSDRFWSVVQTANAKKTLEAGFTTVRNVGAADYDdVGLREAIDAGYVPGPRIVTAAIs 138 DSSP HHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLLLLHhHHHHHHHHLLLLLLLEEEELLLl DSSP -----------------------------------hHHHHHhhhhlllleellleeEEEE Query -----------------------------------pELLDKleelnlgkfegrrlrIWGV 260 ident | Sbjct fgatgghcdstffppsmdqknpfnsdspdearkavrTLKKY--------------gAQVI 184 DSSP eellllllllllllhhhllllllllllhhhhhhhhhHHHHL--------------lLLEE DSSP EEELLLLLLL--LLLLlllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLHH Query XLFVDGSLGA--RTALlsepytdnpttsgELVMNKDEIVEVIERAKPLGLDVAVHAIGDK 318 ident | | | | | | || || | Sbjct XICATGGVFSrgNEPG-------------QQQLTYEEMKAVVDEAHMAGIKVAAHAHGAS 231 DSSP EEELLLLLLLllLLLL-------------LLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLHH DSSP HHHHHHHHHhhhllLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELLLHHHH------------ Query AVDVALDAFeeaefSGRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQPHFIVS------------ 366 ident | | ||||||| | | Sbjct GIREAVRAG-----VDTIEHASLVDDEGIKLAVQKGAYFSMDIYNTDYtqaegkkngvle 286 DSSP HHHHHHHLL-----LLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEELLLLLHHHhhhhhhhhlllh DSSP -----LLLHhhhhhhhhhHHLL-LHHHHHH-HLLEEELLLLLLLL-LLHHHHHHHHHHll Query -----DWWIvnrvgeeraKWAY-RLKTLSS-ITKLGFSTDSPIEP-ADPWVSIDAAVNry 418 ident | | | || | | | | Sbjct dnlrkDRDI--------gELQReNFRKALKaGVKMVYGTDAGIYPhGDNAKQFAVMVR-- 336 DSSP hhhhhHHHH--------hHHHHhHHHHHHHhLLEEELLLLLLLLLlLLHHHHHHHHHH-- DSSP lllhhHLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-LLLLLLLLLLLLEEEELLLLLL--------- Query vvdpgERVSREEALHLYTHGSAQVTLAE-DLGKLERGFRAEYIILDRDPLK--------- 468 ident | | | | | | | ||| Sbjct -----YGATPLQAIQSATLTAAEALGRSkDVGQVAVGRYGDMIAVAGDPLAdvttlekpv 391 DSSP -----LLLLHHHHHHHLLHHHHHHHLLLlLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLLlhhhhhlll DSSP ------------- Query ------------- 468 ident Sbjct fvmkggavvkapx 404 DSSP eeeelleeeelll
DSSP lEEEEELL-EEEEEELLEEEE--LEEEEELLEEEEEELhhHHHHhhhHHLLEEEELLLLE Query cMKALING-TIYTSFSPVKKV--SGLVISNERVLYAGDssTALRiaeLAGGEIIDLKGKF 57 ident | | | | || | Sbjct -MILIRGLtRVITFDDQERELedADILIDGPKIVAVGK--DLSD---RSVSRTIDGRGMI 54 DSSP -LEEEEEEeEEELLLLLLLEEeeEEEEEELLEEEEEEL--LLLL---LLLLEEEELLLEE DSSP EEELEEEEEELHHHhHHHHhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllll Query VMPAFFDSHLHLDElGMSLemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwpt 117 ident | || || | | Sbjct ALPGLINSHQHLYE-GAMR----------------------------------------- 72 DSSP EEELEEEEEELHHH-HHHL----------------------------------------- DSSP hhhhlllllleeeeeLLLLeeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhHHHHHHHH- Query redldvidrpvflyrRCFHvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreralEESRKIIN- 176 ident Sbjct -------------aiPQLE---------------------rvtmaswlegvLTRSAGWWr 98 DSSP -------------llHHHL---------------------lllhhhhhhhhHHHHHHHHh DSSP hLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELH------HHHHHHHHHHhlLLLLLEE Query eKILTVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGE------KALKALFELEreGRLKMNV 230 ident | | | | | | Sbjct dGKFGPDVIREVARAVLLESLLGGITTVADQHLFFpgatadSYIDATIEAA--TDLGIRF 156 DSSP lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllllLHHHHHHHHH--HHHLLEE DSSP EEEELH--------------------HHHHHHhhHLLL--LEEL---LLEEeEEEE-EEL Query FAYLSP--------------------ELLDKLeeLNLG--KFEG---RRLRiWGVX-LFV 264 ident | | | | | | | Sbjct HAARSSmtlgkseggfcddlfvepvdRVVQHC--LGLIdqYHEPepfGMVR-IALGpCGV 213 DSSP EEEELLllllhhhlllllhhhlllhhHHHHHH--HHHHhhHLLLlllLLEE-EEELlLLL DSSP LllllllllllllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELL-------- Query DgslgartallsepytdnpttsgelVMNKDEIVEVIERAKPLGLDVAVHAIG-------- 316 ident | | Sbjct P------------------------YDKPELFEAFAQMAADYDVRLHTHFYEpldagmsd 249 DSSP L------------------------LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLllhhhhhh DSSP ----hHHHHHHHHHhhhHLLL--LEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELLLHHHHLLlh Query ----dKAVDVALDAfeeAEFS--GRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQPHFIVSDWwi 370 ident | || | | Sbjct hlygmTPWRFLEKH---GWASdrVWLAHAVVPPREEIPEFADAGVAIAHLIAPDLRMG-- 304 DSSP hhhllLHHHHHHHL---LLLLllEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELHHHHHHLL-- DSSP hhhhhhhhhhhLLLHHHHHH-HLLEEELLLLL--LLLLLHHHHHHHHHHLLLLLH----H Query vnrvgeerakwAYRLKTLSS-ITKLGFSTDSP--IEPADPWVSIDAAVNRYVVDP----G 423 ident || | | Sbjct ---------wgLAPIREYLDaGITVGFGTTGSasNDGGNLLGDLRLAALAHRPADpnepE 355 DSSP ---------llLLLHHHHHHlLLEEEELLLLLllLLLLLHHHHHHHHHHHLHHHLlllhH DSSP HLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELL----------LLLL----- Query ERVSREEALHLYTHGSAQVTLAEDLGKLERGFRAEYIILDR----------DPLK----- 468 ident | | | | ||| ||| || | | Sbjct KWLSARELLRMATRGSAECLGRPDLGVLEEGRAADIACWRLdgvdrvgvhdPAIGlimtg 415 DSSP HLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELllhhhlllllHHHHhhhll DSSP -------------------------------------- Query -------------------------------------- 468 ident Sbjct lsdraslvvvngqvlvenerpvladlerivanttalip 453 DSSP lllllleeeelleeeeelleellllhhhhhhhhhhhll
DSSP LEEEEELL-EEEEEEL-----LEEE-ELEEEEELLEEEEEElhhHHHHhhhHHLLEEEEL Query CMKALING-TIYTSFS-----PVKK-VSGLVISNERVLYAGdssTALRiaeLAGGEIIDL 53 ident | | | | | | | | | Sbjct PSTLIRNAaAIMTGGRgtaddPSRVpGPDIRIVGDTIDAIG---ALAP---RPGETIVDA 54 DSSP LEEEEELLlEELLLLLlllllLLLLlLLLEEEELLEEEEEL---LLLL---LLLLEEEEL DSSP LLLEEEELEEEEEELHHHhHHHHhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhl Query KGKFVMPAFFDSHLHLDElGMSLemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelg 113 ident || | || Sbjct TDCVIYPAWVNTHHHLFQ-SLLK------------------------------------- 76 DSSP LLLEEEELEELLLLLHHH-HHLL------------------------------------- DSSP llllhhhhlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhhh Query rwptredldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesrk 173 ident Sbjct ----------------------------------------------------------ge 78 DSSP ----------------------------------------------------------ll DSSP hHHHLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELH------HHHHHHHHHHhlLLLL Query iINEKiLTVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGE------KALKALFELEreGRLK 227 ident | | | ||| | Sbjct pFRAL-FDERRFRLAARIGLIELARSGCATVADHNYVYypgmpfDSSAILFEEA--EKLG 135 DSSP lLHHH-LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLllllllLHHHHHHHHH--HHLL DSSP LEEEEEELH---------------------HHHHHHhhHLLL--LEEL---LLEEeEEEE Query MNVFAYLSP---------------------ELLDKLeeLNLG--KFEG---RRLRiWGVX 261 ident | | Sbjct LRFVLLRGGatqtrqleadlptalrpetldAYVADI--ERLAarYHDAsprAMRR-VVMA 192 DSSP LEEEEEELLllllllllllllhhhllllhhHHHHHH--HHHHhhLLLLlllLLEE-EEEL DSSP E-ELLLlllllllllllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELlhHHH Query L-FVDGslgartallsepytdnpttsgelVMNKDEIVEVIERAKPLGLDVAVHAIgdKAV 320 ident | | | | ||| | | Sbjct PtTVLY-----------------------SISPREMRETAAVARRLGLRMHSHLSgkSPV 229 DSSP LlLLLL-----------------------LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLllLHH DSSP HHHHHHhhhHLLL--LEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELLLHHHHLllhhhhhhhhh Query DVALDAfeeAEFS--GRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQPHFIVSDwwivnrvgeer 378 ident | | | | Sbjct AFCGEH---DWLGsdVWYAHLVKVDADEIALLAQTGTGVAHCPQSNGRL----------- 275 DSSP HHHHHL---LLLLllEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELHHHHHLL----------- DSSP hhhllLHHHHHH-HLLEEELLLLL--LLLLLHHHHHHHHHHLLlLLHHhlLLHHHHHHHL Query akwayRLKTLSS-ITKLGFSTDSP--IEPADPWVSIDAAVNRYvVDPGerVSREEALHLY 435 ident | | || | | | Sbjct -----PVREMADaGVPVSIGVDGAasNEAADMISEVHMTWLAQ-RARL--ASIAEVIHWG 327 DSSP -----LLLLHHHhLLLEEELLLHHhhLLLLLHHHHHHHHHHHH-HHLL--LLHHHHHHHH DSSP LHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELL----------LLLL----------------- Query THGSAQVTLAEDLGKLERGFRAEYIILDR----------DPLK----------------- 468 ident | | | | || | | Sbjct TAGGARVMGLDEVGKVAVGYAADIAVYRLddpryfglhdPAIGpvasggrpsvmalfsag 387 DSSP LHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELllhhhlllllHHHHhhhllllleeeeeeell DSSP ---------------------------------- Query ---------------------------------- 468 ident Sbjct krvvvddliegvdikelggearrvvrellrevvv 421 DSSP eeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP -LEEEEELLEEEeEELLEEEE--LEEEEELLEEEEEELHHHhhhHHHHhlLEEEELLLLE Query -CMKALINGTIYtSFSPVKKV--SGLVISNERVLYAGDSSTalrIAELagGEIIDLKGKF 57 ident || | | || ||| Sbjct lTTFLFRNGALL-DPDHPDLLqgFEILIEDGFIREVSDKPI---KSSN--AHVIDVKGKT 54 DSSP lLEEEEEEEEEL-LLLLLLLEeeEEEEEELLEEEEEELLLL---LLLL--LEEEELLLLE DSSP EEELEEEEEELHHHHhhhhhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllll Query VMPAFFDSHLHLDELgmslemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwpt 117 ident || | | | Sbjct IMPGLIDLHVHVVAI--------------------------------------------- 69 DSSP EEELEEEEEELLLLL--------------------------------------------- DSSP hhhhlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhHHHHHh Query redldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesRKIINe 177 ident Sbjct ---------------------------------------------------efnLPRVA- 77 DSSP ---------------------------------------------------lllHHHHL- DSSP lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEELhhHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEL-- Query kILTVKDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVGekALKALFELEREGRLKMNVFAYLS-- 235 ident | | | | | | Sbjct -TLPNVLVTLRAVPIMRAMLRRGFTTVRDAGGA--GYPFKQAVESGLVEGPRLFVSGRal 134 DSSP -LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLL--LHHHHHHHHLLLLLLLEEEELLLee DSSP ---------------------------------------------hHHHHHhhhhlllle Query ---------------------------------------------pELLDKleelnlgkf 250 ident | | Sbjct sqtgghadprarsdymppdspcgccvrvgalgrvadgvdevrravrEELQM--------- 185 DSSP elllllllllllllllllllllllllllllleeelllhhhhhhhhhHHHHH--------- DSSP ellleeEEEEEEELLLLLLL--LLLLlllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLL Query egrrlrIWGVXLFVDGSLGA--RTALlsepytdnpttsgELVMNKDEIVEVIERAKPLGL 308 ident | | ||| | | Sbjct -----gADQIXIMASGGVASptDPVG-------------VFGYSEDEIRAIVAEAQGRGT 227 DSSP -----lLLLEEEELLLLLLLllLLLL-------------LLLLLHHHHHHHHHHHHLLLL DSSP EEEEEELLHHHHHHHHHHHhhhllLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEEELLLHHHHLL Query DVAVHAIGDKAVDVALDAFeeaefSGRIEHASLVRDDQLERIKELKVRISAQPHFIVSDW 368 ident | || | | ||| | | | Sbjct YVLAHAYTPAAIARAVRCG-----VRTIEHGNLIDDETARLVAEHGAYVVPTLVTYDALA 282 DSSP LEEEEELLHHHHHHHHHLL-----LLEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLEEELLHHHHHHHH DSSP --------------LHHHhhhhhhHHHLL-LHHHHHH-HLLEEELLLLL---LLLLLhhH Query --------------WIVNrvgeerAKWAY-RLKTLSS-ITKLGFSTDSP---IEPADpwV 409 ident | | || || Sbjct segekyglppesiaKIAD-----vHGAGLhSIEIMKRaGVKMGFGTDLLgeaQRLQS--D 335 DSSP hhlllllllhhhhlLHHH-----hHLLHHhHHHHHHHhLLLLLLLLLLLhhhHHHLL--H DSSP HHHHHHHlllllhhhLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-LLLLLLLLLLLLEEEELLLLLL Query SIDAAVNryvvdpgeRVSREEALHLYTHGSAQVTLAE-DLGKLERGFRAEYIILDRDPLK 468 ident | | | || | || | | | ||| Sbjct EFRILAE--------VLSPAEVIASATIVSAEVLGMQdKLGRIVPGAHADVLVVDGNPLK 387 DSSP HHHHHHL--------LLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLlLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLL DSSP --------------------------- Query --------------------------- 468 ident Sbjct svdcllgqgehiplvmkdgrlfvnele 414 DSSP llllllllllllleeeelleeeeelll
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DSSP leEEEELLEEEEEEllEEEE-LEEEEELLEEEEEELHHhhhHHHHhhLLEEEELLLLEEE Query cmKALINGTIYTSFspVKKV-SGLVISNERVLYAGDSStalRIAElaGGEIIDLKGKFVM 59 ident || | | | || | | | Sbjct --YALTQGRIFTGH--EFLDdHAVVIADGLIKSVCPVA---ELPP--EIEQRSLNGAILS 51 DSSP --LEEELLEEELLL--LEELlEEEEEELLEEEEEEEHH---HLLL--LLLEEELLLLEEE DSSP ELEEEEEELHhhHHHHhhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllllhh Query PAFFDSHLHLdeLGMSlemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwptre 119 ident | | | | | Sbjct PGFIDVQLNG--CGGV-------------------------------------------- 65 DSSP ELEEEEEELE--ELLE-------------------------------------------- DSSP hhlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhhhhhhhlL Query dldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesrkiinekI 179 ident Sbjct -------------------------------------------------------qfndT 70 DSSP -------------------------------------------------------elllL DSSP LLHhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEE------LHHHHHHHHHHHhlLLLL-LEEEE Query LTVkDYKHYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSV------GEKALKALFELEreGRLK-MNVFA 232 ident | | | | Sbjct AEA-VSVETLEIMQKANEKSGCTNYLPTLIttsdelMKQGVRVMREYL--AKHPnQALGL 127 DSSP LLL-LLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEELlllhhhHHHHHHHHHHHH--HHLLlLLLLE DSSP EELHH-----HHHHHhhhlLLLEellleEEEEEEEELlllllllllllllllllllllll Query YLSPE-----LLDKLeelnLGKFegrrlRIWGVXLFVdgslgartallsepytdnpttsg 287 ident | | | | | | | Sbjct HLEGPwlnaaLVDFL---cENAD-----VITKVTLAP----------------------- 156 DSSP EEELLllllhHHHHH---hHLHH-----HEEEEEELH----------------------- DSSP llllLHHHhHHHHHHHLLLLLEEEEEEllhHHHH-HHHHHHHhhLLLLEEEELL--LLLH Query elvmNKDEiVEVIERAKPLGLDVAVHAigdKAVD-VALDAFEeaEFSGRIEHAS--LVRD 344 ident ||| | | | | | | Sbjct ----EMVP-AEVISKLANAGIVVSAGH--sNATLkEAKAGFR--AGITFATHLYnaMPYI 207 DSSP ----HHLL-HHHHHHHHHHLLEEEELL--lLLLHhHHHHHHH--HLEEEELLLLllLLLL DSSP H-----hHHHHHHH-LLEEEELLLhHHHLllhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHL--LEEE Query D-----qLERIKEL-KVRISAQPHfIVSDwwivnrvgeerakwayRLKTLSSIT--KLGF 396 ident | || Sbjct TgrepglAGAILDEaDIYCGIIAD-GLHV-------------dyaNIRNAKRLKgdKLCL 253 DSSP LllllhhHHHHHHLlLLEEEEELL-LLLL-------------lhhHHHHHHHHHhhHEEE DSSP LLLLL-LLLLLHHHHHHHHHHLllllhhHLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-LLLLLLLL Query STDSP-IEPADPWVSIDAAVNRyvvdpgERVSREEALHLYTHGSAQVTLAE-DLGKLERG 454 ident || | | | | | | || | | Sbjct VTDATsGSSLTMIEGVRNLVEH------CGIALDEVLRMATLYPARAIGVEkRLGTLAAG 307 DSSP ELLLLlLLLLLHHHHHHHHHHH------HLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLLLLLLL DSSP LLLLEEEELLLL-------------ll Query FRAEYIILDRDP-------------lk 468 ident | | Sbjct KVANLTAFTPDFkitktivngnevvtq 334 DSSP LLLLEEEELLLLleeeeeelleeeeel
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