Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 1m65-A 47.8 0.0 234 234 100 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCDX;
2
DSSP LLEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHLLL Query YPVDLHMHTVASTHAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPDMEDAPHHWHFINMRIWPR 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct YPVDLHMHTVASTHAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPDMEDAPHHWHFINMRIWPR 60 DSSP LLEELLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHLLL DSSP EELLEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLHHHHHHLLEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH Query VVDGVGILRGIEANIKNVDGEIDCSGKMFDSLDLIIAGFHEPVFAPHDKATNTQAMIATI 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct VVDGVGILRGIEANIKNVDGEIDCSGKMFDSLDLIIAGFHEPVFAPHDKATNTQAMIATI 120 DSSP EELLEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLHHHHHHLLEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHH DSSP HLLLLLEELLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL Query ASGNVHIISHPGNPKYEIDVKAVAEAAAKHQVALEINNSSNCREVAAAVRDAGGWVALGS 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ASGNVHIISHPGNPKYEIDVKAVAEAAAKHQVALEINNSSNCREVAAAVRDAGGWVALGS 180 DSSP HLLLLLEELLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL DSSP LLLLHHHLLLLHHHHHHHHHLLLLHHHLHHHLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLL Query DSHTAFTMGEFEECLKILDAVDFPPERILNVSPRRLLNFLESRGMAPIAEFADL 234 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct DSHTAFTMGEFEECLKILDAVDFPPERILNVSPRRLLNFLESRGMAPIAEFADL 234 DSSP LLLLHHHLLLLHHHHHHHHHLLLLHHHLHHHLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLL
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek 120 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv 180 DSSP hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl 240 DSSP leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriageteeev 300 DSSP eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelllhhhh DSSP ------------------------------------LLEELLLLLLLLlLLLLLHHHHHH Query ------------------------------------YPVDLHMHTVAStHAYSTLSDYIA 24 ident || | | || Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpkllelpqVKGDLQVHSTYS-DGQNTLEELWE 359 DSSP hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllllhhhLLEEEEELLLLL-LLLLLHHHHHH DSSP HHHHHLLLEEEEEEELLLLLL--LLLLHHHHHHHH--LLLE--ELLEEEEEEEEEELLLl Query QAKQKGIKLFAITDHGPDMED--APHHWHFINMRI--WPRV--VDGVGILRGIEANIKNv 78 ident || | | ||| | | | | | | Sbjct AAKTMGYRYLAVTDHSPAVRVagGPSPEEALKRVGeiRRFNetHGPPYLLAGAEVDIHP- 418 DSSP HHHHHLLLEEEEEEELHHHHLllLLLHHHHHHHHHhhHHHHhhHLLLEEEEEEEEELLL- DSSP LLLLLLLHHHHHHLLEEEEELLlllLLLL-LHHHHHHHHHHHHHLLLLLEELLLLLL--- Query DGEIDCSGKMFDSLDLIIAGFHepvFAPH-DKATNTQAMIATIASGNVHIISHPGNP--- 134 ident || | ||| | || | || || Sbjct DGTLDYPDWVLRELDLVLVSVH---SRFNlPKADQTKRLLKALENPFVHVLAHPTARllg 475 DSSP LLLLLLLHHHHLLLLEEEEELL---LLLLlLHHHHHHHHHHHHLLLLLLEELLLLLLlll DSSP ---LLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL----lHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHH Query ---KYEIDVKAVAEAAAKHQVALEINNSS----nCREVAAAVRDAGGWVALGSDSHTAFT 187 ident | | || | || || | | | | | | Sbjct rraPIEADWEAVFQKAKEKGVAVEIDGYYdrmdlPDDLARMAYGMGLWISLSTDAHQTDH 535 DSSP lllLLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLlllllLHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLHHH DSSP LLLLHHHHHHHHHLLLLHHHLHHHL-HHHHHHHHHHLLllllhhhlll Query MGEFEECLKILDAVDFPPERILNVS-PRRLLNFLESRGmapiaefadl 234 ident | ||| || || | | Sbjct LRFMELAVGTAQRAWIGPERVLNTLdYEDLLSWLKARR--------gv 575 DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHLlHHHHHHHHHLLL--------ll
DSSP LLEELLLLLLLLLLLL-LLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLL---------------lL Query YPVDLHMHTVASTHAY-STLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPD---------------mE 44 ident | | || | | | | | Sbjct XKRDGHTHTEFCPHGThDDVEEXVLKAIELDFDEYSIVEHAPLssefxkntagdkeavtT 60 DSSP LLEEEEELLLLLLLLLlLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLlhhhhhllllllhhhhL DSSP LLLLLHHHHHHHH--LLLE---ELLEEEEEEEEEELLLL--lllllLLHHHHHHLLEEEE Query DAPHHWHFINMRI--WPRV---VDGVGILRGIEANIKNV--dgeidCSGKMFDSLDLIIA 97 ident | | | | Sbjct ASXAXSDLPYYFKkxNHIKkkyASDLLIHIGFEVDYLIGyedftrdFLNEYGPQTDDGVL 120 DSSP LLLLHHHHHHHHHhhHHHHhhlLLLLEEEEEEEEELLLLlhhhhhhHHHHHHHHLLEEEE DSSP ELLlllLLLL---------------------------LHHHHHHHHHHHHHLL----LLL Query GFHepvFAPH---------------------------DKATNTQAMIATIASG----NVH 126 ident | | | Sbjct SLH---FLEGqggfrsidfsaedynegivqfyggfeqAQLAYLEGVKQSIEADlglfKPR 177 DSSP ELL---EEEElleeeellllhhhhhhhlhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllLLL DSSP EELLLLLLL----------------lllLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL---------- Query IISHPGNPK----------------yeiDVKAVAEAAAKHQVALEINNSS---------- 160 ident | | | | Sbjct RXGHISLCQkfqqffgedtsdfseevxeKFRVILALVKKRDYELDFNTAGlfkplcgety 237 DSSP EELLLLHHHllhhhhlllhhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHLLEEEEELHHhhllllllll DSSP LHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLLL-LHHHHHHHHhllllhhhlhhhlhhhhhhh Query NCREVAAAVRDAGGWVALGSDSHTAFTMGE-FEECLKILDavdfpperilnvsprrllnf 219 ident ||||| | | Sbjct PPKKIVTLASELQIPFVYGSDSHGVQDIGRgYSTYCQKLE-------------------- 277 DSSP LLHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLHHHLLLlHHHHHHHLL-------------------- DSSP hhhllllllhhhlll Query lesrgmapiaefadl 234 ident Sbjct --------------- 277 DSSP ---------------
DSSP -lLEELLLLLlllllllllhHHHHHHHHhHLLLEEEEEEELLLLllllLLHHHHHHHHLl Query -yPVDLHMHTvasthaystlSDYIAQAKqKGIKLFAITDHGPDMedapHHWHFINMRIWp 59 ident || | Sbjct vkFIEMDIRD----------KEAYELAK-EWFDEVVVSIKFNEE---vDKEKLREARKE- 45 DSSP llLEEEEELL----------HHHHHHHH-HHLLEEEEEEEELLL---lLHHHHHHHHHH- DSSP leelleeEEEEEEEELLLlLLLL--LLLHhhHHHLlEEEEELlllllllllhhhHHHHHH Query rvvdgvgILRGIEANIKNvDGEI--DCSGkmFDSLdLIIAGFhepvfaphdkatNTQAMI 117 ident | | | || Sbjct ------yGKVAILLSNPK-PSLVrdTVQK--FKSY-LIYVES-----------nDLRVIR 84 DSSP ------hLLEEEEEELLL-HHHHhhHHHH--LLLL-EEEEEL-----------lLHHHHH DSSP HHHHLLlLLEELLLLLLLLL-LLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL--------------LH Query ATIASGnVHIISHPGNPKYE-IDVKAVAEAAAKHQVALEINNSS--------------NC 162 ident | | | | | | | ||| Sbjct YSIEKG-VDAIISPWVNRKDpGIDHVLAKLMVKKNVALGFSLRPllysnpyeranllrFM 143 DSSP HHHHLL-LLEEELLLLLLLLlLLLHHHHHHHHHHLLEEEEELHHhhhllhhhhhhhhhHH DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLL----LLHHHHHHHhhllLLHHH--LHHHLhhHH Query REVAAAVRDAGGWVALGSDSHTAFTMG----EFEECLKILdavdFPPER--ILNVSprRL 216 ident | | | | Sbjct MKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEKWDVRyprdLISLGVVIG----MEIPQakASISM--YP 197 DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLLlhhhHHHHHHHLL----LLHHHhhHLLLH--HH DSSP HHHHHhllllllhhhlll Query LNFLEsrgmapiaefadl 234 ident | Sbjct EIILK------------- 202 DSSP HHHHL-------------
DSSP lLEELLLL--LLLLlLLLL---LHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLLlLLLLLlhHHHH- Query yPVDLHMH--TVAStHAYS---TLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPDmEDAPHhwHFIN- 54 ident | | | | || | | Sbjct -MIDIHCHilPAMD-DGAGdsaDSIEMARAAVRQGIRTIIATPHHNN-GVYKN--EPAAv 55 DSSP -LEELLLLllLLLL-LLLLlhhHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLEELL-LLLLL--LHHHh DSSP HHHL--LLEE-----LLEEEEEEEEEELLLllllllLLHHHhhHLLE-----EEEELLLl Query MRIW--PRVV-----DGVGILRGIEANIKNvdgeidCSGKMfdSLDL-----IIAGFHEp 102 ident | | | | | | | | Sbjct REAAdqLNKRlikedIPLHVLPGQEIRIYG-eveqdLAKRQ--LLSLndtkyILIEFPF- 111 DSSP HHHHhhHHHHhhhllLLLEEELLLEEELLL-lhhhhHHLLL--LLLHhhlleEEEELLL- DSSP llllllhhhHHHHHHHHHHLL----LLLEELLLLLlLLLL--LHHHHHHHHHHHlLEEEE Query vfaphdkatNTQAMIATIASG----NVHIISHPGNpKYEI--DVKAVAEAAAKHqVALEI 156 ident | || || | | | Sbjct -------dhVPRYAEQLFYDLqlkgYIPVIAHPER-NREIreNPSLLYHLVEKG-AASQI 162 DSSP -------llLLLLHHHHHHHHhhllLEEEEELHHH-LHHHhhLLHHHHHHHHLL-LEEEE DSSP ELLL-----------LHHHHHHHHhhhllLEEEELLLLLHH-HLLLLHHHHHHHHHLL-- Query NNSS-----------NCREVAAAVrdaggWVALGSDSHTAF-TMGEFEECLKILDAVD-- 202 ident | | || | | | | Sbjct TSGSlagifgkqlkaFSLRLVEAN----lIHFVASDAHNVKtRNFHTQEALYVLEKEFgs 218 DSSP EHHHhlllllhhhhhHHHHHHHLL----lLLEEELLLLLLLlLLLLHHHHHHHHHHHHll DSSP -LLHHH-LHHHlhhHHHHhHHHLlllllhhhlll Query -FPPER-ILNVsprRLLNfLESRgmapiaefadl 234 ident | || Sbjct eLPYMLtENAE---LLLR-NQTI-frqppqpvkr 247 DSSP hHHHHHhHHHH---HHHL-LLLL-llllllllll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct sktiiknigkivsgdikspvlqadtivvedgliaaiggeelmkdagdatiidaagstvtp 60 DSSP leeeeellleeellllllleellleeeeelleeeeeelhhhhlllllleeeelllleeee DSSP lLEELLLLLL---llLLLLLLhhHHHHHHHHHLLLEEEEEEE----llllllllLLHHHH Query yPVDLHMHTV---asTHAYSTlsDYIAQAKQKGIKLFAITDH----gpdmedapHHWHFI 53 ident | | | | | | | | Sbjct gLLDTHVHVSggdyaPRQKTM--DFISSALHGGVTTMISAGSphfpgrpkdaagTKALAI 118 DSSP lEEEEEELLLllleeHHHLEE--LHHHHHHLLLEEEEEELLLlllllllllhhhHHHHHH DSSP H-HHHLL-LEELLEEEEE------------------------eEEEE---lLLLL----l Query N-MRIWP-RVVDGVGILR------------------------gIEAN---iKNVD----g 80 ident || | || Sbjct TlSKSYYnARPAGVKVHGgavilekglteedfiemkkegvwivGEVGlgtiKNPEdaapm 178 DSSP HhHHHHHhLLHHHLEEELleelllllllhhhhhhhhhlllleeEEELllllLLHHhhhhh DSSP lllLLHHHHhhllEEEEEL-LLLLlllllhhhHHHHHHHHHhlllLLEELLLLL--lLLL Query eidCSGKMFdsldLIIAGF-HEPVfaphdkatNTQAMIATIasgnVHIISHPGN--pKYE 137 ident | | | || Sbjct vewAHKHGF----KVQMHTgGTSI--pgsstvTADDVIKTK----PDVVSHINGgptAIS 228 DSSP hhhHHHLLL----EEEEELlLLLL--llllllLHHHHHHHL----LLEEELLLLlllLLL DSSP L-LHHHHHHHhhhHLLEEEEELLL---LHHHHHHHHHHHLL--LEEEELLLLL--hHHLL Query I-DVKAVAEAaakHQVALEINNSS---NCREVAAAVRDAGG--WVALGSDSHT--aFTMG 189 ident | | || || | | | | Sbjct VqEVDRIMDE---TDFAMEIVQCGnpkIADYVARRAAEKGQlgRVIFGNDAPSgtgLIPL 285 DSSP HhHHHHHHHH---LLLEEEEELLLlhhHHHHHHHHHHHHLLhhHEEEELLLLLlllLLLL DSSP LLHHHHHHHH-HLLLLHHH--LHHHLhhHHHHHHHhllllllhhHLLL------------ Query EFEECLKILD-AVDFPPER--ILNVSprRLLNFLEsrgmapiaeFADL------------ 234 ident | || Sbjct GILRNMCQIAsMSDIDPEVavCMATG--NSTAVYGlntgviapgKEADliimdtplgsva 343 DSSP HHHHHHHHHHhHLLLLHHHhhHHHLH--HHHHHHLlllllllllLLLLeeeeelllllll DSSP ------------------------------------------ Query ------------------------------------------ 234 ident Sbjct edamgaiaagdipgisvvlidgeavvtksrntppakraakil 385 DSSP llhhhhhhhlllleeeeeeelleeeellllllllllllleel
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lncervwlnvtpatlrsdladygllephalgvhegrihalvpxqdlkypahwqdxkgklv 60 DSSP lllleeeeeeeellllllllllllllleeeeeelleeeeeeehhhllllllleellllee DSSP --lLEELLL-LLLL-------------------------LLLL------------llLHH Query --yPVDLHM-HTVA-------------------------STHA------------ysTLS 20 ident | | | Sbjct tpgLIDCHThLIFAgsraeefelrqkgvpyaeiarkgggIISTvratraasedqlfeLAL 120 DSSP eelEEEEEElLLLLlllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllHHHHhhhhhhllhhhhhhHHH DSSP HHHHHHHHHLLLEEEEEEEllllllLLLL-HHHHHHHH--LLLE-ELLEEEEEEEEEE-- Query DYIAQAKQKGIKLFAITDHgpdmedAPHH-WHFINMRI--WPRV-VDGVGILRGIEAN-- 74 ident | | | Sbjct PRVKSLIREGVTTVEIKSG------YGLTlEDELKXLRvaRRLGeALPIRVKTTLLAAha 174 DSSP HHHHHHHHHLEEEEEEELL------LLLLhHHHHHHHHhhHHHHhHLLLEEEEEEEEEll DSSP ----------lllllllllLLHHHH--HHLLEEEEELLLLLLLLL--------------- Query ----------iknvdgeidCSGKMF--DSLDLIIAGFHEPVFAPH--------------- 107 ident | | Sbjct vppeyrddpdswveticqeIIPAAAeaGLADAVDVFCEHIGFSLAqteqvylaadqygla 234 DSSP llhhhlllhhhhhhhhhhlHHHHHHhlLLLLEEEEEELLLLLLHHhhhhhhhhhhhllle DSSP -----lhhhHHHHHHHHHHLLlLLEELLLLlllllLLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL-- Query -----dkatNTQAMIATIASGnVHIISHPGnpkyeIDVKAVAEAAAKHQVALEINNSS-- 160 ident | | | | | | Sbjct vkghxdqlsNLGGSTLAANFG-ALSVDHLE-----YLDPEGIQALAHRGVVATLLPTAfy 288 DSSP eeeeellllLLLHHHHHHHLL-LLEEEELL-----LLLHHHHHHHHHHLLEEEELHHHhh DSSP -----LHHHhHHHHHHHLLLEEEELLLLL---hHHLLL--LHHHHHHHHhllLLHHH--L Query -----NCREvAAAVRDAGGWVALGSDSHT---aFTMGE--FEECLKILDavdFPPER--I 208 ident | | || | || | Sbjct flketKLPP-VVALRKAGVPXAVSSDINPgtapIVSLRxaXNXACTLFG---LTPVEaxA 344 DSSP hllllLLLL-HHHHHHLLLLEEELLLLLLllllLLLHHhhHHHHHHHHL---LLHHHhhH DSSP HHHL--hhhHHHHhhhllllllhhHLLL-------------------------------- Query LNVS--prrLLNFlesrgmapiaeFADL-------------------------------- 234 ident | Sbjct GVTRhaaraLGEQ--eqlgqlrvgXLADflvwncghpaelsyligvdqlvsrvvngeetl 402 DSSP HLLHhhhhhLLLL--lllllllllLLLLeeeellllllhhhhlllllleeeeeelleell DSSP - Query - 234 ident Sbjct h 403 DSSP l
DSSP LLEELLLLLLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllllllllhhHHHHHHL-- Query YPVDLHMHTVAStHAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGpdmedaphhwhFINMRIW-- 58 ident ||| | | | | | | | ||| Sbjct ANIDLHFHSRTS-DGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD-----------CTGGLAEaa 48 DSSP LLEELLLLLLLL-LLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL-----------LLLLHHHhh DSSP -llEELLEEEEEEEEEELLLLL------------llllLLHHH----------------- Query -prVVDGVGILRGIEANIKNVD------------geidCSGKM----------------- 88 ident | | | | Sbjct aaaARRGIPFLNGVEVSVSWGRhtvhivglgidpaepaLAAGLksiregrlerarqmgas 108 DSSP hhhHHLLLLEEEEEEEEEEELLeeeeeeeellllllhhHHHHHhhhhllhhhhhhhhhhh DSSP ----------------------------------hhhlleeeeellllllllllhhhhhh Query ----------------------------------fdsldliiagfhepvfaphdkatntq 114 ident Sbjct leaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvshq 168 DSSP hhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllllllllll DSSP hhhhhhhLLLL------LEELLLLLLlLLLL--HHHHHHHHHH-HLLEEEE-ELLL---L Query amiatiaSGNV------HIISHPGNPkYEID--VKAVAEAAAK-HQVALEI-NNSS---N 161 ident | | ||| | | Sbjct wasledaVGWIvgaggmAVIAHPGRY-DMGRtlIERLILDFQAaGGQGIEVaSGSHsldD 227 DSSP lllhhhhHHHHhhllleEEELLHHHL-LLLHhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEeELLLlhhH DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL-hhHLLLLHHHhhhHHHLlllhhHLHHHlhhHHHHhh Query CREVAAAVRDAGGWVALGSDSHT-afTMGEFEEClkiLDAVdfppeRILNVsprRLLNfl 220 ident | | ||| | | | | | Sbjct MHKFALHADRHGLYASSGSDFHApgeDVGHTEDL---PPIC-----RPIWR---ELEA-- 274 DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLlllLLLLLLLL---LLLL-----LLHHH---HLHH-- DSSP hhllllllhHHLL--l Query esrgmapiaEFAD--l 234 ident || Sbjct ------rilRPADaen 284 DSSP ------hllLLLHhhl
DSSP ----------------------------------------------------------lL Query ----------------------------------------------------------yP 2 ident Sbjct aeikavsaarlldvasgkyvdnplvivtdgritsigkkgdavpagatavdlpgvtllpgL 60 DSSP lleeeeeeeeeeelllleeeeleeeeeelleeeeeeellllllllleeeeeeeeeeeelE DSSP EELLLLLllllLLLL-----------------LHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEellllll Query VDLHMHTvastHAYS-----------------TLSDYIAQAKQKGIKLFAITDhgpdmed 45 ident | | | | Sbjct IDMHVHL----DSLAevggynsleysdrfwsvVQTANAKKTLEAGFTTVRNVG------- 109 DSSP EEEEELL----LLLLlllhhhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEELL------- DSSP llllhhHHHHhHLLL------eELLEEEEEE----------------------------- Query aphhwhFINMrIWPR------vVDGVGILRG----------------------------- 70 ident | | | | Sbjct -----aADYDdVGLReaidagyVPGPRIVTAaisfgatgghcdstffppsmdqknpfnsd 164 DSSP -----lLLLHhHHHHhhhhlllLLLLEEEELllleellllllllllllhhhlllllllll DSSP -------------------EEEEL--------------LLLL--LLLL---LLHHHHhhl Query -------------------IEANI--------------KNVD--GEID---CSGKMFdsl 92 ident | Sbjct spdearkavrtlkkygaqvIXICAtggvfsrgnepgqqQLTYeeMKAVvdeAHMAGI--- 221 DSSP lhhhhhhhhhhhhhlllleEEEELllllllllllllllLLLHhhHHHHhhhHHHLLL--- DSSP leEEEELlllllllllhhhHHHHHHHHHHLLlLLEELLLLLllllllHHHHHHHHHHHLL Query dlIIAGFhepvfaphdkatNTQAMIATIASGnVHIISHPGNpkyeidVKAVAEAAAKHQV 152 ident | | | | | | Sbjct -kVAAHA-----------hGASGIREAVRAG-VDTIEHASL-----vDDEGIKLAVQKGA 263 DSSP -eEEEEE-----------lLHHHHHHHHHLL-LLEEEELLL-----lLHHHHHHHHHHLL DSSP EEEE-ELLL-------------------------LHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL--L Query ALEI-NNSS-------------------------NCREVAAAVRDAGGWVALGSDSH--T 184 ident || || | | Sbjct YFSMdIYNTdytqaegkkngvlednlrkdrdigeLQRENFRKALKAGVKMVYGTDAGiyP 323 DSSP EEELlLLLHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLEEELLLLLLllL DSSP HHHLLLLHHHHHHHHhllLLHHHL--HHHLhhHHHHHHHhllLLLL-----hhHLLL--- Query AFTMGEFEECLKILDavdFPPERI--LNVSprRLLNFLEsrgMAPI-----aeFADL--- 234 ident | | Sbjct HGDNAKQFAVMVRYG---ATPLQAiqSATL--TAAEALG---RSKDvgqvavgRYGDmia 375 DSSP LLLHHHHHHHHHHLL---LLHHHHhhHLLH--HHHHHHL---LLLLlllllllLLLLeee DSSP ----------------------------- Query ----------------------------- 234 ident Sbjct vagdpladvttlekpvfvmkggavvkapx 404 DSSP elllllllhhhhhllleeeelleeeelll
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