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The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 2anu-A 45.6 0.0 224 224 100 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0559;
2
DSSP LEEEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELHHHHHHHHHLLLLLLL Query TEWLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVDRRTLEQRKRNGEPLGA 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct TEWLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVDRRTLEQRKRNGEPLGA 60 DSSP LEEEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELHHHHHHHHHLLLLLLL DSSP LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEEELLLLEEEEEELLLLLLLLLLLHHH Query ITEDKFQDYLKRLWREQKRAWEEYGXILIPGVEITNNTDLYHIVAVDVKEYVDPSLPVEE 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ITEDKFQDYLKRLWREQKRAWEEYGXILIPGVEITNNTDLYHIVAVDVKEYVDPSLPVEE 120 DSSP LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEEELLLLEEEEEELLLLLLLLLLLHHH DSSP HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLLLHHHHLLLLLLLLLLEEEEEELLEELHHHHHLLLLEE Query IVEKLKEQNALVIAAHPDRKKLSWYLWANXERFKDTFDAWEIANRDDLFNSVGVKKYRYV 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct IVEKLKEQNALVIAAHPDRKKLSWYLWANXERFKDTFDAWEIANRDDLFNSVGVKKYRYV 180 DSSP HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLLLHHHHLLLLLLLLLLEEEEEELLEELHHHHHLLLLEE DSSP EELLLLLHHHHLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL Query ANSDFHELWHVYSWKTLVKSEKNIEAIKEAIRKNTDVAIYLXRK 224 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ANSDFHELWHVYSWKTLVKSEKNIEAIKEAIRKNTDVAIYLXRK 224 DSSP EELLLLLHHHHLLEEEEEEELLLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL
DSSP --------------LEEEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEElhh Query --------------TEWLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVdrr 46 ident | |||| | ||| || | | | | || Sbjct aqrrneiqvpdldgYTTLKCDFHXHSVFSDGLVWPTVRVDEAYRDGLDAISLTEHIE--- 57 DSSP llllllllllllllLEEEEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEELLEEELL--- DSSP hhhhhhhllllllLLLL--llhHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLEEEEEEEEEELLLLEEEE Query tleqrkrngeplgAITE--dkfQDYLKRLWREQKRAWEeYGXILIPGVEITNNTDLYHIV 104 ident | | | || | ||| | Sbjct -------------YRPHkqdvvSDHNRSFDLCREQAEK-LGILLIKGSEITRAXAPGHFN 103 DSSP -------------LLLLlllllLLLLHHHHHHHHHHHH-HLLEELLEEEEELLLLLLEEE DSSP EELLLL-LLLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLL--lhhHHLL-LLLL--LLLL Query AVDVKE-YVDPSLPVEEIVEKLKEQNALVIAAHPDRKKLS--wylWANX-ERFK--DTFD 158 ident | | | | || | Sbjct AIFLSDsNPLEQKDYKDAFREAKKQGAFXFWNHPGWDSQQpdttkWWPEhTALYqeGCXH 163 DSSP EELLLLlHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLLlllllLLHHhHHHHhlLLLL DSSP EEEEEELLEELHHHHHLL----LLEEEELLLLLHH--------hhLLEEEEEEE-LLLHH Query AWEIANRDDLFNSVGVKK----YRYVANSDFHELW--------hvYSWKTLVKS-EKNIE 205 ident | || || | | | | Sbjct GIEVANGHLYXPEAIQWCldknLTXIGTSDIHQPIqtdydfekgeHRTXTFVFAkERSLQ 223 DSSP EEEEEELLEELLHHHHHHhhhlLEEEEELLLLLLHhhhllhhhllLLLEEEEEElLLLHH DSSP HHHHHHHHLlLEEEEELL------------------------------------------ Query AIKEAIRKNtDVAIYLXR------------------------------------------ 223 ident | || | | Sbjct GIREALDNR-RTAAYFHElligredllrpffekcvkieevsrneqgvtlsitnvtdlvlk 282 DSSP HHHHHHHLL-LEEEEELLeeellhhhhhhhhhhheeeeeeeeelleeeeeeeelllllee DSSP -----------------------------------------------------------l Query -----------------------------------------------------------k 224 ident Sbjct lkktahdtllvyfrdxtlkphtrytvrigfkqgikggdvnfevtnfivapdkglkytisl 342 DSSP eeelllllleellleeeellleeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeel
DSSP leeEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEelhhhhhhhhhlllllll Query tewLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIvdrrtleqrkrngeplga 60 ident | | | ||| | || | ||| Sbjct ---ANIDLHFHSRTSDGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD------------------ 39 DSSP ---LLEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL------------------ DSSP lllllhhhhHHHHHHHHHHHHHhHLLEEEEEEEEEEL--LLLEEEEEELLL------LLL Query itedkfqdyLKRLWREQKRAWEeYGXILIPGVEITNN--TDLYHIVAVDVK------EYV 112 ident | | | ||| ||| Sbjct --------cTGGLAEAAAAAAR-RGIPFLNGVEVSVSwgRHTVHIVGLGIDpaepalAAG 90 DSSP --------lLLLHHHHHHHHHH-LLLLEEEEEEEEEEelLEEEEEEEELLLlllhhhHHH DSSP L----------------------------------------------------------- Query D----------------------------------------------------------- 113 ident Sbjct Lksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmr 150 DSSP Hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhh DSSP -----------------lLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLlLLLL-hhHHLL-LLLL Query -----------------pSLPVEEIVEKLKEQNALVIAAHPDRkKLSW-ylWANX-ERFK 154 ident | | ||| | | Sbjct tvfrkyltpgkpgyvshqWASLEDAVGWIVGAGGMAVIAHPGR-YDMGrtlIERLiLDFQ 209 DSSP hhhhhlllllllllllllLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHH-LLLLhhhHHHHhHHHH DSSP L-LLLEEEEEELLEE---LHHHHHLL----LLEEEELLLLLHHHHlleEEEE-eelllhh Query D-TFDAWEIANRDDL---FNSVGVKK----YRYVANSDFHELWHVyswKTLV-kseknie 205 ident | | |||| Sbjct AaGGQGIEVASGSHSlddMHKFALHAdrhgLYASSGSDFHAPGEDvghTEDLppicrpiw 269 DSSP HlLLLEEEEEELLLLhhhHHHHHHHHhhhlLEEEEELLLLLLLLLlllLLLLllllllhh DSSP HHHHhhhhllleeeeelll Query AIKEairkntdvaiylxrk 224 ident | Sbjct RELE----arilrpadaen 284 DSSP HHLH----hhlllllhhhl
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek 120 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv 180 DSSP hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl 240 DSSP leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriageteeev 300 DSSP eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelllhhhh DSSP ---------------------------------leEEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHH Query ---------------------------------teWLLCDFHVHTNXSDGHLPLGEVVDL 27 ident | || ||| | | Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpkllelpQVKGDLQVHSTYSDGQNTLEELWEA 360 DSSP hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllllhhHLLEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHH DSSP HHHLLLLEEEEEEEEEL-HHHHhhhhhlllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLL Query FGKHGVDVVSITDHIVD-RRTLeqrkrngeplgaITEDKFQDYLKRLWREQKRAWeeyGX 86 ident | ||| | | Sbjct AKTMGYRYLAVTDHSPAvRVAG-----------gPSPEEALKRVGEIRRFNETHG---PP 406 DSSP HHHHLLLEEEEEEELHHhHLLL-----------lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL---LL DSSP EEEEEEEEEELLlleeeeeellLLLL-------------------llllLHHHHHHHHhh Query ILIPGVEITNNTdlyhivavdvKEYV-------------------dpslPVEEIVEKLke 127 ident | | | | Sbjct YLLAGAEVDIHP---dgtldypDWVLreldlvlvsvhsrfnlpkadqtkRLLKALENP-- 461 DSSP EEEEEEEEELLL---lllllllHHHHlllleeeeellllllllhhhhhhHHHHHHLLL-- DSSP llLEEEELL--LLLL--LLLLHhhHLLLLLLLLL----LEEEEEELL--EELH--HHHHL Query qnALVIAAH--PDRK--KLSWYlwANXERFKDTF----DAWEIANRD--DLFN--SVGVK 175 ident || | | | || Sbjct --FVHVLAHptARLLgrRAPIE--ADWEAVFQKAkekgVAVEIDGYYdrMDLPddLARMA 517 DSSP --LLLEELLllLLLLllLLLLL--LLHHHHHHHHhhhlLEEEEELLLllLLLLhhHHHHH DSSP L---LLEEEELLLLLHHHHLLE-----------------eEEEEelllHHHHHHHHhhll Query K---YRYVANSDFHELWHVYSW-----------------kTLVKseknIEAIKEAIrknt 215 ident | | | | Sbjct YgmgLWISLSTDAHQTDHLRFMelavgtaqrawigpervlNTLD----YEDLLSWL---- 569 DSSP HhllLLEEEELLLLLHHHHHHHhhhhhhhhhllllllllhHHLL----HHHHHHHH---- DSSP leeeeelll Query dvaiylxrk 224 ident Sbjct ---karrgv 575 DSSP ---hlllll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vrrletiveeerrvvvqgyvfdaevselksgrtlltmkitdytnsilvkmfsrdkedael 60 DSSP lllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeelllhhhhhh DSSP ---------------------------------------------lEEEEEEEEELLLLL Query ---------------------------------------------tEWLLCDFHVHTNXS 15 ident | || | Sbjct msgvkkgmwvkvrgsvqndtfvrdlviiandlneiaanerqdtapeGEKRVELHLHTPMS 120 DSSP hhlllllleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeelllllllllllLLLLLLLLLLLLLL DSSP --LLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEelhhhhhhhhhllllllllllllhhHHHHHH Query --DGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIvdrrtleqrkrngeplgaitedkfqDYLKRL 73 ident | | | ||| Sbjct qmDAVTSVTKLIEQAKKWGHPAIAVTDHA-----------------------vvQSFPEA 157 DSSP llLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLL-----------------------llLLHHHH DSSP HHHHHHHHhhhlLEEEEEEEEEELLlLEEEEEEL-------lLLLL------------LL Query WREQKRAWeeygXILIPGVEITNNTdLYHIVAVD-------vKEYV------------DP 114 ident | | | | | Sbjct YSAAKKHG----MKVIYGLEANIVDdPFHVTLLAqnetglknLFKLvslshiqyfhrvPR 213 DSSP HHHHHHHL----LLEEEEEEEEEELlLEEEEEEEllhhhhhhHHHHhhhhhlllllllLL DSSP LLLhHHHHHHHHhlLLEEEELLLlllllllHHHHLLLLLLLLLLEEEeEELLE------- Query SLPvEEIVEKLKeqNALVIAAHPdrkklswYLWANXERFKDTFDAWEiANRDD------- 167 ident | || | | | | | | Sbjct IPR-SVLVKHRD--GLLVGSGCD-----kgELFDNVEDIARFYDFLE-VHPPDvykplyv 264 DSSP EEH-HHHHHLLL--LEEEELLLL-----llLLLLLLLLLHHHLLLEE-ELLHHhhlllll DSSP --------eLHHHHHLL----LLEEEELLLLLHH-------------------------- Query --------lFNSVGVKK----YRYVANSDFHELW-------------------------- 189 ident | || | | Sbjct kdeemikniIRSIVALGekldIPVVATGNVHYLNpedkiyrkilihsqgganplnrhelp 324 DSSP llhhhhhhhHHHHHHHHhhllLLEEELLLLLLLLhhhhhhhhhhhhllhhhlllllllll DSSP --HHLL-----------------eEEEE---eelLLHH---------------------- Query --HVYS-----------------wKTLV---kseKNIE---------------------- 205 ident | Sbjct dvYFRTtnemldcfsflgpekakeIVVDntqkiaSLIGdvkpikdelytpriegadeeir 384 DSSP llLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHhhhhhhHLLLllllllllllllllllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct emsyrrakeiygdplpklveerlekelksiighgfaviylishklvkkslddgylvgsrg 444 DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct svgssfvatmteitevnplpphyvcpnckhseffndgsvgsgfdlpdkncprcgtkykkd 504 DSSP hhhhlhhhhhllllllllllleeelllllleeellllllllhhhllllllllllllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct ghdipfetflgfkgdkvpdidlnfsgeyqprahnytkvlfgednvyragtigtvadktay 564 DSSP llllllhhhhllllllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct gfvkayasdhnlelrgaeidrlaagctgvkrttgqhpggiivvpdymeiydftpiqypad 624 DSSP hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeeeellllllhhhllleelhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct dtssewrtthfdfhsihdnllkldilghddptvirmlqdlsgidpktiptddpdvmgifs 684 DSSP llllllleeeeehhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct steplgvtpeqimcnvgtigipefgtrfvrqmleetrpktfselvqisglshgtdvwlgn 744 DSSP llhhhlllhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct aqeliqngtctlsevigcrddimvyliyrglepslafkimesvrkgkgltpefeaemrkh 804 DSSP hhhhhhlllllhhhllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct dvpewyidsckkikymfpkahaaayvlmavriayfkvhhpllyyasyftvraedfdldam 864 DSSP lllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhllllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 205 ident Sbjct ikgsaairkrieeinakgiqatakekslltvlevalemcergfsfknidlyrsqatefvi 924 DSSP hhlhhhhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleelllllllllllllee DSSP ---------------------------------------------------hhhhhhhhl Query ---------------------------------------------------aikeairkn 214 ident Sbjct dgnslippfnaipglgtnvaqaivrareegeflskedlqqrgklsktlleylesrgclds 984 DSSP elleeellhhhlllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllll DSSP lleeeeelll Query tdvaiylxrk 224 ident Sbjct lpdhnqlslf 994 DSSP llllllllll
DSSP leeEEEEEEELLLLL-LLLL-LHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELHHHHHH-hhHLLL- Query tewLLCDFHVHTNXS-DGHL-PLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVDRRTLEQ-rkRNGE- 56 ident | | || | | | | || | | Sbjct ---XKRDGHTHTEFCpHGTHdDVEEXVLKAIELDFDEYSIVEHAPLSSEFXKntaGDKEa 57 DSSP ---LLEEEEELLLLLlLLLLlLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLHHHHHlllLLLHh DSSP -LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEEEEEELLL-leeeeeellLLLL-- Query -PLGAITEDKFQDYLKRLWREQKRAWEeyGXILIPGVEITNNTD-lyhivavdvKEYV-- 112 ident | | | | | Sbjct vTTASXAXSDLPYYFKKXNHIKKKYAS--DLLIHIGFEVDYLIGyedftrdflnEYGPqt 115 DSSP hHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL--LLEEEEEEEEELLLLlhhhhhhhhhHHHHhl DSSP -----------------------------------------------lllllHHHHhHHH Query -----------------------------------------------dpslpVEEIvEKL 125 ident Sbjct ddgvlslhflegqggfrsidfsaedynegivqfyggfeqaqlaylegvkqsiEADL-GLF 174 DSSP leeeeelleeeelleeeellllhhhhhhhlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL-LLL DSSP HhlllEEEELLL-LLLL---------------lllhhhHLLLLL-LLLLlEEEEEELL-- Query KeqnaLVIAAHP-DRKK---------------lswylwANXERF-KDTFdAWEIANRD-- 166 ident | | | | Sbjct K----PRRXGHIsLCQKfqqffgedtsdfseevxekfrVILALVkKRDY-ELDFNTAGlf 229 DSSP L----LLEELLLlHHHLlhhhhlllhhhllhhhhhhhhHHHHHHhHHLL-EEEEELHHhh DSSP ------EELH--HHHHLL---LLEEEELLLLLHHHHLLEEeeeeelllhhhhhhhhhhll Query ------DLFN--SVGVKK---YRYVANSDFHELWHVYSWKtlvkseknieaikeairknt 215 ident | | || | Sbjct kplcgeTYPPkkIVTLASelqIPFVYGSDSHGVQDIGRGY-------------------- 269 DSSP llllllLLLLhhHHHHHHhllLLEEEELLLLLHHHLLLLH-------------------- DSSP lEEEEelll Query dVAIYlxrk 224 ident Sbjct -STYCqkle 277 DSSP -HHHHhhll
DSSP leeEEEEEEELLLLL-LLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELhhhhhhhhhllllLL Query tewLLCDFHVHTNXS-DGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVDrrtleqrkrngepLG 59 ident | | || | | | |||| | Sbjct ---YPVDLHMHTVAStHAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPD------------mED 45 DSSP ---LLEELLLLLLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLL------------lLL DSSP LLLLlLHHHHHHHhhHHHHHhhhhHLLEEEEEEEEEE----------------------- Query AITEdKFQDYLKRlwREQKRaweeYGXILIPGVEITN----------------------- 96 ident | | | | Sbjct APHH-WHFINMRI--WPRVV----DGVGILRGIEANIknvdgeidcsgkmfdsldliiag 98 DSSP LLLL-HHHHHHHH--LLLEE----LLEEEEEEEEEELllllllllllhhhhhhlleeeee DSSP --LLLLeeeeeellllllllllLHHHHHHHHHhllleEEELLlllllLLLHhhHLLLLLL Query --NTDLyhivavdvkeyvdpslPVEEIVEKLKeqnalVIAAHpdrkkLSWYlwANXERFK 154 ident | | Sbjct fhEPVF------aphdkatntqAMIATIASGN----vHIISH--pgnPKYE--IDVKAVA 144 DSSP llLLLL------llllhhhhhhHHHHHHHLLL----lLEELL--lllLLLL--LLHHHHH DSSP LLL----LEEEeEELLEeLHHHHHLL----LLEEEELLLLLHHHHLLE------------ Query DTF----DAWEiANRDDlFNSVGVKK----YRYVANSDFHELWHVYSW------------ 194 ident | | | | || | Sbjct EAAakhqVALE-INNSSnCREVAAAVrdagGWVALGSDSHTAFTMGEFeeclkildavdf 203 DSSP HHHhhhlLEEE-EELLLlHHHHHHHHhhhlLLEEEELLLLLHHHLLLLhhhhhhhhhlll DSSP ----eeeEEELllhhHHHHHHHH-llleeeeelll Query ----ktlVKSEknieAIKEAIRK-ntdvaiylxrk 224 ident | Sbjct pperilnVSPR----RLLNFLESrgmapiaefadl 234 DSSP lhhhlhhHLHH----HHHHHHHHllllllhhhlll
DSSP leeeEEEEEEL--lLLLLLlLLHHHHHHHHHHLL----LLEEEEEEEEELHhhhhhhhhl Query tewlLCDFHVH--tNXSDGhLPLGEVVDLFGKHG----VDVVSITDHIVDRrtleqrkrn 54 ident | | | || | | Sbjct ----MIDIHCHilpAMDDG-AGDSADSIEMARAAvrqgIRTIIATPHHNNG--------- 46 DSSP ----LEELLLLlllLLLLL-LLLHHHHHHHHHHHhhllLLEEELLLEELLL--------- DSSP lllLLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HLLEEEEEEEEEELLL------leeeeEEL Query gepLGAItedKFQDYLKRLWREQKRAWEE-YGXILIPGVEITNNTD------lyhivAVD 107 ident || | || || Sbjct ---VYKN---EPAAVREAADQLNKRLIKEdIPLHVLPGQEIRIYGEveqdlakrqllSLN 100 DSSP ---LLLL---LHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLEEELLLEEELLLLhhhhhhlllllLHH DSSP L-----------llllllllLHHHHHHHHHhllleEEELLLllllLLLH-hHHLLLLLL- Query V-----------keyvdpslPVEEIVEKLKeqnalVIAAHPdrkkLSWY-lWANXERFK- 154 ident | ||| Sbjct DtkyiliefpfdhvpryaeqLFYDLQLKGY----iPVIAHP-ernREIRenPSLLYHLVe 155 DSSP HlleeeeelllllllllhhhHHHHHHHLLL----eEEEELH-hhlHHHHhlLHHHHHHHh DSSP LLLLeEEEEELLE----------eLHHHHHLLLLEEEELLLLLH-HHHLLE--------- Query DTFDaWEIANRDD----------lFNSVGVKKYRYVANSDFHEL-WHVYSW--------- 194 ident | || | Sbjct KGAA-SQITSGSLagifgkqlkafSLRLVEANLIHFVASDAHNVkTRNFHTqealyvlek 214 DSSP LLLE-EEEEHHHHlllllhhhhhhHHHHHHLLLLLEEELLLLLLlLLLLLHhhhhhhhhh DSSP --------eeEEEElllhhHHHHHhHHLLleeeeelll Query --------ktLVKSeknieAIKEAiRKNTdvaiylxrk 224 ident Sbjct efgselpymlTENA----eLLLRN-QTIFrqppqpvkr 247 DSSP hhllhhhhhhHHHH----hHHHLL-LLLLlllllllll
DSSP -----------------------------------------------------------L Query -----------------------------------------------------------T 1 ident Sbjct lncervwlnvtpatlrsdladygllephalgvhegrihalvpxqdlkypahwqdxkgklV 60 DSSP lllleeeeeeeellllllllllllllleeeeeelleeeeeeehhhllllllleelllleE DSSP EEEEEEEEELLLL---------------------------------------lllllLHH Query EWLLCDFHVHTNX---------------------------------------sdghlPLG 22 ident | | | | Sbjct TPGLIDCHTHLIFagsraeefelrqkgvpyaeiarkgggiistvratraasedqlfeLAL 120 DSSP EELEEEEEELLLLllllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllhhhhhhhhhhllhhhhhhHHH DSSP HHHHHHHHLLLLEEEEEEEeelhhhhhhhhhllllllLLLLL-LHHHHHHHHHHHHHHHH Query EVVDLFGKHGVDVVSITDHivdrrtleqrkrngeplgAITED-KFQDYLKRLWREQKRAW 81 ident | || | | | | Sbjct PRVKSLIREGVTTVEIKSG------------------YGLTLeDELKXLRVARRLGEALP 162 DSSP HHHHHHHHHLEEEEEEELL------------------LLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHLL DSSP hhhlLEEEEEEE--------------------------------------EEELLLLeee Query eeygXILIPGVE--------------------------------------ITNNTDLyhi 103 ident Sbjct ----IRVKTTLLaahavppeyrddpdswveticqeiipaaaeagladavdVFCEHIG--- 215 DSSP ----LEEEEEEEeellllhhhlllhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllleeeEEELLLL--- DSSP eeelllllllLLLL-HHHHHHHHH-HLLLEE---------------------EELLLlll Query vavdvkeyvdPSLP-VEEIVEKLK-EQNALV---------------------IAAHPdrk 140 ident || | | | Sbjct ----------FSLAqTEQVYLAADqYGLAVKghxdqlsnlggstlaanfgalSVDHL--- 262 DSSP ----------LLHHhHHHHHHHHHhLLLEEEeeelllllllhhhhhhhllllEEEEL--- DSSP llllhHHHL--LLLLLLLlLEEEeEELL----------eeLHHHHHLLLLEEEELLLL-- Query klswyLWAN--XERFKDTfDAWEiANRD----------dlFNSVGVKKYRYVANSDFH-- 186 ident || Sbjct ----eYLDPegIQALAHRgVVAT-LLPTafyflketklppVVALRKAGVPXAVSSDINpg 317 DSSP ----lLLLHhhHHHHHHHlLEEE-ELHHhhhhllllllllHHHHHHLLLLEEELLLLLll DSSP --LHHH-HLLE----------------EEEEeelllhhhHHHH---------------hh Query --ELWH-VYSW----------------KTLVkseknieaIKEA---------------ir 212 ident | Sbjct taPIVSlRXAXnxactlfgltpveaxaGVTR---haaraLGEQeqlgqlrvgxladflvw 374 DSSP llLLLLhHHHHhhhhhhhlllhhhhhhHLLH---hhhhhLLLLllllllllllllleeee DSSP hllleeeeELLL----------------- Query kntdvaiyLXRK----------------- 224 ident Sbjct ncghpaelSYLIgvdqlvsrvvngeetlh 403 DSSP llllllhhHHLLlllleeeeeelleelll
DSSP -------------------------------------------------lEEEEEEEEEL Query -------------------------------------------------tEWLLCDFHVH 11 ident | Sbjct yaltqgriftgheflddhavviadgliksvcpvaelppeieqrslngailSPGFIDVQLN 60 DSSP leeelleeelllleelleeeeeelleeeeeeehhhlllllleeelllleeEELEEEEEEL DSSP L----LLLL-----lllLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEElhhhhhhhhhllllllllL Query T----NXSD-----ghlPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVdrrtleqrkrngeplgaiT 62 ident | | | | | Sbjct GcggvQFNDtaeavsveTLEIMQKANEKSGCTNYLPTLITT------------------S 102 DSSP EelleELLLllllllhhHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEELLL------------------L DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLEEE-EEEEEEELL------lleeeeeELLLlllllL Query EDKFQDYLKRLWREQKRAWeeygXILI-PGVEITNNT------dlyhivaVDVKeyvdpS 115 ident | Sbjct DELMKQGVRVMREYLAKHP----NQALgLHLEGPWLNaalvdflcenadvITKVtlapeM 158 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLL----LLLLlEEEELLLLLlhhhhhhhhlhhhEEEEeelhhH DSSP LLHhHHHHHHHHLLLEE---------------------EELLLlllLLLL------HHHH Query LPVeEIVEKLKEQNALV---------------------IAAHPdrkKLSW------YLWA 148 ident | | || | | | | Sbjct VPA-EVISKLANAGIVVsaghsnatlkeakagfragitFATHL-ynAMPYitgrepGLAG 216 DSSP LLH-HHHHHHHHHLLEEeellllllhhhhhhhhhhleeEELLL-llLLLLllllllHHHH DSSP LLLLLLLllLEEEeEELLE------eLHHHHHL-LLLEEEELLLL-lhHHHL-------- Query NXERFKDtfDAWEiANRDD------lFNSVGVK-KYRYVANSDFH-elWHVY-------- 192 ident | | | Sbjct AILDEAD--IYCG-IIADGlhvdyanIRNAKRLkGDKLCLVTDATsgsSLTMiegvrnlv 273 DSSP HHHHLLL--LEEE-EELLLllllhhhHHHHHHHhHHHEEEELLLLlllLLLHhhhhhhhh DSSP -----------leEEEEeelllhhhHHHH----------------------hhhllleee Query -----------swKTLVkseknieaIKEA----------------------irkntdvai 219 ident || | Sbjct ehcgialdevlrmATLY----paraIGVEkrlgtlaagkvanltaftpdfkitktivngn 329 DSSP hhhlllhhhhhhhHLHH----hhhhLLLLllllllllllllleeeellllleeeeeelle DSSP eelll Query ylxrk 224 ident Sbjct evvtq 334 DSSP eeeel
DSSP -------------------------------------------------LEEEEEEEEEL Query -------------------------------------------------TEWLLCDFHVH 11 ident | | Sbjct alqtiinarlpgeeglwqihlqdgkisaidaqsgvmpitensldaeqglVIPPFVEPHIH 60 DSSP llleeeeellllllleeeeeeelleeeeeeeellllllllleeelllleEELLEEEEEEL DSSP LLllLLLL---------------------------------LHHHHHHHHHHLLLLEEEE Query TNxsDGHL---------------------------------PLGEVVDLFGKHGVDVVSI 38 ident | | Sbjct LD--TTQTagqpnwnqsgtlfegierwaerkallthddvkqRAWQTLKWQIANGIQHVRT 118 DSSP LL--LLLLlllllllllllhhhhhhhhhllhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEE DSSP EEeeelhhhhhhhhhllllllLLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEE------ Query TDhivdrrtleqrkrngeplgAITEDKFqDYLKRLWREQKRAWEeyGXILIPGV------ 92 ident || | Sbjct HV-------------------DVSDATL-TALKAMLEVKQEVAP--WIDLQIVAfpqegi 156 DSSP EE-------------------ELLLLLL-HHHHHHHHHHHHHLL--LLEEEEEEelllll DSSP ---------------------EEEELLLleeeeeellllllllLLLHHHHHHHHH-HLLL Query ---------------------EITNNTDlyhivavdvkeyvdpSLPVEEIVEKLK-EQNA 130 ident Sbjct lsypngealleealrlgadvvGAIPHFE---------ftreygVESLHKTFALAQkYDRL 207 DSSP lllllhhhhhhhhhhlllleeEELHHHL---------llhhhhHHHHHHHHHHHHhHLLE DSSP ------------------------------EEEELLLL--llllllhhhhLLLLLLLLLL Query ------------------------------LVIAAHPD--rkklswylwaNXERFKDTFD 158 ident | | | | Sbjct idvhcdeiddeqsrfvetvaalahhegmgaRVTASHTTamhsyngaytsrLFRLLKMSGI 267 DSSP eeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhllhhHEEEEELHhhhhllhhhhhhHHHHHHHHLL DSSP EEEeEELL------------------eeLHHHHHLLLLEEEELLLLL-----HHHH--LL Query AWEiANRD------------------dlFNSVGVKKYRYVANSDFHE-----LWHV--YS 193 ident || | | Sbjct NFV-ANPLvnihlqgrfdtypkrrgitrVKEMLESGINVCFGHDDVFdpwypLGTAnmLQ 326 DSSP EEE-ELHHhhhhhlllllllllllllllHHHHHHLLLLEEELLLLLLlllllLLLLlhHH DSSP EE---------------------EEEEelllhhhHHHH---------------------- Query WK---------------------TLVKseknieaIKEA---------------------- 210 ident Sbjct VLhmglhvcqlmgygqindglnlITHH---sartLNLQdygiaagnsanliilpaengfd 383 DSSP HHhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHH---hhhhLLLLllllllllllleeeellllhhh DSSP --------------------------hhhllleeeeelll Query --------------------------irkntdvaiylxrk 224 ident Sbjct alrrqvpvrysvrggkviastqpaqttvyleqpeaidykr 423 DSSP hhhhllllleeeelleeeeellllleeeellleeeellll
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