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The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 2yb1-A 53.1 0.0 284 284 100 PDB MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;
2
DSSP LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEE Query ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHDCTGGLAEAAAAAARRGIPFLN 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHDCTGGLAEAAAAAARRGIPFLN 60 DSSP LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEE DSSP EEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHH Query GVEVSVSWGRHTVHIVGLGIDPAEPALAAGLKSIREGRLERARQMGASLEAAGIAGCFDG 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct GVEVSVSWGRHTVHIVGLGIDPAEPALAAGLKSIREGRLERARQMGASLEAAGIAGCFDG 120 DSSP EEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHH DSSP HHLLLLLHHHLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH Query AMRWCDNPEMISRTHFARHLVDSGAVKDMRTVFRKYLTPGKPGYVSHQWASLEDAVGWIV 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct AMRWCDNPEMISRTHFARHLVDSGAVKDMRTVFRKYLTPGKPGYVSHQWASLEDAVGWIV 180 DSSP HHLLLLLHHHLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHH DSSP HLLLEEEELLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHHLL Query GAGGMAVIAHPGRYDMGRTLIERLILDFQAAGGQGIEVASGSHSLDDMHKFALHADRHGL 240 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct GAGGMAVIAHPGRYDMGRTLIERLILDFQAAGGQGIEVASGSHSLDDMHKFALHADRHGL 240 DSSP HLLLEEEELLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHHLL DSSP EEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHLHHHLLLLLHHHL Query YASSGSDFHAPGEDVGHTEDLPPICRPIWRELEARILRPADAEN 284 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct YASSGSDFHAPGEDVGHTEDLPPICRPIWRELEARILRPADAEN 284 DSSP EEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHLHHHLLLLLHHHL
DSSP -----------------LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL---- Query -----------------ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD---- 39 ident | | || ||| || | | || | Sbjct aqrrneiqvpdldgyttLKCDFHXHSVFSDGLVWPTVRVDEAYRDGLDAISLTEHIeyrp 60 DSSP llllllllllllllleeEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEELLEEELllll DSSP --------LLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEEEEllEEEEEEEELLLLllhhhHHHH Query --------CTGGLAEAAAAAARRGIPFLNGVEVSVSWgrHTVHIVGLGIDPaepalAAGL 91 ident | || | | | Sbjct hkqdvvsdHNRSFDLCREQAEKLGILLIKGSEITRAX--APGHFNAIFLSD----sNPLE 114 DSSP llllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLEELLEEEEELLL--LLLEEEEELLLL----lHHHL DSSP HHhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhh Query KSiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrt 151 ident Sbjct QK---------------------------------------------------------- 116 DSSP LL---------------------------------------------------------- DSSP hhhhlllllllllllllllLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHH--LLLLHhHHHHHHHHHH Query vfrkyltpgkpgyvshqwaSLEDAVGWIVGAGGMAVIAHPGR--YDMGRtLIERLILDFQ 209 ident || | ||| Sbjct -------------------DYKDAFREAKKQGAFXFWNHPGWdsQQPDTtKWWPEHTALY 157 DSSP -------------------LHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLllLLLLLlLLLHHHHHHH DSSP HLLL-LEEEEEELLLLhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLL--LLLL------lllLLLL Query AAGG-QGIEVASGSHSlddMHKFALHADRHGLYASSGSDFH--APGE------dvgHTED 260 ident | ||||| | | || | Sbjct QEGCxHGIEVANGHLY---XPEAIQWCLDKNLTXIGTSDIHqpIQTDydfekgehrTXTF 214 DSSP HLLLlLEEEEEELLEE---LLHHHHHHHHHLLEEEEELLLLllHHHHllhhhllllLEEE DSSP ---------------------------LLLL----------------------------- Query ---------------------------LPPI----------------------------- 264 ident | Sbjct vfakerslqgirealdnrrtaayfhelLIGRedllrpffekcvkieevsrneqgvtlsit 274 DSSP eeellllhhhhhhhhhllleeeeelleEELLhhhhhhhhhhheeeeeeeeelleeeeeee DSSP ------------------------------------------------lllhhhhlhhhl Query ------------------------------------------------crpiwreleari 276 ident Sbjct nvtdlvlklkktahdtllvyfrdxtlkphtrytvrigfkqgikggdvnfevtnfivapdk 334 DSSP ellllleeeeelllllleellleeeellleeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeeelle DSSP llllhhhl Query lrpadaen 284 ident Sbjct glkytisl 342 DSSP eeeeeeel
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vrrletiveeerrvvvqgyvfdaevselksgrtlltmkitdytnsilvkmfsrdkedael 60 DSSP lllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeelllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------LLEELLLLLLLL Query ------------------------------------------------ANIDLHFHSRTS 12 ident || | | Sbjct msgvkkgmwvkvrgsvqndtfvrdlviiandlneiaanerqdtapegeKRVELHLHTPMS 120 DSSP hhlllllleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeelllllllllllllLLLLLLLLLLLL DSSP --LLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEEEELl Query --DGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHDCTGGLAEAAAAAARRGIPFLNGVEVSVSWGr 70 ident | | | | | ||| || || | | | Sbjct qmDAVTSVTKLIEQAKKWGHPAIAVTDHAVVQSFPEAYSAAKKHGMKVIYGLEANIVDD- 179 DSSP llLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEEELL- DSSP eEEEEEEELL---LLLLhhHHHHHHHHHLL-HHHHhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllll Query hTVHIVGLGI---DPAEpaLAAGLKSIREG-RLERarqmgasleaagiagcfdgamrwcd 126 ident | | | Sbjct -PFHVTLLAQnetGLKN--LFKLVSLSHIQyFHRV------------------------- 211 DSSP -LEEEEEEELlhhHHHH--HHHHHHHHHLLlLLLL------------------------- DSSP lhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllllllllllLLLHHHHHHHhhHLLLEE Query npemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvshqWASLEDAVGWivGAGGMA 186 ident | | Sbjct -----------------------------------------pRIPRSVLVKH--RDGLLV 228 DSSP -----------------------------------------lLEEHHHHHHL--LLLEEE DSSP EELL----HHHLlllhhhHHHHHHhhhhlLLLEEEeEELL------------lLHHHHHH Query VIAH----PGRYdmgrtlIERLILdfqaaGGQGIEvASGS------------hSLDDMHK 230 ident | | Sbjct GSGCdkgeLFDN------VEDIAR-----FYDFLE-VHPPdvykplyvkdeemIKNIIRS 276 DSSP ELLLllllLLLL------LLLLHH-----HLLLEE-ELLHhhhlllllllhhhHHHHHHH DSSP HHHHHHHHLLEEEEELLLLLLLL---------------------------LLLL------ Query FALHADRHGLYASSGSDFHAPGE---------------------------DVGH------ 257 ident | Sbjct IVALGEKLDIPVVATGNVHYLNPedkiyrkilihsqgganplnrhelpdvYFRTtnemld 336 DSSP HHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLHhhhhhhhhhhhllhhhlllllllllllLLLLhhhhhh DSSP -----llllLLLL-----lLHHHHLhhHLLL----------------------------- Query -----tedlPPIC-----rPIWRELeaRILR----------------------------- 278 ident | Sbjct cfsflgpekAKEIvvdntqKIASLI--GDVKpikdelytpriegadeeiremsyrrakei 394 DSSP hhhhhhhhhHHHHhlhhhhHHHHLL--LLLLlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct ygdplpklveerlekelksiighgfaviylishklvkkslddgylvgsrgsvgssfvatm 454 DSSP hlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelhhhhhlhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct teitevnplpphyvcpnckhseffndgsvgsgfdlpdkncprcgtkykkdghdipfetfl 514 DSSP llllllllllleeelllllleeellllllllhhhllllllllllllleeellllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct gfkgdkvpdidlnfsgeyqprahnytkvlfgednvyragtigtvadktaygfvkayasdh 574 DSSP llllllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct nlelrgaeidrlaagctgvkrttgqhpggiivvpdymeiydftpiqypaddtssewrtth 634 DSSP lllllhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeellllllhhhllleelhhhllllllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct fdfhsihdnllkldilghddptvirmlqdlsgidpktiptddpdvmgifssteplgvtpe 694 DSSP eehhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhlllllhhhlllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct qimcnvgtigipefgtrfvrqmleetrpktfselvqisglshgtdvwlgnaqeliqngtc 754 DSSP hhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct tlsevigcrddimvyliyrglepslafkimesvrkgkgltpefeaemrkhdvpewyidsc 814 DSSP lhhhllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhllllhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct kkikymfpkahaaayvlmavriayfkvhhpllyyasyftvraedfdldamikgsaairkr 874 DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 278 ident Sbjct ieeinakgiqatakekslltvlevalemcergfsfknidlyrsqatefvidgnslippfn 934 DSSP hhhhhhlhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllllleeelleeellhh DSSP ------------------------------------------------------llhhhl Query ------------------------------------------------------padaen 284 ident Sbjct aipglgtnvaqaivrareegeflskedlqqrgklsktlleylesrgcldslpdhnqlslf 994 DSSP hlllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllllllllllllll
DSSP ---LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL------------------ Query ---ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD------------------ 39 ident | | | ||| | || | ||| Sbjct tewLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIvdrrtleqrkrngeplga 60 DSSP leeEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEelhhhhhhhhhlllllll DSSP --------lLLLHHHHHHHHHH-LLLLEEEEEEEEEEelLEEEEEEEELLLlllhhhHHH Query --------cTGGLAEAAAAAAR-RGIPFLNGVEVSVSwgRHTVHIVGLGIDpaepalAAG 90 ident | | | ||| ||| Sbjct itedkfqdyLKRLWREQKRAWEeYGXILIPGVEITNN--TDLYHIVAVDVK------EYV 112 DSSP lllllhhhhHHHHHHHHHHHHHhHLLEEEEEEEEEEL--LLLEEEEEELLL------LLL DSSP Hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhh Query Lksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmr 150 ident Sbjct D----------------------------------------------------------- 113 DSSP L----------------------------------------------------------- DSSP hhhhhlllllllllllllLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHH-LLLLhhhHHHHhHHHH Query tvfrkyltpgkpgyvshqWASLEDAVGWIVGAGGMAVIAHPGR-YDMGrtlIERLiLDFQ 209 ident | | ||| | | Sbjct -----------------pSLPVEEIVEKLKEQNALVIAAHPDRkKLSW-ylWANX-ERFK 154 DSSP -----------------lLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLlLLLL-hhHHLL-LLLL DSSP HlLLLEEEEEELLLLhhhHHHHHHHHhhhlLEEEEELLLLLLLLLlllLLLLllllllhh Query AaGGQGIEVASGSHSlddMHKFALHAdrhgLYASSGSDFHAPGEDvghTEDLppicrpiw 269 ident | | |||| Sbjct D-TFDAWEIANRDDL---FNSVGVKK----YRYVANSDFHELWHVyswKTLV-kseknie 205 DSSP L-LLLEEEEEELLEE---LHHHHHLL----LLEEEELLLLLHHHHlleEEEE-eelllhh DSSP HHLH----hhlllllhhhl Query RELE----arilrpadaen 284 ident | Sbjct AIKEairkntdvaiylxrk 224 DSSP HHHHhhhhllleeeeelll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek 120 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv 180 DSSP hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl 240 DSSP leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriageteeev 300 DSSP eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelllhhhh DSSP ------------------------------------LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHH Query ------------------------------------ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDR 24 ident || || ||| | | Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpkllelpqVKGDLQVHSTYSDGQNTLEELWEA 360 DSSP hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllllhhhLLEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHH DSSP HHLLLLLEEEELLLL-------------llLLHHHHHHHHHHLLL-LEEEEEEEEEEELl Query AAARAPALLALTDHD-------------ctGGLAEAAAAAARRGI-PFLNGVEVSVSWGr 70 ident | || ||| | | | | || Sbjct AKTMGYRYLAVTDHSpavrvaggpspeealKRVGEIRRFNETHGPpYLLAGAEVDIHPD- 419 DSSP HHHHLLLEEEEEEELhhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEEEEELLLL- DSSP eeeeeeeellllllhHHHHHHhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhh Query htvhivglgidpaepALAAGLksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpem 130 ident Sbjct ----------gtldyPDWVLR--------------------------------------- 430 DSSP ----------lllllLHHHHL--------------------------------------- DSSP llhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllllllllllllLHHHhHHHHhhllleEEELL Query isrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvshqwaSLEDaVGWIvgaggmAVIAH 190 ident | || Sbjct ---------------eldlvlvsvhsrfnlpkadqtkrllKALE-NPFV------HVLAH 468 DSSP ---------------llleeeeellllllllhhhhhhhhhHHHL-LLLL------LEELL DSSP HHHL------LLLHhHHHHHHHHHHHlLLLEEEEeELLLL-hhHHHHHHHHHHHHLLEEE Query PGRY------DMGRtLIERLILDFQAaGGQGIEVaSGSHS-ldDMHKFALHADRHGLYAS 243 ident | | | | | | | || | Sbjct PTARllgrraPIEA-DWEAVFQKAKE-KGVAVEI-DGYYDrmdLPDDLARMAYGMGLWIS 525 DSSP LLLLllllllLLLL-LHHHHHHHHHH-HLLEEEE-ELLLLlllLLHHHHHHHHHLLLLEE DSSP EELLLLLLLLLllLLLL---LLLL-----lLLHHH----HLHHhlllllhhhl Query SGSDFHAPGEDvgHTED---LPPI-----cRPIWR----ELEArilrpadaen 284 ident | | | | | Sbjct LSTDAHQTDHL-rFMELavgTAQRawigpeRVLNTldyeDLLS--wlkarrgv 575 DSSP EELLLLLHHHH-hHHHHhhhHHHHllllllLLHHHllhhHHHH--hhhlllll
DSSP LLEELLLLLLLL-LLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL-----------LLLLHHHhh Query ANIDLHFHSRTS-DGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD-----------CTGGLAEaa 48 ident ||| | | | | | | | ||| Sbjct YPVDLHMHTVAStHAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGpdmedaphhwhFINMRIW-- 58 DSSP LLEELLLLLLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllllllllhhHHHHHHL-- DSSP hhhHHLLLLEEEEEEEEEEELLeeeeeeeellllllhhHHHHHhhhhllhhhhhhhhhhh Query aaaARRGIPFLNGVEVSVSWGRhtvhivglgidpaepaLAAGLksiregrlerarqmgas 108 ident | | | | Sbjct -prVVDGVGILRGIEANIKNVD------------geidCSGKM----------------- 88 DSSP -llEELLEEEEEEEEEELLLLL------------llllLLHHH----------------- DSSP hhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllllllllll Query leaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvshq 168 ident Sbjct ----------------------------------fdsldliiagfhepvfaphdkatntq 114 DSSP ----------------------------------hhhlleeeeellllllllllhhhhhh DSSP lllhhhhHHHHhhllleEEELLHHHL-LLLHhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEeELLLlhhH Query wasledaVGWIvgaggmAVIAHPGRY-DMGRtlIERLILDFQAaGGQGIEVaSGSHsldD 227 ident | | ||| | | Sbjct amiatiaSGNV------HIISHPGNPkYEID--VKAVAEAAAK-HQVALEI-NNSS---N 161 DSSP hhhhhhhLLLL------LEELLLLLLlLLLL--HHHHHHHHHH-HLLEEEE-ELLL---L DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLlllLLLLLLLL---LLLL-----LLHHH---HLHH-- Query MHKFALHADRHGLYASSGSDFHApgeDVGHTEDL---PPIC-----RPIWR---ELEA-- 274 ident | | ||| | | | | | Sbjct CREVAAAVRDAGGWVALGSDSHT-afTMGEFEEClkiLDAVdfppeRILNVsprRLLNfl 220 DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL-hhHLLLLHHHhhhHHHLlllhhHLHHHlhhHHHHhh DSSP ------hllLLLHhhl Query ------rilRPADaen 284 ident || Sbjct esrgmapiaEFAD--l 234 DSSP hhllllllhHHLL--l
DSSP LLEELLLLLLLL--LLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL------------------- Query ANIDLHFHSRTS--DGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD------------------- 39 ident | | | | | | Sbjct XKRDGHTHTEFCphGTHDDVEEXVLKAIELDFDEYSIVEHAplssefxkntagdkeavtt 60 DSSP LLEEEEELLLLLllLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELlllhhhhhllllllhhhhl DSSP ----------lLLLHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEEEEEelleeeeeeeellllLLHHHHH Query ----------cTGGLAEAAAAAARrGIPFLNGVEVSVSwgrhtvhivglgidpAEPALAA 89 ident | | || Sbjct asxaxsdlpyyFKKXNHIKKKYAS-DLLIHIGFEVDYL------igyedftrdFLNEYGP 113 DSSP llllhhhhhhhHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEEEEEELL------lllhhhhhhHHHHHHH DSSP hhhhhhllhhhhhhhHHHHhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllh Query glksiregrlerarqMGASleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdm 149 ident Sbjct --qtddgvlslhfleGQGG--------------------------------------frs 133 DSSP --hlleeeeelleeeELLE--------------------------------------eee DSSP hhHHHHLlLLLL------------lllllllllLHHHhhhhhhHLLLeEEELLHHHLL-- Query rtVFRKYlTPGK------------pgyvshqwaSLEDavgwivGAGGmAVIAHPGRYD-- 195 ident | | | Sbjct idFSAED-YNEGivqfyggfeqaqlaylegvkqSIEA---dlgLFKP-RRXGHISLCQkf 188 DSSP llLLHHH-HHHHlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhHHHL---lllLLLL-LEELLLLHHHll DSSP -------------lLHHHHHHHHHHHHHlLLLEEEeEELLLL-------hhHHHHHHHHH Query -------------mGRTLIERLILDFQAaGGQGIEvASGSHS-------ldDMHKFALHA 235 ident | | Sbjct qqffgedtsdfseeVXEKFRVILALVKK-RDYELD-FNTAGLfkplcgetyPPKKIVTLA 246 DSSP hhhhlllhhhllhhHHHHHHHHHHHHHH-HLLEEE-EELHHHhllllllllLLHHHHHHH DSSP HHHLLEEEEELLLLLLllLLLLLL-LLLLLLllhhhhlhhhlllllhhhl Query DRHGLYASSGSDFHAPgeDVGHTE-DLPPICrpiwrelearilrpadaen 284 ident ||| | | | Sbjct SELQIPFVYGSDSHGV-qDIGRGYsTYCQKL------------------e 277 DSSP HHLLLLEEEELLLLLH-hHLLLLHhHHHHHL------------------l
DSSP lLEELLLL--LLLLLLLLLhhHHHHHHHLLL---LLEEEELLLL--------llLLHHHH Query aNIDLHFH--SRTSDGALTptEVIDRAAARA---PALLALTDHD--------ctGGLAEA 47 ident || | | ||| | | | | | | Sbjct -MIDIHCHilPAMDDGAGDsaDSIEMARAAVrqgIRTIIATPHHnngvyknepaAVREAA 59 DSSP -LEELLLLllLLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHhllLLEEELLLEEllllllllhhHHHHHH DSSP HHHHHHL-----LLLEEEEEEEEEEelleeeeeeeellllllHHHHHHHhhhhllhhhhh Query AAAAARR-----GIPFLNGVEVSVSwgrhtvhivglgidpaePALAAGLksiregrlera 102 ident | | | | || Sbjct DQLNKRLikediPLHVLPGQEIRIY-------------geveQDLAKRQ----------- 95 DSSP HHHHHHHhhlllLLEEELLLEEELL-------------llhhHHHHLLL----------- DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllll Query rqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkp 162 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 95 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP lllllllllhhhhhhhhhhLLLE---------------------------EEELLHHHLL Query gyvshqwasledavgwivgAGGM---------------------------AVIAHPGRYD 195 ident ||||| | Sbjct --------------llslnDTKYiliefpfdhvpryaeqlfydlqlkgyiPVIAHPERNR 141 DSSP --------------lllhhHLLEeeeelllllllllhhhhhhhhhhllleEEEELHHHLH DSSP L---LHHHHHHHHHHHHhllllEEEEeELLL--------LHHHHHHHHHHHhhhlleEEE Query M---GRTLIERLILDFQaaggqGIEVaSGSH--------SLDDMHKFALHAdrhglyASS 244 ident | | Sbjct EireNPSLLYHLVEKGA-----ASQI-TSGSlagifgkqLKAFSLRLVEAN----liHFV 191 DSSP HhhhLLHHHHHHHHLLL-----EEEE-EHHHhlllllhhHHHHHHHHHHLL----llLEE DSSP ELLLLLLLLL--llllLLLL--------LLLLL--HHHHLHHH----lllllhhhl Query GSDFHAPGED--vghtEDLP--------PICRP--IWRELEAR----ilrpadaen 284 ident || | | Sbjct ASDAHNVKTRnfhtqeALYVlekefgseLPYMLteNAELLLRNqtifrqppqpvkr 247 DSSP ELLLLLLLLLlllhhhHHHHhhhhhllhHHHHHhhHHHHHHLLlllllllllllll
DSSP LLEELLLLLLlllLLLLHHHHHHHHHLLLLlEEEELLLLL--LLLHHHHHHHHhhllLLE Query ANIDLHFHSRtsdGALTPTEVIDRAAARAPaLLALTDHDC--TGGLAEAAAAAarrgIPF 58 ident || | | | | | | || Sbjct SLIDFHVHLD---LYPDPVAVARACEERQL-TVLSVTTTPaaWRGTLALAAGR----PHV 52 DSSP LLEEEEELHH---HLLLHHHHHHHHHHLLL-EEEELLLLHhhHHHHHHHHLLL----LLE DSSP EEE----------------------------EEEEEEelleeeeeeeellllllhhhhhh Query LNG----------------------------VEVSVSwgrhtvhivglgidpaepalaag 90 ident || Sbjct WTAlgfhpevvseraadlpwfdrylpetrfvGEVGLD----------------------- 89 DSSP EELllllhhhllllhhhlhhhhhhhhhlleeEEEELL----------------------- DSSP hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhh Query lksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmr 150 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 89 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhhhlllllLLLLLLL----LLLLhhHHHHH--hhHLLL-------------------- Query tvfrkyltpgKPGYVSH----QWASleDAVGW--ivGAGG-------------------- 184 ident | Sbjct --------gsPSLRGTWtqqfAVFQ--HILRRcedhGGRIlsihsrraesevlncleanp 139 DSSP --------llHHHHHHHhhhhHHHH--HHHHHhhhlLLEEeeeellllhhhhhhhhhhlh DSSP ---EEEELLHHhllLLHHHHHHHHHHHhhlllLEEEeEELLL-LHHHHHHHHHHHhhHLL Query ---MAVIAHPGrydMGRTLIERLILDFqaaggQGIEvASGSH-SLDDMHKFALHAdrHGL 240 ident | | | Sbjct rsgTPILHWYS---GSVTELRRAISLG-----CWFS-VGPTMvRTQKGAALIRSM--PRD 188 DSSP hheEEEEELLL---LLHHHHHHHHHLL-----LEEE-ELHHHhLLHHHHHHHHHL--LHH DSSP EEEEELLLL----lLLLL-LLLL---LLLLL------------llllHHHHLHHhlllll Query YASSGSDFH----aPGED-VGHT---EDLPP------------icrpIWRELEArilrpa 280 ident | | Sbjct RVLTETDGPfleldGQAAlPWDVksvVEGLSkiwqipaseverivkeNVSRLLG------ 242 DSSP HEEELLLLLlleelLEELlHHHHhhhHHHHHhhhlllhhhhhhhhhhHHHHHHH------ DSSP hhhl Query daen 284 ident Sbjct ---t 243 DSSP ---l
DSSP ----------------------------------------------------lLEELLLL Query ----------------------------------------------------aNIDLHFH 8 ident | | Sbjct alqtiinarlpgeeglwqihlqdgkisaidaqsgvmpitensldaeqglvippFVEPHIH 60 DSSP llleeeeellllllleeeeeeelleeeeeeeellllllllleeelllleeellEEEEEEL DSSP LllLLLL---------------------------------lLHHHHHHHHHLLLLLEEEE Query SrtSDGA---------------------------------lTPTEVIDRAAARAPALLAL 35 ident | Sbjct L--DTTQtagqpnwnqsgtlfegierwaerkallthddvkqRAWQTLKWQIANGIQHVRT 118 DSSP L--LLLLllllllllllllhhhhhhhhhllhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEE DSSP LLLL------lLLLHHHHHHHHHHlLLLEEEEEE-------------------------- Query TDHD------cTGGLAEAAAAAARrGIPFLNGVE-------------------------- 63 ident | | | Sbjct HVDVsdatltaLKAMLEVKQEVAP-WIDLQIVAFpqegilsypngealleealrlgadvv 177 DSSP EEELlllllhhHHHHHHHHHHHLL-LLEEEEEEEllllllllllhhhhhhhhhhllllee DSSP EEEEelleeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhl Query VSVSwgrhtvhivglgidpaepalaaglksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamr 123 ident Sbjct GAIP-------------------------------------------------------- 181 DSSP EELH-------------------------------------------------------- DSSP llllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllllllLLLLLL-lLHHHHHHHH-hH Query wcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgYVSHQW-aSLEDAVGWI-vG 181 ident || Sbjct -------------------------------------hfeFTREYGveSLHKTFALAqkY 204 DSSP -------------------------------------hhlLLHHHHhhHHHHHHHHHhhH DSSP LLL------------------------------EEEELLHHHL----llLHHHHHHHHHH Query AGG------------------------------MAVIAHPGRY----dmGRTLIERLILD 207 ident | || Sbjct DRLidvhcdeiddeqsrfvetvaalahhegmgaRVTASHTTAMhsyngaYTSRLFRLLKM 264 DSSP LLEeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhllhhHEEEEELHHHhhllhhHHHHHHHHHHH DSSP HHhlllLEEEEEELLLL------------HHHHhhHHHHHHHHLLEEEEELLLLLLLL-- Query FQaaggQGIEVASGSHS------------LDDMhkFALHADRHGLYASSGSDFHAPGE-- 253 ident | | | Sbjct SG----INFVANPLVNIhlqgrfdtypkrRGIT--RVKEMLESGINVCFGHDDVFDPWyp 318 DSSP HL----LEEEELHHHHHhhllllllllllLLLL--LHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLLll DSSP --LLLL--LLLLLL-----------------lllLHHH--HLHH---------------- Query --DVGH--TEDLPP-----------------icrPIWR--ELEA---------------- 274 ident | | Sbjct lgTANMlqVLHMGLhvcqlmgygqindglnlithHSARtlNLQDygiaagnsanliilpa 378 DSSP llLLLHhhHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhlhHHHHhlLLLLlllllllllleeeell DSSP ------------hllllLHHH-----------------------l Query ------------rilrpADAE-----------------------n 284 ident Sbjct engfdalrrqvpvrysvRGGKviastqpaqttvyleqpeaidykr 423 DSSP llhhhhhhhllllleeeELLEeeeellllleeeellleeeellll
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