Results: dupa update

Query: 1bksA

MOLECULE: TRYPTOPHAN SYNTHASE;

Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition. The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious. Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, and to the PDB format coordinate file where the neighbour is superimposed onto the query structure.

Expand gaps

Summary

    No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id PDB  Description
1:  1bks-A 49.7  0.0  255   255  100 PDB  MOLECULE: TRYPTOPHAN SYNTHASE;                                       
2:  3cjp-A  8.8  4.0  179   262    6 PDB  MOLECULE: PREDICTED AMIDOHYDROLASE, DIHYDROOROTASE FAMILY;           
3:  2oof-A  8.5  3.9  179   403   11 PDB  MOLECULE: 4-IMIDAZOLONE-5-PROPANOATE AMIDOHYDROLASE;                 
4:  2paj-A  8.5  3.9  178   421    8 PDB  MOLECULE: PUTATIVE CYTOSINE/GUANINE DEAMINASE;                       
5:  3nqb-A  8.4  3.7  180   587    7 PDB  MOLECULE: ADENINE DEAMINASE 2;                                       
6:  1a4m-A  8.2  4.1  179   349    9 PDB  MOLECULE: ADENOSINE DEAMINASE;                                       
7:  4cqb-A  8.1  3.9  185   402   12 PDB  MOLECULE: N-ISOPROPYLAMMELIDE ISOPROPYL AMIDOHYDROLASE;              
8:  2vun-A  8.1  3.8  168   385    7 PDB  MOLECULE: ENAMIDASE;                                                 
9:  1gkp-A  7.9  4.7  185   458    9 PDB  MOLECULE: HYDANTOINASE;                                              
10:  2imr-A  7.7  3.6  179   380   11 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN DR_0824;                              
11:  1k6w-A  7.7  3.7  172   423    9 PDB  MOLECULE: CYTOSINE DEAMINASE;                                        
12:  2uz9-A  7.7  3.8  179   444    6 PDB  MOLECULE: GUANINE DEAMINASE;                                         
13:  3mkv-A  7.6  3.6  166   414    7 PDB  MOLECULE: PUTATIVE AMIDOHYDROLASE;                                   
14:  3ls9-A  7.6  3.9  185   453    8 PDB  MOLECULE: TRIAZINE HYDROLASE;                                        
15:  3giq-A  7.6  3.9  186   475    6 PDB  MOLECULE: N-ACYL-D-GLUTAMATE DEACYLASE;                              
16:  4b3z-D  7.6  4.3  183   477    7 PDB  MOLECULE: DIHYDROPYRIMIDINASE-RELATED PROTEIN 1;                     
17:  4dlf-A  7.5  3.6  176   287    8 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE 2;                                          
18:  1yrr-B  7.5  3.8  165   334   11 PDB  MOLECULE: N-ACETYLGLUCOSAMINE-6-PHOSPHATE DEACETYLASE;               
19:  1itq-A  7.4  3.6  178   369    9 PDB  MOLECULE: RENAL DIPEPTIDASE;                                         
20:  4mup-B  7.4  4.0  181   286    9 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            
21:  3gri-A  7.2  4.1  173   422    7 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
22:  2ffi-A  7.1  3.7  169   273    9 PDB  MOLECULE: 2-PYRONE-4,6-DICARBOXYLIC ACID HYDROLASE, PUTATIV          
23:  3dcp-A  7.1  3.6  155   277    9 PDB  MOLECULE: HISTIDINOL-PHOSPHATASE;                                    
24:  4rdv-B  7.1  3.7  173   451   12 PDB  MOLECULE: N-FORMIMINO-L-GLUTAMATE IMINOHYDROLASE;                    
25:  4c5y-A  6.9  3.8  162   436    9 PDB  MOLECULE: OCHRATOXINASE;                                             
26:  1j6p-A  6.9  3.7  177   407    7 PDB  MOLECULE: METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF                               
27:  1onx-A  6.7  3.8  174   390   11 PDB  MOLECULE: ISOASPARTYL DIPEPTIDASE;                                   
28:  4qrn-A  6.7  3.7  169   352   12 PDB  MOLECULE: 5-CARBOXYVANILLATE DECARBOXYLASE;                          
29:  2ob3-A  6.6  3.9  176   329   11 PDB  MOLECULE: PARATHION HYDROLASE;                                       
30:  3pnu-A  6.6  3.7  172   338   12 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
31:  1bf6-A  6.5  3.8  169   291    7 PDB  MOLECULE: PHOSPHOTRIESTERASE HOMOLOGY PROTEIN;                       
32:  3k2g-B  6.5  3.8  172   358   10 PDB  MOLECULE: RESINIFERATOXIN-BINDING, PHOSPHOTRIESTERASE-               
33:  2a3l-A  6.5  3.9  174   616    6 PDB  MOLECULE: AMP DEAMINASE;                                             
34:  3e74-A  6.5  4.4  171   429    8 PDB  MOLECULE: ALLANTOINASE;                                              
35:  2y1h-B  6.4  3.6  165   265    7 PDB  MOLECULE: PUTATIVE DEOXYRIBONUCLEASE TATDN3;                         
36:  3mtw-A  6.4  3.6  164   404    9 PDB  MOLECULE: L-ARGININE CARBOXYPEPTIDASE CC2672;                        
37:  3gg7-A  6.1  3.5  153   243   14 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED METALLOPROTEIN;                            
38:  2vc5-A  6.0  4.3  168   314    8 PDB  MOLECULE: ARYLDIALKYLPHOSPHATASE;                                    
39:  3icj-A  6.0  3.8  167   468    7 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED METAL-DEPENDENT HYDROLASE;                 
40:  4ofc-A  5.9  3.2  150   335   15 PDB  MOLECULE: 2-AMINO-3-CARBOXYMUCONATE-6-SEMIALDEHYDE DECARBOX          
41:  4hk5-D  5.8  3.9  160   380    7 PDB  MOLECULE: URACIL-5-CARBOXYLATE DECARBOXYLASE;                        
42:  3irs-A  5.8  3.9  141   281    8 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN BB4693;                            
43:  3au2-A  5.8  3.7  146   575    8 PDB  MOLECULE: DNA POLYMERASE BETA FAMILY (X FAMILY);                     
44:  1m65-A  5.7  3.6  141   234    9 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCDX;                                 
45:  2ogj-A  5.7  3.8  156   379   10 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
46:  2dvt-A  5.6  3.5  152   325    6 PDB  MOLECULE: THERMOPHILIC REVERSIBLE GAMMA-RESORCYLATE DECARBO          
47:  2gwg-A  5.5  3.9  163   329   10 PDB  MOLECULE: 4-OXALOMESACONATE HYDRATASE;                               
48:  1a5k-C  5.4  3.8  164   566   10 PDB  MOLECULE: UREASE (GAMMA SUBUNIT);                                    
49:  4dzi-C  5.3  4.1  166   388   11 PDB  MOLECULE: PUTATIVE TIM-BARREL METAL-DEPENDENT HYDROLASE;             
50:  2qpx-A  5.1  5.6  155   376    7 PDB  MOLECULE: PREDICTED METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF THE TIM-BA          
51:  2anu-A  4.8  3.9  127   224   10 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0559;                               
52:  1v77-A  4.8  3.5  117   202   15 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1877;                               
53:  1j5s-A  4.7  3.1  141   451    7 PDB  MOLECULE: URONATE ISOMERASE;                                         
54:  3qy6-A  4.6  4.5  144   247   10 PDB  MOLECULE: TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE YWQE;                         
55:  3f2b-A  4.5  4.0  135   994   11 PDB  MOLECULE: DNA-DIRECTED DNA POLYMERASE III ALPHA CHAIN;               
56:  3iac-A  4.2  3.9  138   469    9 PDB  MOLECULE: GLUCURONATE ISOMERASE;                                     
57:  3e38-A  3.7  4.4  133   342   12 PDB  MOLECULE: TWO-DOMAIN PROTEIN CONTAINING PREDICTED PHP-LIKE           
58:  3ooq-A  3.7  4.1  139   384   10 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            
59:  2yb1-A  3.3  3.3  114   284   10 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            


Pairwise Structural Alignments

Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.

No 1: Query=1bksA Sbjct=1bksA Z-score=49.7

back to top
DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLL
Query MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLAD   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLAD   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query GPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQ  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQ  120
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELHHHHHLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLEEEELLLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLL
Query VGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLALP  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct VGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLALP  180
DSSP  HLLLEEEELLLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHHLLLLHHHHH
Query LHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQML  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQML  240
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHHLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLL
Query AELRSFVSAMKAASR  255
ident |||||||||||||||
Sbjct AELRSFVSAMKAASR  255
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLL


No 2: Query=1bksA Sbjct=3cjpA Z-score=8.8

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleEEEEEelllllhhhhhHHHHHHHHLL------lLLEEEELL-
Query meryenlfaqlndrregaFVPFVtlgdpgieqslKIIDTLIDAG------aDALELGVP-   53
ident                                         |            |      
Sbjct ---------------liiDGHTH---------viLPVEKHIKIMdeagvdkTILFSTSIh   36
DSSP  ---------------lleEEEEE---------llLLHHHHHHHHhhhllleEEEELLLLl


DSSP  --llllllllHHHHHHH-----hhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEELHHh
Query --fsdpladgPTIQNAN-----lrafaagVTPAQCFEMLALIREKHPT-IPIGLLMYANl  105
ident                                       |       |             
Sbjct petavnlrdvKKEMKKLndvvngktnsmiDVRRNSIKELTNVIQAYPSrYVGFGNVPVG-   95
DSSP  hhhlllhhhhHHHHHHHhhhhlllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEELLLLL-


DSSP  hHLLLHHHHHHH-HHHHLLLEEE-ELLL--LHHHLHHHHHHHHHLL-LEEEEEELLLLLH
Query vFNNGIDAFYAR-CEQVGVDSVL-VADV--PVEESAPFRQAALRHN-IAPIFICPPNADD  160
ident    |                                |                       
Sbjct lSENDTNSYIEEnIVNNKLVGIGeLTPAsgQIKSLKPIFKYSMDSGsLPIWIHAFNPLVL  155
DSSP  lLHHHHHHHHHHhLLLLLLLEEEeELLLllLHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEELLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHL------LLLEEE-llLLHHHHHHHHHHHLLLLEEELLllllhhHHHHHHH
Query DLLRQVASYG------RGYTYL-laLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFgisspeQVSAAVR  213
ident       |                         |  ||                       
Sbjct QDIKEIAELCkafpkvPVILGHmggSNWMTAVELAKEIQNLYLDTSA----yfSTFVLKI  211
DSSP  HHHHHHHHHHhhllllLEEEHHhhhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLL----llLHHHHHH


DSSP  HL-----lLEEEELLHHhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL-------------
Query AG-----aAGAISGSAIvkiieknlaspkqmlaelrsFVSAMKAASR-------------  255
ident                                             |               
Sbjct VInelplkCIFGTDMPF-------------------gDLQLSIEAIKkmsndsyvanavl  252
DSSP  HHhhllllEELLLLLLL-------------------lLHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhh


DSSP  ----------
Query ----------  255
ident           
Sbjct gdnisrllni  262
DSSP  lhhhhhhhll


No 3: Query=1bksA Sbjct=2oofA Z-score=8.5

back to top
DSSP  ------------------------------------------------lhhhhhhhhhhh
Query ------------------------------------------------meryenlfaqln   12
ident                                                             
Sbjct lncervwlnvtpatlrsdladygllephalgvhegrihalvpxqdlkypahwqdxkgklv   60
DSSP  lllleeeeeeeellllllllllllllleeeeeelleeeeeeehhhllllllleellllee


DSSP  HLLLLEEEEEEELL----------------------------------lLLHHHHHHHHH
Query DRREGAFVPFVTLG----------------------------------dPGIEQSLKIID   38
ident                                                      |      
Sbjct TPGLIDCHTHLIFAgsraeefelrqkgvpyaeiarkgggiistvratraASEDQLFELAL  120
DSSP  EELEEEEEELLLLLlllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLL------lLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHL
Query TLIDAG------aDALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKH   92
ident                   |                         |       |   |   
Sbjct PRVKSLiregvttVEIKSGYGL----------------------TLEDELKXLRVARRLG  158
DSSP  HHHHHHhhhleeeEEEELLLLL----------------------LHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L----LLLEEEE--ELHH-------hhHLLL-HHHHHHHHH-HHLLLEEEEL----LLLH
Query P----TIPIGLL--MYAN-------lvFNNG-IDAFYARCE-QVGVDSVLVA----DVPV  133
ident           ||                                  | | |         
Sbjct EalpiRVKTTLLaaHAVPpeyrddpdsWVETiCQEIIPAAAeAGLADAVDVFcehiGFSL  218
DSSP  HhlllEEEEEEEeeLLLLhhhlllhhhHHHHhHHLHHHHHHhLLLLLEEEEEelllLLLH


DSSP  HHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-LLLLhhHHHHHHHHLLLLEEELlllHHHHHHHHHHHL
Query EESAPFRQAALRHNIAPIFICP-PNADddLLRQVASYGRGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH  192
ident         ||     |                  |  |      |       |  |    
Sbjct AQTEQVYLAADQYGLAVKGHXDqLSNL-gGSTLAANFGALSVDHLeylDPEGIQALAHRG  277
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELlLLLL-lHHHHHHHLLLLEEEELlllLHHHHHHHHHHL


DSSP  LlLEEELLLLLL--------hhhhhhhhhhLLLEE-EELL-HHHHhhhhllllhhhhhhh
Query AaPALQGFGISS--------peqvsaavraGAAGA-ISGS-AIVKiieknlaspkqmlae  242
ident    |                            |                           
Sbjct V-VATLLPTAFYflketklppvvalrkagvPXAVSsDINPgTAPI---------------  321
DSSP  L-EEEELHHHHHhllllllllhhhhhhlllLEEELlLLLLlLLLL---------------


DSSP  hhhhhhhHHHLLL-----------------------------------------------
Query lrsfvsaMKAASR-----------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct ------vSLRXAXnxactlfgltpveaxagvtrhaaralgeqeqlgqlrvgxladflvwn  375
DSSP  ------lLHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhllhhhhhhllllllllllllllllleeeel


DSSP  ----------------------------
Query ----------------------------  255
ident                             
Sbjct cghpaelsyligvdqlvsrvvngeetlh  403
DSSP  lllllhhhhlllllleeeeeelleelll


No 4: Query=1bksA Sbjct=2pajA Z-score=8.5

back to top
DSSP  ----------------------------------------------lhhhhhhhhhhhHL
Query ----------------------------------------------meryenlfaqlnDR   14
ident                                                             
Sbjct pstlirnaaaimtggrgtaddpsrvpgpdirivgdtidaigalaprpgetivdatdcvIY   60
DSSP  leeeeellleelllllllllllllllllleeeelleeeeellllllllleeeelllleEE


DSSP  LLLEE-EEEEE---------lllLLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEELLLLlll
Query REGAF-VPFVT---------lgdPGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGVPFSdpl   58
ident                                                 |    |      
Sbjct PAWVNtHHHLFqsllkgepfralFDERRFRLAARIGLIELarsgcatVADHNYVYYP---  117
DSSP  ELEELlLLLHHhhhllllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHhllleeeEEELLLLLLL---


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllLHHHhhHHHHHHHHHLL----LLLEEEEELH-----------
Query adgptiqnanlrafaagvTPAQcfEMLALIREKHP----TIPIGLLMYA-----------  103
ident                            |   |                            
Sbjct ------------------GMPF--DSSAILFEEAEklglRFVLLRGGATqtrqleadlpt  157
DSSP  ------------------LLLL--LHHHHHHHHHHhlllEEEEEELLLLllllllllllh


DSSP  ---HHHHLlLHHHHHHHHHHHLL---------LEEEEL----LLLHHHLHHHHHHHHHLL
Query ---NLVFNnGIDAFYARCEQVGV---------DSVLVA----DVPVEESAPFRQAALRHN  147
ident             |   |                              |       | |  
Sbjct alrPETLD-AYVADIERLAARYHdaspramrrVVMAPTtvlySISPREMRETAAVARRLG  216
DSSP  hhlLLLHH-HHHHHHHHHHHHLLllllllleeEEELLLllllLLLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEEEEEELllllHHHHHHHHH----hlLLLEEELlLLHHHHHHHHHHhLLLLEEELlLLL
Query IAPIFICPpnadDDLLRQVAS----ygRGYTYLLaLPLHHLIEKLKEyHAAPALQGfGIS  203
ident                                  |       |  |              |
Sbjct LRMHSHLS---gKSPVAFCGEhdwlgsDVWYAHLvKVDADEIALLAQ-TGTGVAHC-PQS  271
DSSP  LEEEEELL---lLLHHHHHHHllllllLEEEELLlLLLHHHHHHHHH-HLLEEEEL-HHH


DSSP  LhhhhhhhHHHL-----lLEEEELlHHHHhhhhllllhhhhhhhhhHHHHhhHHLLL---
Query SpeqvsaaVRAG-----aAGAISGsAIVKiieknlaspkqmlaelrSFVSamKAASR---  255
ident         ||                                                  
Sbjct N---grlpVREMadagvpVSIGVD-GAAS----------------nEAAD--MISEVhmt  309
DSSP  H---hlllLLLHhhhlllEEELLL-HHHH----------------lLLLL--HHHHHhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct wlaqrarlasiaevihwgtaggarvmgldevgkvavgyaadiavyrlddpryfglhdpai  369
DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhlhhhhhhhllllllllllllllleeeeelllhhhlllllhhh


DSSP  ----------------------------------------------------
Query ----------------------------------------------------  255
ident                                                     
Sbjct gpvasggrpsvmalfsagkrvvvddliegvdikelggearrvvrellrevvv  421
DSSP  hhhhllllleeeeeeelleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 5: Query=1bksA Sbjct=3nqbA Z-score=8.4

back to top
DSSP  ----------------------lhhhhhhhhhhHHLL-----------------------
Query ----------------------meryenlfaqlNDRR-----------------------   15
ident                                   |                         
Sbjct epadlnddtlraravaaargdqrfdvlitggtlVDVVtgelrpadigivgaliasvhepa   60
DSSP  llhhhllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelleeELLLllleeeleeeeelleeeeeelll


DSSP  ------------------lLEEE-EEEElllllhhHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEELLll
Query ------------------eGAFV-PFVTlgdpgieQSLKIIDTLIDAGA-DALELGVPfs   55
ident                                                |            
Sbjct srrdaaqvidaggayvspgLIDThXHIE---ssxiTPAAYAAAVVARGVtTIVWDPHE--  115
DSSP  lllleeeeeelllleeeelEEEEeELHH---hhllLHHHHHHHHHLLLEeEEEELLHH--


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHL-lLLLEEEEELHHH-------hh
Query dpladgptiqnanlrafaagVTPAQCFEMLALIREKH-pTIPIGLLMYANL-------vf  107
ident                     |         |   |                         
Sbjct -----------------fgnVHGVDGVRWAAKAIENLplRAILLAPSCVPSapglergga  158
DSSP  -----------------hhhHHLHHHHHHHHHHHLLLllEEEEEELLLLLLlllllllll


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHLLLEE-EELL--LLHHH---LHHHHHHHHHLLLEEEEEELlLLLHH
Query NNGIDAFYARCEQVGVDSV-LVAD--VPVEE---SAPFRQAALRHNIAPIFICPpNADDD  161
ident                              |         || |                 
Sbjct DFDAAILADLLSWPEIGGIaEIXNxrGVIERdprXSGIVQAGLAAEKLVCGHAR-GLKNA  217
DSSP  LLLHHHHHHHHLLLLEEEEeEELLhhHHHLLlhhHHHHHHHHHHHLLEEEELLL-LLLHH


DSSP  HHHHHH-HHLLllEEEL---lLLHHHHHHHHhhhllLLEEELllLLLHHH--------hh
Query LLRQVA-SYGRgyTYLL---aLPLHHLIEKLkeyhaAPALQGfgISSPEQ--------vs  209
ident  |                     |                     |              
Sbjct DLNAFXaAGVS--SDHElvsgEDLXAKLRAG-----LTIELR--GSHDHLlpefvaalnt  268
DSSP  HHHHHHhLLLL--EELLlllhHHHHHHHHLL-----LEEEEE--LLLHHHhhhhhhhhhh


DSSP  hhhHHLLLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhHHHHhhHHHHHHLLL--------------
Query aavRAGAAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlAELRsfVSAMKAASR--------------  255
ident                                                             
Sbjct lghLPQTVTLCTDD-VFPD----------dlLQGG-gLDDVVRRLVryglkpewalraat  316
DSSP  hllLLLLEEEELLL-LLHH----------hhHHLL-lHHHHHHHHHhllllhhhhhhhhl


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct lnaaqrlgrsdlgliaagrradivvfedlngfsarhvlasgravaeggrxlvdiptcdtt  376
DSSP  hhhhhhhllllllllllllllleeeellllllleeeeeelleeeeelleelllllllllh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct vlkgsxklplrxandflvksqgakvrlatidrprftqwgeteadvkdgfvvppegatxis  436
DSSP  hhllllllllllhhhhllllllleeeeeeeellllleeeeeeeeeelleellllleeeee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct vthrhgxaepttktgfltgwgrwngafattvshdshnltvfggnagdxalaanavigtgg  496
DSSP  eellllllllleeeeeeellllllleeeelllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct gxavasegkvtailplplsglvsdapleevarafedlreavgkvvewqppylvfkacfga  556
DSSP  eeeeeelleeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhll


DSSP  -------------------------------
Query -------------------------------  255
ident                                
Sbjct tlacnigphqtdxgiadvltgkvxespviev  587
DSSP  lllllllleelllleeelllleeellleeel


No 6: Query=1bksA Sbjct=1a4mA Z-score=8.2

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllLEEE-EEEE-----------------------------------
Query meryenlfaqlndrreGAFV-PFVT-----------------------------------   24
ident                                                             
Sbjct ---------tpafnkpKVELhVHLDgaikpetilyfgkkrgialpadtveelrniigmdk   51
DSSP  ---------lllllllEEEEeEEHHhlllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllll


DSSP  ----------------llllLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEELLL-------L
Query ----------------lgdpGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGVPF-------S   55
ident                       |    |                                
Sbjct plslpgflakfdyympviagCREAIKRIAYEFVEMKakegvvyVEVRYSPHLlanskvdP  111
DSSP  lllhhhhhllhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHhhlleeeEEEEELLHHhllllllL


DSSP  LLLlllhhhhhhhhhhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLL-----LLLEEEEEL---HHHHH
Query DPLadgptiqnanlrafAAGVTPAQCFEMLALIREKHP-----TIPIGLLMY---ANLVF  107
ident  |                  |||                         |           
Sbjct MPW-----------nqtEGDVTPDDVVDLVNQGLQEGEqafgiKVRSILCCMrhqPSWSL  160
DSSP  LHH-----------hllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllEEEEEEEEElllHHHHH


DSSP  lllhhhHHHHHHHHL---LLEEEELL-----lLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEEELLL
Query nngidaFYARCEQVG---VDSVLVAD-----vPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFICPPN  157
ident           |       |     |                    |    |         
Sbjct -----eVLELCKKYNqktVVAMDLAGdetiegSSLFpgHVEAYEGAVKNGIHRTVHAGEV  215
DSSP  -----hHHHHHHHLLlllEEEEEEELllllllHHHLhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLL


DSSP  LLHHHHHHHHH--HLLLlEEEL--lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELLLL-----llhhhh
Query ADDDLLRQVAS--YGRGyTYLL--aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGFGI-----sspeqv  208
ident       |                       |   |                         
Sbjct GSPEVVREAVDilKTER-VGHGyhtIEDEALYNRLLKENM-HFEVCPWSsyltgawdpkt  273
DSSP  LLHHHHHHHHHllLLLE-EEELhhhHHLHHHHHHHHHLLL-EEEELHHHhhhllllllll


DSSP  hHHHHHL-----lLEEEELLHHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhhhhHHHL----------
Query sAAVRAG-----aAGAISGSAIVKIieknlaspkqmlaelrsfvsaMKAA----------  253
ident   ||                                                        
Sbjct tHAVVRFkndkanYSLNTDDPLIFK--------------------sTLDTdyqmtkkdmg  313
DSSP  lLHHHHHhhllllEEELLLLLLLLL--------------------lLHHHhhhhhhhlll


DSSP  ----------------------------------ll
Query ----------------------------------sr  255
ident                                     
Sbjct fteeefkrlninaakssflpeeekkellerlyreyq  349
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhll


No 7: Query=1bksA Sbjct=4cqbA Z-score=8.1

back to top
DSSP  --------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEE
Query --------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPF   22
ident                                                             
Sbjct skdfdliirnaylsekdsvydigivgdriikieakiegtvkdeidakgnlvspgfVDAHT   60
DSSP  llleeeeeeeeeelllleeeeeeeelleeeeeelllllleeeeeellllleeeleEEEEE


DSSP  EELLLLL-----------------------------------HHHHHHHHHHHHHLLL-L
Query VTLGDPG-----------------------------------IEQSLKIIDTLIDAGA-D   46
ident                                                         |   
Sbjct HMDKSFTstgerlpkfwsrpytrdaaiedglkyyknatheeiKRHVIEHAHMQVLHGTlY  120
DSSP  LHHHLLLlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhHHHHHHHHHHHHHLLEeE


DSSP  LEEEELlllllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLL---LLLEEEE-EL
Query ALELGVpfsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHP---TIPIGLL-MY  102
ident                                     |      |       |        
Sbjct TRTHVD--------------------vdsvAKTKAVEAVLEAKEELKdliDIQVVAFaQS  160
DSSP  EEEEEE--------------------llllLLLHHHHHHHHHHHHLLlllEEEEEEElLL


DSSP  HHhhHLLLHhHHHHHHHHHLLLEEEELLL-----LHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEE-EEL
Query ANlvFNNGIdAFYARCEQVGVDSVLVADV-----PVEE-SAPFRQAALRHNIAPIF-ICP  155
ident                    | | |   |       ||         |          |  
Sbjct GFfvDLESE-SLIRKSLDMGCDLVGGVDPatrenNVEGsLDLCFKLAKEYDVDIDYhIHD  219
DSSP  LLllLLLHH-HHHHHHHHHLLLEEELLLLlllllLHHHhHHHHHHHHHHLLLEEEEeELL


DSSP  LLLL-hHHHHHHHHH-------lLLLEEEL-------LLLHHHHhHHHHHHLLLLEEELl
Query PNAD-dDLLRQVASY-------gRGYTYLL-------ALPLHHLiEKLKEYHAAPALQGf  200
ident             |          |  |             |      |            
Sbjct IGTVgvYSINRLAQKtiengykgRVTTSHAwcfadapSEWLDEA-IPLYKDSGMKFVTC-  277
DSSP  LHHHhhHHHHHHHHHhhhlllllLEEEEELlhhhhllHHHHHHH-HHHHHHHLLEEEEE-


DSSP  lLLLHhhhhHHHHHL-----LLEEEELLH---hHHHHhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHH
Query gISSPeqvsAAVRAG-----AAGAISGSA---iVKIIeknlaspkqmlaelrsFVSAMKA  252
ident   ||       |          |  |       |                          
Sbjct -FSST-pptMPVIKLleagiNLGCASDNIrdfwVPFG--------------ngDMVQGAL  321
DSSP  -LLLL-lllLLHHHHhhlllEEEEELLLLllllLLLL--------------llLHHHHHH


DSSP  LLL---------------------------------------------------------
Query ASR---------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct IETqrlelktnrdlgliwkmitsegarvlgieknygievgkkadlvvlnslspqwaiidq  381
DSSP  HHHhhhllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllhhhlllllllllleeeellllhhhhhhhl


DSSP  ---------------------
Query ---------------------  255
ident                      
Sbjct akrlcvikngriivkdeviva  402
DSSP  lleeeeeelleeeeelleell


No 8: Query=1bksA Sbjct=2vunA Z-score=8.1

back to top
DSSP  -lhhhhhhhhhhHHLL--------------------------------------------
Query -meryenlfaqlNDRR--------------------------------------------   15
ident                                                             
Sbjct sktiiknigkivSGDIkspvlqadtivvedgliaaiggeelmkdagdatiidaagstvtp   60
DSSP  leeeeellleeeLLLLllleellleeeeelleeeeeelhhhhlllllleeeelllleeee


DSSP  llEEEEEEELllllhhhHHHH-----hhHHHHLL-----lLLEE-EELLllllllllhhh
Query egAFVPFVTLgdpgieqSLKI-----idTLIDAG-----aDALE-LGVPfsdpladgpti   64
ident                               |                             
Sbjct glLDTHVHVS-------GGDYaprqktmDFISSAlhggvtTMISaGSPH-----------  102
DSSP  leEEEEELLL-------LLLEehhhleeLHHHHHhllleeEEEElLLLL-----------


DSSP  hhhhhhhhhHLLL------hhhhHHHHHHHHHHL---lLLLEeEEELHHHHhlllHHHHH
Query qnanlrafaAGVT------paqcFEMLALIREKH---pTIPIgLLMYANLVfnngIDAFY  115
ident           |                                                 
Sbjct --------fPGRPkdaagtkalaITLSKSYYNARpagvKVHGgAVILEKGL----TEEDF  150
DSSP  --------lLLLLllhhhhhhhhHHHHHHHHHLLhhhlEEELlEELLLLLL----LHHHH


DSSP  HHHHHHLLLEEE---eLLLL-HHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELL------LLLHhhHHH
Query ARCEQVGVDSVL---vADVP-VEESAPFRQAALRHNIAPIFICPP------NADDdlLRQ  165
ident       ||  |           |  ||    |  |                         
Sbjct IEMKKEGVWIVGevglGTIKnPEDAAPMVEWAHKHGFKVQMHTGGtsipgsSTVT--ADD  208
DSSP  HHHHHLLLLEEEeellLLLLlHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLllllllLLLL--HHH


DSSP  HHHHLLLLEEEL----lllHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLllhhhhhhHHHHL------
Query VASYGRGYTYLL----alpLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGIsspeqvsaAVRAG------  215
ident |                                                           
Sbjct VIKTKPDVVSHInggptaiSVQEVDRIMDETDFAMEIVQCG-----npkIADYVarraae  263
DSSP  HHHHLLLEEELLlllllllLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL-----lhhHHHHHhhhhhh


DSSP  -----lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL---------------
Query -----aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfVSAMKAASR---------------  255
ident                                                             
Sbjct kgqlgrVIFGNDA-PSGT----------------glIPLGILRNMcqiasmsdidpevav  306
DSSP  hllhhhEEEELLL-LLLL----------------llLLLHHHHHHhhhhhhllllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct cmatgnstavyglntgviapgkeadliimdtplgsvaedamgaiaagdipgisvvlidge  366
DSSP  hhhlhhhhhhhlllllllllllllleeeeelllllllllhhhhhhhlllleeeeeeelle


DSSP  -------------------
Query -------------------  255
ident                    
Sbjct avvtksrntppakraakil  385
DSSP  eeellllllllllllleel


No 9: Query=1bksA Sbjct=1gkpA Z-score=7.9

back to top
DSSP  -------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLlEEEEEE
Query -------------------------------------meryenlfaqlnDRREgAFVPFV   23
ident                                                             
Sbjct pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyVFPGfIDPHVH   60
DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleEEELeEEEEEL


DSSP  eLLLLlhhhhhHHHH-HHHHLL------lLLEEEELLLLllllllhhhhhhhhhhhhhll
Query tLGDPgieqslKIID-TLIDAG------aDALELGVPFSdpladgptiqnanlrafaagv   76
ident            |    |   |                                       
Sbjct iYLPF-matfaKDTHeTGSKAAlmggtttYIEMCCPSRN--------------------d   99
DSSP  lLLEE-lleelLLLHhHHHHHHhhlleeeEEEEELLLLL--------------------l


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHL--lLLLEEEEELHhhHHLLlHHHHHHHHHHHLLLEEEEL-----
Query TPAQCFEMLALIREKH--pTIPIGLLMYAnlVFNNgIDAFYARCEQVGVDSVLVA-----  129
ident              |                                 |  |         
Sbjct DALEGYQLWKSKAEGNsycDYTFHMAVSK--FDEK-TEGQLREIVADGISSFXIFlsykn  156
DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLlllEEEEEEELLL--LLLL-HHHHHHHHHHLLLLEEEEEellll


DSSP  --LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-----------------------------lLL
Query --DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP-----------------------------pNA  158
ident    |   |       |          |                                 
Sbjct ffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVE  216
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHH


DSSP  LHhHHHHHHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELllLLLHH---
Query DDdLLRQVASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgISSPE---  206
ident         |         ||   |                            |       
Sbjct AE-GTARFATFLettgaTGYVVHL--sCKPALDAAMAAKargvpIYIESV--IPHFLldk  271
DSSP  HH-HHHHHHHHHhhhllEEEELLL--lLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEE--HHHHHllh


DSSP  --------------------------hhHHHHH-HLLLEEEELlhHHHHhhhLLLLH---
Query --------------------------qvSAAVR-AGAAGAISGsaIVKIiekNLASP---  236
ident                               |                             
Sbjct tyaerggveamkyimspplrdkrnqkvlWDALAqGFIDTVGTD--HCPF---DTEQKllg  326
DSSP  hhhhllhhhhhlllllllllllhhhhhhHHHHHlLLLLEEELL--LLLL---LHHHHhhh


DSSP  ---hhhhhhhhhHHHHHHHLLL--------------------------------------
Query ---kqmlaelrsFVSAMKAASR--------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct keaftaipngipAIEDRVNLLYtygvsrgrldihrfvdaastkaaklfglfprkgtiavg  386
DSSP  lllhhhllllllLLLLHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct sdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekg  446
DSSP  lllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllll


DSSP  ------------
Query ------------  255
ident             
Sbjct wgkllrrepmyf  458
DSSP  llllllllllll


No 10: Query=1bksA Sbjct=2imrA Z-score=7.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLL----------------------------------------lleEE
Query meryenlfaqlNDRR----------------------------------------egaFV   20
ident                                                             
Sbjct htprlltcdvlYTGAqspggvvvvgetvaaaghpdelrrqyphaaeeragaviapppvNA   60
DSSP  lleeeeeeleeELLEelleeeeeelleeeeeelhhhhhhhlllleeeellleelllllEE


DSSP  EEEEL-----------------------lLLLHHHHHHHHHHHHHLL-LLLEEEELllll
Query PFVTL-----------------------gDPGIEQSLKIIDTLIDAG-ADALELGVpfsd   56
ident                                |        |||   |             
Sbjct HTHLDmsayefqalpyfqwipevvirgrhLRGVAAAQAGADTLTRLGaGGVGDIVW----  116
DSSP  EEELLllhhhhhhlhhhhllhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEL----


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHhHHHLllLLEEEEELHH------hhHLLL
Query pladgptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALiREKHptIPIGLLMYAN------lvFNNG  110
ident                             |   ||             |            
Sbjct ---------------------APEVMDALLA-REDL--SGTLYFEVLNpfpdkadeVFAA  152
DSSP  ---------------------LHHHHHHHHL-LLLL--LEEEEEEELLllhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL----LLEEEEL---LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL--------
Query IDAFYARCEQVG----VDSVLVA---DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP--------  155
ident       |                    |           |                    
Sbjct ARTHLERWRRLErpglRLGLSPHtpfTVSHRLMRLLSDYAAGEGLPLQIHVAehptelem  212
DSSP  HHHHHHHHHLLLllleEEEEEELlllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELllhhhhhh


DSSP  --------------------------------llLLHHHHH-HHHHHLLlLEEELllLHH
Query --------------------------------pnADDDLLR-QVASYGRgYTYLLalPLH  182
ident                                       |    |                
Sbjct frtgggplwdnrmpalyphtlaevigrepgpdltPVRYLDElGVLAARP-TLVHMvnVTP  271
DSSP  hhhlllllhhhllhhhllllhhhhhlllllllllHHHHHHHhLLHHHLL-EEEELllLLH


DSSP  HHHHHHHHHLlLLEEELlLLLL-hhhhhHHHHHL-----lLEEEELLhHHHHhhhllllh
Query HLIEKLKEYHaAPALQGfGISS-peqvsAAVRAG-----aAGAISGSaIVKIieknlasp  236
ident   |                             |             |             
Sbjct DDIARVARAG-CAVVTCpRSNHhlecgtFDWPAFaaagveVALGTDS-VASG--------  321
DSSP  HHHHHHHHHL-LLEEELhHHHHhlllllLLHHHHhhllllEEELLLL-HHHH--------


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHLLL-----------------------------------------
Query kqmlaelrsFVSAMKAASR-----------------------------------------  255
ident           |       |                                         
Sbjct ------etlNVREEVTFARqlypgldprvlvraavkggqrvvgtpflrrgetwqegfrwe  375
DSSP  ------lllLLHHHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhlhh


DSSP  -----
Query -----  255
ident      
Sbjct lsrdl  380
DSSP  hllll


No 11: Query=1bksA Sbjct=1k6wA Z-score=7.7

back to top
DSSP  -------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLLEEE-EE
Query -------------------------------------meryenlfaqlnDRREGAFV-PF   22
ident                                                             
Sbjct alqtiinarlpgeeglwqihlqdgkisaidaqsgvmpitensldaeqglVIPPFVEPhIH   60
DSSP  llleeeeellllllleeeeeeelleeeeeeeellllllllleeelllleEELLEEEEeEL


DSSP  EE--------------------------lllLLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEE
Query VT--------------------------lgdPGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALEL   50
ident                                                             
Sbjct LDttqtagqpnwnqsgtlfegierwaerkalLTHDDVKQRAWQTLKWQiangiqhVRTHV  120
DSSP  LLlllllllllllllllhhhhhhhhhllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHhhlleeeEEEEE


DSSP  ELlllllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLL---LLLEEEE-ELHHhh
Query GVpfsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHP---TIPIGLL-MYANlv  106
ident  |                                               |          
Sbjct DV----------------------sdATLTALKAMLEVKQEVApwiDLQIVAFpQEGIls  158
DSSP  EL----------------------llLLLHHHHHHHHHHHHHLlllEEEEEEElLLLLll


DSSP  HLLLHhhHHHHHHHHLLLEEEELL-------lLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEE-EELLLL
Query FNNGIdaFYARCEQVGVDSVLVAD-------vPVEESAPFRQAALRHNIAPIF-ICPPNA  158
ident   ||           | | |             ||        |                
Sbjct YPNGE-aLLEEALRLGADVVGAIPhfeftreyGVESLHKTFALAQKYDRLIDVhCDEIDD  217
DSSP  LLLHH-hHHHHHHHLLLLEEEELHhhlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEeELLLLL


DSSP  L-hHHHHHHHHHL-------LLLEEEL------lllhhhhhHHHHHHLLLLEEELLLL--
Query D-dDLLRQVASYG-------RGYTYLL------alplhhliEKLKEYHAAPALQGFGI--  202
ident         ||          |                      |                
Sbjct EqsRFVETVAALAhhegmgaRVTASHTtamhsyngaytsrlFRLLKMSGINFVANPLVni  277
DSSP  LllLHHHHHHHHHhhhllhhHEEEEELhhhhhllhhhhhhhHHHHHHHLLEEEELHHHhh


DSSP  --------llhhhhhhhHHHL-----lLEEEELLHHHHHhhhllllhhhhhhhhhHHHHh
Query --------sspeqvsaaVRAG-----aAGAISGSAIVKIieknlaspkqmlaelrSFVSa  249
ident                  |                                          
Sbjct hlqgrfdtypkrrgitrVKEMlesginVCFGHDDVFDPW-------------yplGTAN-  323
DSSP  hhlllllllllllllllHHHHhhllllEEELLLLLLLLL-------------lllLLLL-


DSSP  hHHLL-------------------------------------------------------
Query mKAAS-------------------------------------------------------  254
ident                                                             
Sbjct -MLQVlhmglhvcqlmgygqindglnlithhsartlnlqdygiaagnsanliilpaengf  382
DSSP  -HHHHhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhllllllllllllllleeeellllhh


DSSP  ----------------------------------------l
Query ----------------------------------------r  255
ident                                          
Sbjct dalrrqvpvrysvrggkviastqpaqttvyleqpeaidykr  423
DSSP  hhhhhllllleeeelleeeeellllleeeellleeeellll


No 12: Query=1bksA Sbjct=2uz9A Z-score=7.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLL---------------------------------------------
Query meryenlfaqlNDRR---------------------------------------------   15
ident                                                             
Sbjct plahifrgtfvHSTWtcpmevlrdhllgvsdsgkivfleeasqqeklakewcfkpceire   60
DSSP  llleeeeeeeeELLLlllleeeeeeeeeellllleeeeeehhhhhhhhhhhlllhhheee


DSSP  ---------llEEEEEEELLLL------------------------------lHHHHHHH
Query ---------egAFVPFVTLGDP------------------------------gIEQSLKI   36
ident                                                       |     
Sbjct lshheffmpglVDTHIHASQYSfagssidlpllewltkytfpaehrfqnidfaEEVYTRV  120
DSSP  llllleeeeleEEEEEEHHHHHhllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLL-LLEEEELlllllllllhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHLllL
Query IDTLIDAGA-DALELGVpfsdpladgptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALIREKHptI   95
ident        |   |                                                
Sbjct VRRTLKNGTtTACYFAT-----------------------ihTDSSLLLADITDKFG-qR  156
DSSP  HHHHHHLLEeEEEEELL-----------------------llHHHHHHHHHHHHHHL-lE


DSSP  LEEEEELHH---------hhHLLLHHHHHHHHHHHL-------LLEEEEL---LLLHHHL
Query PIGLLMYAN---------lvFNNGIDAFYARCEQVG-------VDSVLVA---DVPVEES  136
ident                         |                     |             
Sbjct AFVGKVCMDlndtfpeyketTEESIKETERFVSEMLqknysrvKPIVTPRfslSCSETLM  216
DSSP  EEEELEELLlllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllleEEEEEELlhhHLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEEEL------------lllLHHHHHHHH--HHLL--LLEEELlll
Query APFRQAALRHNIAPIFICP------------pnaDDDLLRQVA--SYGR--GYTYLLalp  180
ident       |                                                     
Sbjct GELGNIAKTRDLHIQSHISenrdeveavknlypsYKNYTSVYDknNLLTnkTVMAHGcyl  276
DSSP  HHHHHHHHHHLLEEEEEELllhhhhhhhhhhlllLLLHHHHHHhlLLLLllEEEEELlll


DSSP  HHHHHHHHHHhLLLLEEELlLLLL-hhhhhHHHHHL-----lLEEEEL--LHHHhhhhhl
Query LHHLIEKLKEyHAAPALQGfGISS-peqvsAAVRAG-----aAGAISG--SAIVkiiekn  232
ident          |   |                  |          |                
Sbjct SAEELNVFHE-RGASIAHCpNSNLslssgfLNVLEVlkhevkIGLGTDvaGGYS------  329
DSSP  LHHHHHHHHH-HLLEEEELhHHHHhlllllLLHHHHhhllleEEELLLllLLLL------


DSSP  lllhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL-------------------------------------
Query laspkqmlaelrsFVSAMKAASR-------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct ------------ySMLDAIRRAVmvsnillinkvneksltlkevfrlatlggsqalgldg  377
DSSP  ------------lLHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhlhhhhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct eignfevgkefdailinpkasdspidlfygdffgdiseaviqkflylgddrnieevyvgg  437
DSSP  lllllllllllleeeelllllllllllllhhhhlllllhhhhhhhhhllhhheeeeeell


DSSP  -------
Query -------  255
ident        
Sbjct kqvvpfs  444
DSSP  eeeelll


No 13: Query=1bksA Sbjct=3mkvA Z-score=7.6

back to top
DSSP  -------------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLL
Query -------------------------------------------meryenlfaqlnDRREG   17
ident                                                             
Sbjct lttflfrngalldpdhpdllqgfeiliedgfirevsdkpikssnahvidvkgktiMPGLI   60
DSSP  lleeeeeeeeelllllllleeeeeeeeelleeeeeellllllllleeeelllleeEELEE


DSSP  EeEEEEE--------lLLLLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEEllllllllllhh
Query AfVPFVT--------lGDPGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGvpfsdpladgpt   63
ident      |                           |             |            
Sbjct DlHVHVVaiefnlprvATLPNVLVTLRAVPIMRAMlrrgfttVRDAGG------------  108
DSSP  EeEELLLlllllhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhlleeeEEELLL------------


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHLL-------LLLEE-EEELHH-----------
Query iqnanlrafaagvtpaqcfemLALIREKHP-------TIPIG-LLMYAN-----------  104
ident                                                             
Sbjct --------------------aGYPFKQAVEsglvegpRLFVSgRALSQTgghadprarsd  148
DSSP  --------------------lLHHHHHHHHlllllllEEEELlLEEELLlllllllllll


DSSP  -------------------HHHL-LLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL---------------
Query -------------------LVFN-NGIDAFYARCEQVGVDSVLVA---------------  129
ident                                    | | |                    
Sbjct ymppdspcgccvrvgalgrVADGvDEVRRAVREELQMGADQIXIMasggvasptdpvgvf  208
DSSP  llllllllllllllllleeELLLhHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEElllllllllllllll


DSSP  LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLlhhHHHHHH-HHLLlLEEELlllHHHHHHHH
Query DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNAdddLLRQVA-SYGRgYTYLLalpLHHLIEKL  188
ident      |       |              |             |                 
Sbjct GYSEDEIRAIVAEAQGRGTYVLAHAYTPA---AIARAVrCGVR-TIEHGnliDDETARLV  264
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLHH---HHHHHHhLLLL-EEEELlllLHHHHHHH


DSSP  HHHLLlLEEELLLLLL----------------------------hhhhhhhhhhlLLEEe
Query KEYHAaPALQGFGISS----------------------------peqvsaavragAAGAi  220
ident  |  |                                                       
Sbjct AEHGA-YVVPTLVTYDalasegekyglppesiakiadvhgaglhsieimkragvkMGFG-  322
DSSP  HHHLL-EEELLHHHHHhhhhhlllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhlllLLLL-


DSSP  ELLHHhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHhHLLL-------------------------
Query SGSAIvkiieknlaspkqmlaelrsFVSAMkAASR-------------------------  255
ident                                                             
Sbjct TDLLG-------------------eAQRLQ-SDEFrilaevlspaeviasativsaevlg  362
DSSP  LLLLH-------------------hHHHHL-LHHHhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhll


DSSP  ----------------------------------------------------
Query ----------------------------------------------------  255
ident                                                     
Sbjct mqdklgrivpgahadvlvvdgnplksvdcllgqgehiplvmkdgrlfvnele  414
DSSP  llllllllllllllleeeellllllllllllllllllleeeelleeeeelll


No 14: Query=1bksA Sbjct=3ls9A Z-score=7.6

back to top
DSSP  ------------------------------------------lhhhhhhhhhhhhlllle
Query ------------------------------------------meryenlfaqlndrrega   18
ident                                                             
Sbjct milirgltrvitfddqereledadilidgpkivavgkdlsdrsvsrtidgrgmialpgli   60
DSSP  leeeeeeeeeellllllleeeeeeeeeelleeeeeellllllllleeeellleeeeelee


DSSP  EEEEEELLLL------------------------------------lHHHHHHHHHHHHH
Query FVPFVTLGDP------------------------------------gIEQSLKIIDTLID   42
ident                                                 |           
Sbjct NSHQHLYEGAmraipqlervtmaswlegvltrsagwwrdgkfgpdviREVARAVLLESLL  120
DSSP  EEEELHHHHHhlllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLL-LLEEEELLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHLL-LLLEEEE
Query AGA-DALELGVPFSDpladgptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALIREKHP-TIPIGLL  100
ident  |          |                                               
Sbjct GGItTVADQHLFFPG-------------------atADSYIDATIEAATDLGiRFHAARS  161
DSSP  LLEeEEEEEELLLLL-------------------llLLLHHHHHHHHHHHHLlEEEEEEL


DSSP  ELH-------------HHHHLlLHHHHHHHHHHHL---------LLEEEEL---LLLHHH
Query MYA-------------NLVFNnGIDAFYARCEQVG---------VDSVLVA---DVPVEE  135
ident                                                           | 
Sbjct SMTlgkseggfcddlfVEPVD-RVVQHCLGLIDQYhepepfgmvRIALGPCgvpYDKPEL  220
DSSP  LLLllhhhlllllhhhLLLHH-HHHHHHHHHHHHHlllllllleEEEELLLlllLLLHHH


DSSP  LHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-LLLL--------HHHHHHHHHH----lLLLEEELlllHH
Query SAPFRQAALRHNIAPIFICP-PNAD--------DDLLRQVASY----gRGYTYLLalpLH  182
ident    | | |             |               |          |           
Sbjct FEAFAQMAADYDVRLHTHFYePLDAgmsdhlygMTPWRFLEKHgwasdRVWLAHAvvpPR  280
DSSP  HHHHHHHHHHHLLEEEEEELlLLHHhhhhhhhlLLHHHHHHHLlllllLEEEEELlllLH


DSSP  HHHHHHHHhLLLLEEEL-lLLLLhhhhhHHHHHL-----lLEEEELLhHHHHHhhllllh
Query HLIEKLKEyHAAPALQG-fGISSpeqvsAAVRAG-----aAGAISGSaIVKIIeknlasp  236
ident   |                         |  |         |                  
Sbjct EEIPEFAD-AGVAIAHLiaPDLRmgwglAPIREYldagitVGFGTTG-SASND-------  331
DSSP  HHHHHHHH-HLLEEEELhhHHHHlllllLLHHHHhhllleEEELLLL-LLLLL-------


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHLLL-----------------------------------------
Query kqmlaelrsFVSAMKAASR-----------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct -------ggNLLGDLRLAAlahrpadpnepekwlsarellrmatrgsaeclgrpdlgvle  384
DSSP  -------llLHHHHHHHHHhhlhhhllllhhhlllhhhhhhhllhhhhhhllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct egraadiacwrldgvdrvgvhdpaiglimtglsdraslvvvngqvlvenerpvladleri  444
DSSP  lllllleeeeelllhhhlllllhhhhhhhlllllllleeeelleeeeelleellllhhhh


DSSP  ---------
Query ---------  255
ident          
Sbjct vanttalip  453
DSSP  hhhhhhhll


No 15: Query=1bksA Sbjct=3giqA Z-score=7.6

back to top
DSSP  -lhhhhhhhhhhHHLL-----------------------------------------lle
Query -meryenlfaqlNDRR-----------------------------------------ega   18
ident              |                                              
Sbjct ekldfkitggwiIDGTgaprrradlgvrdgriaaigelgahparhawdasgkivapgfid   60
DSSP  lleeeeeelleeLLLLlllleeleeeeelleeeeeelllllleeeeeelllleeeeleee


DSSP  eEEEEELllllhhHHHHHhHHHHHL--LLLLEEE---------elllLLLLLLLhHHHHh
Query fVPFVTLgdpgieQSLKIiDTLIDA--GADALEL---------gvpfSDPLADGpTIQNa   67
ident       |                                            |        
Sbjct vHGHDDL----mfVEKPD-LRWKTSqgITTVVVGncgvsaapaplpgNTAAALA-LLGE-  113
DSSP  lLLLLLL----hhHHLLL-LHHHHLllEEEEEELlllllllllllllLLLHHHH-HHLL-


DSSP  hhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHH--llLLLEEEEEL-HHHHHL------------LLHH
Query nlrafaagVTPAQCFEMLALIREK--hpTIPIGLLMY-ANLVFN------------NGID  112
ident            |      |                     |                   
Sbjct -------tPLFADVPAYFAALDAQrpmiNVAALVGHAnLRLAAMrdpqaaptaaeqQAMQ  166
DSSP  -------lLLLLLHHHHHHHHHHLllllEEEEEEEHHhHHHHHLllllllllhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEL-----LLLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEEE--LLLLLHHHH
Query AFYARCEQVGVDSVLVA-----DVPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFIC--PPNADDDLL  163
ident          |                           |                      
Sbjct DMLQAALEAGAVGFSTGlayqpGAVAQAaeLEGLARVAAERRRLHTSHIrnEADGVEAAV  226
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEElllllHHHLLHhhHHHHHHHHHHLLLEEEEELllLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHL-----LLLEEEL-----LLLHhhHHHHHHHHL--------lLLEEEllllllh
Query RQVASYG-----RGYTYLL-----ALPLhhLIEKLKEYH--------aAPALQgfgissp  205
ident   |   |                                                     
Sbjct EEVLAIGrgtgcATVVSHHkcmmpQNWG--RSRATLANIdrareqgveVALDI-------  277
DSSP  HHHHHHHhhhllEEEELLLllllhHHLL--LHHHHHHHHhhhhhllllEEEEE-------


DSSP  hHHHH-------------------------------------------------------
Query eQVSA-------------------------------------------------------  210
ident                                                             
Sbjct -YPYPgsstiliperaetiddiritwstphpecsgeyladiaarwgcdkttaarrlapag  336
DSSP  -LLLLeeeeellhhhllllllleeeeelllhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhllee


DSSP  ---------hHHHL-----LLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL-
Query ---------aVRAG-----AAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfVSAMKAASR-  255
ident           |              |                                  
Sbjct aiyfamdedeVKRIfqhpcCMVGSDGL-PNDA-------------rphprLWGSFTRVLg  382
DSSP  eeeelllhhhHHHHhhlllEEELLLLL-LLLL-------------llllhHHHHHHHHHh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct ryvrearlmtleqavarmtalparvfgfaergvlqpgawadvvvfdpdtvadratwdept  442
DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhlhhhhhhhllllllllllllllleeeelllllllllllllll


DSSP  ---------------------------------
Query ---------------------------------  255
ident                                  
Sbjct lasvgiagvlvngaevfpqppadgrpgqvlrax  475
DSSP  llllleeeeeelleeeellllllllllllllll


No 16: Query=1bksA Sbjct=4b3zD Z-score=7.6

back to top
DSSP  --------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEE
Query --------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPF   22
ident                                                          |  
Sbjct drllikggriinddqslyadvyledglikqigenlivpggvktieangrmvipggIDVNT   60
DSSP  leeeeeeeeeelllleeeeeeeeelleeeeeellllllllleeeelllleeeeleEEEEE


DSSP  EelLLLLhhHHHHHHHHHHH---LLLLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHH
Query VtlGDPGieQSLKIIDTLID---AGADALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPA   79
ident                                                             
Sbjct Y-lQKTA-aDDFFQGTRAALvggTTMIIDHVVPEP--------------------gsSLL   98
DSSP  L-lLLLL-lLLHHHHHHHHHhllEEEEEEEELLLL--------------------llLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHH--llLLLEEEEELHHhhHLLLHhHHHHHHHH-HLLLEEEEL-------
Query QCFEMLALIREK--hpTIPIGLLMYANlvFNNGIdAFYARCEQ-VGVDSVLVA-------  129
ident   ||                                      |  || |  |        
Sbjct TSFEKWHEAADTksccDYSLHVDITSW--YDGVR-EELEVLVQdKGVNSFQVYmaykdvy  155
DSSP  HHHHHHHHHHHLllllEEEEEEELLLL--LLLHH-HHHHHHHHlLLLLEEEEElllllll


DSSP  LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-----------------------------LLLLH
Query DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP-----------------------------PNADD  160
ident                                                             
Sbjct QMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAEngdliaqeqkrilemgitgpeghalsrpeELEAE  215
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLlhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllhHHHHH


DSSP  hHHHHHHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELllLLLHHH----
Query dLLRQVASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgISSPEQ----  207
ident                  |                                  |       
Sbjct -AVFRAITIAgrincPVYITKV--mSKSAADIIALARkkgplVFGEPI--AASLGTdgth  270
DSSP  -HHHHHHHHHhhhllLEEEEEE--lLHHHHHHHHHHHhhlllEEEEEL--HHHHHLllhh


DSSP  ------------------------hhhHHHHL----LLEEEELlhHHHHhhhLLLLH---
Query ------------------------vsaAVRAG----AAGAISGsaIVKIiekNLASP---  236
ident                                          ||           |     
Sbjct ywsknwakaaafvtspplspdpttpdyLTSLLacgdLQVTGSG--HCPY---STAQKavg  325
DSSP  hhlllhhhhhhllllllllllllhhhhHHHHHhhllLLLLLLL--LLLL---LHHHHhhh


DSSP  ---hhhhhhhhhHHHHHHHLLL--------------------------------------
Query ---kqmlaelrsFVSAMKAASR--------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct kdnftlipegvnGIEERMTVVWdkavatgkmdenqfvavtstnaakifnlyprkgriavg  385
DSSP  lllhhhllllllLLLLHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct sdadvviwdpdklktitakshksaveynifegmechgsplvvisqgkivfedgninvnkg  445
DSSP  lllleeeeeeeeeeelllllllllllllllllleeeeeeeeeeelleeeeelleelllll


DSSP  --------------------------------
Query --------------------------------  255
ident                                 
Sbjct mgrfiprkafpehlyqrvkirnkvfglqgvsr  477
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll


No 17: Query=1bksA Sbjct=4dlfA Z-score=7.5

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleEEEEEElLLLL---------------hhhHHHHHHHHHHLL-
Query meryenlfaqlndrregaFVPFVTlGDPG---------------ieqSLKIIDTLIDAG-   44
ident                                                       |  |  
Sbjct --------------alriDSHQHF-WRYRaadypwigagmgvlardyLPDALHPLMHAQa   45
DSSP  --------------llleEEEELL-LLLLhhhllllllllhhhllllLHHHHHHHHHHLl


DSSP  --llLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhlllhHHHHHHHHHhhHHLLlLLEEEeEL
Query --adALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvtpAQCFEMLALirEKHPtIPIGLlMY  102
ident                                     |   |      |            
Sbjct lgasIAVQARAG--------------------rdetAFLLELACD--EARI-AAVVG-WE   81
DSSP  lleeEEELLLLL--------------------hhhhHHHHHHHLL--LLLE-EEEEE-LL


DSSP  HHhhhLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEELL-------lLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEE
Query ANlvfNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVAD-------vPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFI  153
ident              |                       |     |                
Sbjct DL--rAPQLAERVAEWRGTKLRGFRHQLqdeadvraFVDDadFARGVAWLQANDYVYDVL  139
DSSP  LL--lLLLHHHHHHLLLLLLEEEEEELHhhlllhhhHHHLhhHHHHHHHHHHLLLEEEEL


DSSP  ELLLLLHHHHHHHHHH--lLLLEEEL--------------llLHHHHHHHHHHHLLLLEE
Query CPPNADDDLLRQVASY--gRGYTYLL--------------alPLHHLIEKLKEYHAAPAL  197
ident        |     |                                    |         
Sbjct VFERQLPDVQAFCARHdahWLVLDHAgkpalaefdrddtalaRWRAALRELAALPHVVCK  199
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLlllLEEEHHHhlllhhhllllllhhhHHHHHHHHHHLLLLEEEE


DSSP  ELLLLL-----------lHHHHHHHHHHL-------lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhh
Query QGFGIS-----------sPEQVSAAVRAG-------aAGAISGSaIVKIieknlaspkqm  239
ident                            |             |    |             
Sbjct LSGLVTeadwrrglrasdLRHIEQCLDAAldafgpqrLMFGSDW-PVCL-----------  247
DSSP  ELLLLLlllllllllhhhHHHHHHHHHHHhhhhlhhhEEELLLL-LHHH-----------


DSSP  hhhhhhHHHHHHHLLL---------------------------
Query laelrsFVSAMKAASR---------------------------  255
ident                                            
Sbjct ---laaSYDEVASLVErwaesrlsaaersalwggtaarcyalp  287
DSSP  ---hllLHHHHHHHHHhhhhhhllhhhhhhhllhhhhhhllll


No 18: Query=1bksA Sbjct=1yrrB Z-score=7.5

back to top
DSSP  -------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEE
Query -------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPFV   23
ident                                                         |   
Sbjct yaltqgriftgheflddhavviadgliksvcpvaelppeieqrslngailspgfIDVQLN   60
DSSP  leeelleeelllleelleeeeeelleeeeeeehhhlllllleeelllleeeeleEEEEEL


DSSP  -----ELLLLLhHHHH-HHHHHHHHLL-----lLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhh
Query -----TLGDPGiEQSL-KIIDTLIDAG-----aDALELGVPFsdpladgptiqnanlraf   72
ident         |   |            |         |                        
Sbjct gcggvQFNDTA-EAVSvETLEIMQKANeksgctNYLPTLITT------------------  101
DSSP  eelleELLLLL-LLLLhHHHHHHHHHHhllleeEEEEEELLL------------------


DSSP  hhllLHHHHHHHHHHHHHHLL----LLLE-EEEELHhhhhlLLHHHHHHHHHHhLLLEEE
Query aagvTPAQCFEMLALIREKHP----TIPI-GLLMYAnlvfnNGIDAFYARCEQvGVDSVL  127
ident                 ||             |              |           | 
Sbjct ----SDELMKQGVRVMREYLAkhpnQALGlHLEGPW---lnAALVDFLCENAD-VITKVT  153
DSSP  ----LHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLeEEELLL---llLHHHHHHHHLHH-HEEEEE


DSSP  EllLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEellLLLHHHHHHHHHHLLlLEEE----LLLL---
Query VadVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFIcppNADDDLLRQVASYGRgYTYL----LALP---  180
ident     |    |          |        ||           |                 
Sbjct L--APEMVPAEVISKLANAGIVVSAG-hsNATLKEAKAGFRAGItFATHlynaMPYItgr  210
DSSP  E--LHHHLLHHHHHHHHHHLLEEEEL-llLLLHHHHHHHHHHLEeEELLllllLLLLlll


DSSP  hhhhHHHHHHHLLLLEEElllLLLHHH-hhhhHHHL------lLEEEELLHhhhhhhhll
Query lhhlIEKLKEYHAAPALQgfgISSPEQ-vsaaVRAG------aAGAISGSAivkiieknl  233
ident                      |           |                          
Sbjct epglAGAILDEADIYCGI---IADGLHvdyanIRNAkrlkgdkLCLVTDAT---------  258
DSSP  llhhHHHHHHLLLLEEEE---ELLLLLllhhhHHHHhhhhhhhEEEELLLL---------


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHLLL--------------------------------------
Query aspkqmlaelrsfvsaMKAASR--------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct -----------sgsslTMIEGVrnlvehcgialdevlrmatlyparaigvekrlgtlaag  307
DSSP  -----------lllllLHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhlhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ---------------------------
Query ---------------------------  255
ident                            
Sbjct kvanltaftpdfkitktivngnevvtq  334
DSSP  lllleeeellllleeeeeelleeeeel


No 19: Query=1bksA Sbjct=1itqA Z-score=7.4

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLLllEEEEEEEL---LLLLHHH---------hhhhhhHHHHLL----
Query meryenlfaqlNDRRegAFVPFVTL---GDPGIEQ---------slkiidTLIDAG----   44
ident                              |                    | |       
Sbjct -dffrdeaeriMRDSpvIDGHNDLPwqlLDMFNNRlqderanlttlagthTNIPKLragf   59
DSSP  -lhhhhhhhhhHLLLleEEEEELHHhhhHHHHLLLlllhhhlllllllllLLHHHHhhll


DSSP  -lLLEEE-ELLLLLLllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHH-----HLLL---
Query -aDALEL-GVPFSDPladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIRE-----KHPT---   94
ident           |                                                 
Sbjct vgGQFWSvYTPCDTQ-------------nkdavrRTLEQMDVVHRMCRmypetFLYVtss  106
DSSP  eeEEEEEeLLLHHHL-------------lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhllllEEELllh


DSSP  -------------LLEEEEElHHHHHllLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL------------
Query -------------IPIGLLMyANLVFnnGIDAFYARCEQVGVDSVLVA------------  129
ident                ||                     | |                   
Sbjct agirqafregkvaSLIGVEG-GHSID--SSLGVLRALYQLGMRYLTLThscntpwadnwl  163
DSSP  hhhhhhhhllleeEEEEEEL-HHHLL--LLHHHHHHHHHLLEEEEELLllllllllllhh


DSSP  ---------llLHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEEEelllllhhHHHHHHHHL--LLLEEEL
Query ---------dvPVEE-SAPFRQAALRHNIAPIFIcppnadddLLRQVASYG--RGYTYLL  177
ident                          |                                  
Sbjct vdtgdsepqsqGLSPfGQRVVKELNRLGVLIDLA---hvsvaTMKATLQLSraPVIFSHS  220
DSSP  hllllllllllLLLHhHHHHHHHHHHHLLEEELL---lllhhHHHHHHHHLllLLEELLL


DSSP  ---------lllHHHHHHHHHHhLLLLEEELLL--------llLHHHHHHHHHHL-----
Query ---------alpLHHLIEKLKEyHAAPALQGFG--------isSPEQVSAAVRAG-----  215
ident                     |          |              ||            
Sbjct saysvcasrrnvPDDVLRLVKQ-TDSLVMVNFYnnyisctnkaNLSQVADHLDHIkevag  279
DSSP  llllllllllllLHHHHHHHHH-HLLEEEELLLhhhhllllllLHHHHHHHHHHHhhhll


DSSP  --lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhHHHHHhHHLLL------------------
Query --aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrSFVSAmKAASR------------------  255
ident     |                            ||                         
Sbjct araVGFGGDF-DGVP----------rvpeglEDVSK-YPDLIaellrrnwteaevkgala  327
DSSP  hhhEEELLLL-LLLL----------llllllLLLLL-HHHHHhhhhhllllhhhhhhhhl


DSSP  ------------------------------------------
Query ------------------------------------------  255
ident                                           
Sbjct dnllrvfeaveqasnltqapeeepipldqlggscrthygyss  369
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhlllllllllllll


No 20: Query=1bksA Sbjct=4mupB Z-score=7.4

back to top
DSSP  -lhhhhhhhhhhhhlllleeEEEEELL------------lllhHHHHHHHHHHHHLL--l
Query -meryenlfaqlndrregafVPFVTLG------------dpgiEQSLKIIDTLIDAG--a   45
ident                                                     |       
Sbjct lvrklsgtapnpafprgavdTQMHMYLpgypalpggpglppgaLPGPEDYRRLMQWLgid   60
DSSP  lllllllllllllllllleeLLLLLLLllllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHlll


DSSP  LLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHlllllEEEEElhhh
Query DALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKhptipIGLLMyanl  105
ident                                         |   |               
Sbjct RVIITQGNA-------------------hqrDNGNTLACVAEMGEA----aHAVVI---i   94
DSSP  EEEEELLHH-------------------hllLLHHHHHHHHHHHHH----eEEEEL---l


DSSP  HHLLLhHHHHHHHHHHLLLEEEEL-----LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLH
Query VFNNGiDAFYARCEQVGVDSVLVA-----DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADD  160
ident                 |             |   |       |             |   
Sbjct DATTT-EKDMEKLTAAGTVGARIMdlpggAVNLSELDAVDERAHAADWMVAVQFDGNGLL  153
DSSP  LLLLL-HHHHHHHHHLLEEEEEEElllllLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH-lLLLEEEL----LLLHH--HHHHHHHHHL---lLLEEELLLL-----lLH
Query DLLRQVASY-gRGYTYLL----ALPLH--HLIEKLKEYH---aAPALQGFGI-----sSP  205
ident | |        |                      |                        |
Sbjct DHLPRLQKIrsRWVFDHHgkffKGIRTdgPEMAALLKLIdrgnLWFKFAGVYessrksWP  213
DSSP  HHHHHHHLLllEEEELHHhhllLLLLLllHHHHHHHHHHhhllEEEEELLHHhlllllLL


DSSP  HH-hHHHHHHL------lLEEEELLHHHHHhhHLLLlhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL---
Query EQ-vSAAVRAG------aAGAISGSAIVKIieKNLAspkqmlaelrsFVSAMKAASR---  255
ident      |  |                          |                        
Sbjct YAdvAAFSRVIaahaperIVWGTNWPHNSV--RETA--------aypDDARLAELTLgwl  263
DSSP  LHhhHHHHHHHhhhlhhhEEELLLLLLLLL--LLHH--------hllLHHHHHHHHHlll


DSSP  -----------------------
Query -----------------------  255
ident                        
Sbjct pdeaarhralvenpealfklspv  286
DSSP  llhhhhhhhhlhhhhhhhlllll


No 21: Query=1bksA Sbjct=3griA Z-score=7.2

back to top
DSSP  --------------------------------------lhhhhhhhhhhhhlllleeEEE
Query --------------------------------------meryenlfaqlndrregafVPF   22
ident                                                             
Sbjct xklikngkvlqngelqqadilidgkvikqiapaiepsngvdiidakghfvspgfvdvHVH   60
DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeeelleeeeeellllllllleeeelllleeeeleeeeEEL


DSSP  EE-LLLLLhhhHHHHHHHHHHLL---lLLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllH
Query VT-LGDPGieqSLKIIDTLIDAG---aDALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagvtP   78
ident     |                 |                                     
Sbjct LRePGGEY-keTIETGTKAAARGgfttVCPXPNTR--------------------pvpdS   99
DSSP  LLlLLLLL-llLHHHHHHHHHHLleeeEEELLLLL--------------------llllL


DSSP  HHHHHHHHHHHHH--llLLLEEEE---ELHHhhhllLHHHhHHHHHHHLLLEEEEL--LL
Query AQCFEMLALIREK--hpTIPIGLL---MYANlvfnnGIDAfYARCEQVGVDSVLVA--DV  131
ident    || |                                         |          |
Sbjct VEHFEALQKLIDDnaqvRVLPYASittRQLG----kELVD-FPALVKEGAFAFTDDgvGV  154
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhlllEELLLEEllhHHLL----lLLLL-HHHHHLLLLLLEEELllLL


DSSP  LHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEEEEL--------------------------LLLLHhHHH
Query PVEE-SAPFRQAALRHNIAPIFICP--------------------------PNADDdLLR  164
ident             |   | |    |                                    
Sbjct QTASxXYEGXIEAAKVNKAIVAHCEdnsliyggaxhegkrskelgipgipnICESV-QIA  213
DSSP  LLHHhHHHHHHHHHHHLLLEEELLLlhhhllllleellhhhhhhllleellHHHHH-HHH


DSSP  HHHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELlllllhhHHHH-----
Query QVASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgisspeQVSA-----  210
ident                                         |                   
Sbjct RDVLLAeaagcHYHVCHV--sTKESVRVIRDAKragihVTAEVT------pHHLLltedd  265
DSSP  HHHHHHhhhllLEEELLL--lLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEL------hHHHHllhhh


DSSP  ----------------------hHHHL----LLEEEELlHHHHhhHHLLLL-hhhhhhhh
Query ----------------------aVRAG----AAGAISGsAIVKiiEKNLAS-pkqmlael  243
ident                                                             
Sbjct ipgnnaiykxnpplrstedrealLEGLldgtIDCIATD-HAPH--ARDEKAqpxekapfg  322
DSSP  lllllhhhllllllllhhhhhhhHHHHhlllLLEELLL-LLLL--LHHHHLlllllllll


DSSP  hhHHHHHHHLL-------------------------------------------------
Query rsFVSAMKAAS-------------------------------------------------  254
ident                                                             
Sbjct ivGSETAFPLLythfvkngdwtlqqlvdyltikpcetfnleygtlkengyadltiidlds  382
DSSP  llLLLLHHHHHhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhllllllllllllllleeeeelll


DSSP  ---------------------------------------l
Query ---------------------------------------r  255
ident                                         
Sbjct eqeikgedflskadntpfigykvygnpiltxvegevkfeg  422
DSSP  leellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeel


No 22: Query=1bksA Sbjct=2ffiA Z-score=7.1

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleeEEEEElLLLLHH------------hHHHHHHHHHHLL--ll
Query meryenlfaqlndrregafVPFVTlGDPGIE------------qSLKIIDTLIDAG--ad   46
ident                             |                |        |     
Sbjct ------------lhltaidSHAHV-FSRGLNlasqrryapnydaPLGDYLGQLRAHgfsh   47
DSSP  ------------llllleeLLLLL-LLHHHHhhlllllllllllLHHHHHHHHHHLllle


DSSP  LEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHhhlLLLLEEEeELHHhh
Query ALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIRekhPTIPIGLlMYANlv  106
ident        |                              |                     
Sbjct GVLVQPSF-------------------lgtDNRYLLSALQTVP---GQLRGVV-XLER--   82
DSSP  ELLLLLHH-------------------hllLLHHHHHHHHHLL---LLLLLLL-LLLL--


DSSP  hllLHHHHHHHHHHHLLLEEEELL-----lLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLl
Query fnnGIDAFYARCEQVGVDSVLVAD-----vPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFICPPNAd  159
ident       |  |     ||  |                  |                     
Sbjct --dVEQATLAEXARLGVRGVRLNLxgqdxpDLTGaqWRPLLERIGEQGWHVELHRQVAD-  139
DSSP  --lLLHHHHHHHHLLLLLEEELLLllllllLLLLllLHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLL-


DSSP  hhhHHHHHHH----lLLLEEEL----------LLLHHHHHHhhHHHL-LLLEEELLLL--
Query ddlLRQVASY----gRGYTYLL----------ALPLHHLIEklKEYH-AAPALQGFGI--  202
ident       |                               |                     
Sbjct --iPVLVRALqpyglDIVIDHFgrpdarrglgQPGFAELLT--LSGRgKVWVKVSGIYrl  195
DSSP  --hHHHHHHHlllllLEEELHHhlllllllllLLLHHHHLL--LLLLlLEEEEEELHHhl


DSSP  -----llhhhhHHHHHHL-------lLEEEELLHHHHHhhhllllhhhhhhhhhhHHHHH
Query -----sspeqvSAAVRAG-------aAGAISGSAIVKIieknlaspkqmlaelrsFVSAM  250
ident              |  |             |                             
Sbjct qgspeenlafaRQALCALeahygaerLXWGSDWPHTQH-------------esevSFGSA  242
DSSP  lllhhhhhhhhHHHHHHHhhhllhhhEEEELLLLLLLL-------------llllLHHHH


DSSP  HHLLL--------------------------
Query KAASR--------------------------  255
ident                                
Sbjct VEQFEalgcsaqlrqallldtaralfgfele  273
DSSP  HHHHHhhlllhhhhhhhhlhhhhhhllllll


No 23: Query=1bksA Sbjct=3dcpA Z-score=7.1

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllLLEE-EEEEeLLLLlhhhhHHHHHHHHHLL------lLLEEEELL
Query meryenlfaqlndrrEGAF-VPFVtLGDPgieqsLKIIDTLIDAG------aDALELGVP   53
ident                                                            |
Sbjct ---------------XKRDgHTHTeFCPH---gtHDDVEEXVLKAieldfdeYSIVEHAP   42
DSSP  ---------------LLEEeEELLlLLLL---llLLLHHHHHHHHhhlllleEEEEEELL


DSSP  LLL----lllllhHHHHHhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLL------LLLEEEEELH
Query FSD----pladgpTIQNAnlrafaagVTPAQCFEMLALIREKHP------TIPIGLLMYA  103
ident  |                                                 | ||     
Sbjct LSSefxkntagdkEAVTT------asXAXSDLPYYFKKXNHIKKkyasdlLIHIGFEVDY   96
DSSP  LLHhhhhllllllHHHHL------llLLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllEEEEEEEEEL


DSSP  HhhHLLLHHHHHHHHHHhLLLEEEELL---------------------------------
Query NlvFNNGIDAFYARCEQvGVDSVLVAD---------------------------------  130
ident           |         |                                       
Sbjct LigYEDFTRDFLNEYGP-QTDDGVLSLhflegqggfrsidfsaedynegivqfyggfeqa  155
DSSP  LllLHHHHHHHHHHHHH-HLLEEEEELleeeelleeeellllhhhhhhhlhhhhllhhhh


DSSP  -----lLHHH--LHHHhhhhhHLLLEEEE-EELL--------------------llLHHH
Query -----vPVEE--SAPFrqaalRHNIAPIF-ICPP--------------------naDDDL  162
ident        |     |                                              
Sbjct qlayleGVKQsiEADL-----GLFKPRRXgHISLcqkfqqffgedtsdfseevxekFRVI  210
DSSP  hhhhhhHHHHhhHLLL-----LLLLLLEElLLLHhhllhhhhlllhhhllhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHH-HHLLllEEEL-----------lllHHHHHHHHHHHLLLlEEEL----lllllhh
Query LRQVA-SYGRgyTYLL-----------alpLHHLIEKLKEYHAApALQG----fgisspe  206
ident |  |                                   |        |           
Sbjct LALVKkRDYE--LDFNtaglfkplcgetypPKKIVTLASELQIP-FVYGsdshgvqdigr  267
DSSP  HHHHHhHLLE--EEEElhhhhlllllllllLHHHHHHHHHLLLL-EEEElllllhhhlll


DSSP  HHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query QVSAAVRAGaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident   |                                              
Sbjct GYSTYCQKL---------------------------------------e  277
DSSP  LHHHHHHHL---------------------------------------l


No 24: Query=1bksA Sbjct=4rdvB Z-score=7.1

back to top
DSSP  ----------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLLEE-EEEEE-
Query ----------------------------------meryenlfaqlnDRREGAF-VPFVT-   24
ident                                                             
Sbjct saifaerallpegwarnvrfeisadgvlaeirpdanadgaerlggaVLPGMPNlHSHAFq   60
DSSP  leeeeeeeeelleeeeeeeeeellllleeeeelllllllleellllEEELEEEeEELHHh


DSSP  ---------------------------lllLLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEE
Query ---------------------------lgdPGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELG   51
ident                                  ||   |   |            |    
Sbjct ramaglaevagnpndsfwtwrelmyrmvarLSPEQIEVIACQLYIEMlkagytaVAEFHY  120
DSSP  hhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhleeeEEEEEL


DSSP  LLllllllllhhhhhhhhhhhhHLLLHH-HHHHHHHHHHHHLL----LLLEEEEELH---
Query VPfsdpladgptiqnanlrafaAGVTPA-QCFEMLALIREKHP----TIPIGLLMYA---  103
ident |                               |    |                 |    
Sbjct VH------------------hdLDGRSYaDPAELSLRISRAASaagiGLTLLPVLYShag  162
DSSP  LL------------------llLLLLLLlLLLHHHHHHHHHHHhhllEEEEEELLLLeee


DSSP  -------------HHHHlllhHHHHHHHHHHL--------lLEEEEL---LLLHHHLHHH
Query -------------NLVFnngiDAFYARCEQVG--------vDSVLVA---DVPVEESAPF  139
ident                       |                            |     |  
Sbjct fggqpasegqrrfINGS----EAYLELLQRLRapleaaghsLGLCFHslrAVTPQQIATV  218
DSSP  llleellhhhlllLLLH----HHHHHHHHHHHhhhhhhlleELEEELlllLLLHHHHHHH


DSSP  HHHhHHLLLEEEEEEL--------------lLLLHHHHH-HHHHhlLLLEEELlLLHHHH
Query RQAaLRHNIAPIFICP--------------pNADDDLLR-QVASygRGYTYLLaLPLHHL  184
ident   |                                 |         |             
Sbjct LAA-GHDDLPVHIHIAeqqkevddcqawsgrRPLQWLYEnVAVD-qRWCLVHAtHADPAE  276
DSSP  HLL-LLLLLLEEEEELllhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHhLLLL-lLEEEEELlLLLHHH


DSSP  HHHHHHhLLLLEEEL-lLLLL-----hhhhhhhhhhllLEEEELLHhhhhhhhllllhhh
Query IEKLKEyHAAPALQG-fGISS-----peqvsaavragaAGAISGSAivkiieknlaspkq  238
ident          | |                           |  | |               
Sbjct VAAMAR-SGAVAGLClsTEANlgdgifpatdflaqggrLGIGSDSH--------------  321
DSSP  HHHHHH-HLLEEEELhhHHHHlllllllhhhhhhllleEEELLLLL--------------


DSSP  hhhhhhhHHHHhHHLLL-------------------------------------------
Query mlaelrsFVSAmKAASR-------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct -------VSLS-VVEELrwleygqrlrdrkrnrlyrddqpmigrtlydaalaggaqalgq  373
DSSP  -------LLLL-HHHHHhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct pigslavgrradllvldgndpylasaegdallnrwlfaggdrqvrdvmvagrwvvrdgrh  433
DSSP  lllllllllllleeeellllhhhhllllhhhhhhhhhhllhhheeeeeelleeeelllll


DSSP  ------------------
Query ------------------  255
ident                   
Sbjct ageersarafvqvlgell  451
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhl


No 25: Query=1bksA Sbjct=4c5yA Z-score=6.9

back to top
DSSP  ----------------------------------------------lhhhhhhhhhhhhL
Query ----------------------------------------------meryenlfaqlndR   14
ident                                                             
Sbjct deakvtiiyagllipgdgeplrnaalvisdkiiafvgseadipkkylrstqsthrvpvlM   60
DSSP  lllleeeeeeeeellllllleeeeeeeeelleeeeeeehhhllhhhhhhllleeeeeeeE


DSSP  LLLEE-EEEEeLLLL------------LHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEEllll
Query REGAF-VPFVtLGDP------------GIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGvpfs   55
ident             ||                 |                       |    
Sbjct PGLWDcHMHF-GGDDdyyndytsglatHPASSGARLARGCWEAlqngytsYRDLAG----  115
DSSP  ELEEEeEELL-LLLLllllllhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHhhlleeeEEELLL----


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHLL-------LLLEE-EEELHH---
Query dpladgptiqnanlrafaagvtpaqcfeMLALIREKHP-------TIPIG-LLMYAN---  104
ident                                                             
Sbjct ----------------------------YGCEVAKAINdgtivgpNVYSSgAALSQTagh  147
DSSP  ----------------------------LHHHHHHHHHlllllllEEEELlLEEELLlll


DSSP  --------------HHHL------------------LLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL---
Query --------------LVFN------------------NGIDAFYARCEQVGVDSVLVA---  129
ident                                                  |     |    
Sbjct gdifalpagevlgsYGVMnprpgywgagplciadgvEEVRRAVRLQIRRGAKVIXVMasg  207
DSSP  lllllllhhhhhhhHLLLllllllllllleeelllhHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEElll


DSSP  ----------llLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLlhhHHHHHH-HHLLlLEEE
Query ----------dvPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFICPPNAdddLLRQVA-SYGRgYTYL  176
ident                          | | |          |                   
Sbjct gvmsrddnpnfaQFSPeeLKVIVEEAARQNRIVSAHVHGKA---GIMAAIkAGCK-SLEH  263
DSSP  llllllllllllLLLHhhHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLHH---HHHHHHhHLLL-EEEE


DSSP  LlllHHHHHHHHHHhLLLLEEELLLLLL---------------------hhhhhhhHHHL
Query LalpLHHLIEKLKEyHAAPALQGFGISS---------------------peqvsaaVRAG  215
ident          |  ||                                              
Sbjct VsyaDEEVWELMKE-KGILYVATRSVIEiflasngeglvkeswaklqaladshlkaYQGA  322
DSSP  LlllLHHHHHHHHH-HLLEEELLHHHHHhhhhhllllllllhhhlllhhhhhhhhhHHHH


DSSP  -----lLEEEELLhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhHHHL-----------------
Query -----aAGAISGSaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsaMKAA-----------------  253
ident                                          |                  
Sbjct ikagvtIALGTDT----------------------apggPTALelqfaverggmtpleai  360
DSSP  hhllllEELLLLL----------------------llllLLHHhhhhhhhlllllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  253
ident                                                             
Sbjct kaatanaplsvgpqapltgqlregyeadvialeenpledikvfqepkavthvwkggklfk  420
DSSP  hhhlllhhhhhhhhlllllllllllllleeeelllllllhhhhhlhhheeeeeelleeee


DSSP  --------------ll
Query --------------sr  255
ident                 
Sbjct gpgigpwgedarnpfl  436
DSSP  llllllllllllllll


No 26: Query=1bksA Sbjct=1j6pA Z-score=6.9

back to top
DSSP  ------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEEE
Query ------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPFVT   24
ident                                                             
Sbjct hhxiignclilkdfssepfwgaveiengtikrvlqgevkvdldlsgklvxpalFNTHTHA   60
DSSP  leeeeeeeeelllllllleeeeeeeelleeeeeeelllllleellleeeeeleEEEEELH


DSSP  LLLL-----------------------------lHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEELll
Query LGDP-----------------------------gIEQSLKIIDTLIDAGA-DALELGVpf   54
ident                                                 |           
Sbjct PXTLlrgvaedlsfeewlfskvlpiedrltekxaYYGTILAQXEXARHGIaGFVDXYF--  118
DSSP  HHHHhllllllllhhhhhhllhhhhhllllhhhhHHHHHHHHHHHHLLLEeEEEEEEL--


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHLlLLLEEEEELHH--hhHLLLHh
Query sdpladgptiqnanlrafaagvtpaQCFEMLALIREKHpTIPIGLLMYAN--lvFNNGId  112
ident                                   |                         
Sbjct -------------------------HEEWIAKAVRDFG-XRALLTRGLVDsngdDGGRL-  151
DSSP  -------------------------LHHHHHHHHHHHL-LEEEEEEEELLllllLLLHH-


DSSP  HHHHH-HHHHL------LLEEEEL---LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL----LLL
Query AFYAR-CEQVG------VDSVLVA---DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP----PNA  158
ident                                |        |   |               
Sbjct EENLKlYNEWNgfegriFVGFGPHspyLCSEEYLKRVFDTAKSLNAPVTIHLYetskEEY  211
DSSP  HHHHHhHHHHLlhhhleEEEEEELlllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELllllLLL


DSSP  L-HHHHHHhHHHLLLLEEELlllHHHHHHHHHhHLLLLEEELlLLLL-hhhhhHHHHHL-
Query D-DDLLRQvASYGRGYTYLLalpLHHLIEKLKeYHAAPALQGfGISS-peqvsAAVRAG-  215
ident |  | |                        ||                     | |    
Sbjct DlEDILNIgLKEVKTIAAHCvhlPERYFGVLK-DIPFFVSHNpASNLklgngiAPVQRXi  270
DSSP  LlHHHHLLlLLLLLEEEEELlllLHHHHHHHL-LLLEEEEELhHHHHhlllllLLHHHHh


DSSP  ----lLEEEELLhHHHHHhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL----------------
Query ----aAGAISGSaIVKIIeknlaspkqmlaelrsFVSAMKAASR----------------  255
ident                                                             
Sbjct ehgxkVTLGTDG-AASNN--------------slNLFFEXRLASllqkaqnprnldvntc  315
DSSP  hllleEEELLLL-LLLLL--------------llLHHHHHHHHHhhhhllllllllhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct lkxvtydgaqaxgfksgkieegwnadlvvidldlpexfpvqniknhlvhafsgevfatxv  375
DSSP  hhhhlhhhhhhhlllllllllllllleeeeelllhhhllhhhhhhhhhhllllllleeee


DSSP  --------------------------------
Query --------------------------------  255
ident                                 
Sbjct agkwiyfdgeyptidseevkrelariekelys  407
DSSP  lleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 27: Query=1bksA Sbjct=1onxA Z-score=6.7

back to top
DSSP  ----------------------------------------------lhhhhhhhhhhhhl
Query ----------------------------------------------meryenlfaqlndr   14
ident                                                             
Sbjct midytaagftllqgahlyapedrgicdvlvangkiiavasnipsdivpnctvvdlsgqil   60
DSSP  llllhhhlleeeeeeeeellleeeeeeeeeelleeeeeellllllllllleeeellllee


DSSP  llleeEEEEELLL-------llhhHHHHhHHHHHHLLLLLEEEEL--LLLLlllllhhhh
Query regafVPFVTLGD-------pgieQSLKiIDTLIDAGADALELGV--PFSDpladgptiq   65
ident         | |                     |  ||                       
Sbjct cpgfiDQHVHLIGgggeagpttrtPEVA-LSRLTEAGVTSVVGLLgtDSIS---------  110
DSSP  eeleeEEEELLLLllllllhhhllLLLL-HHHHHHLLEEEEEELLllLLLL---------


DSSP  hhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLllLLEEEEE---lHHHHhLLLHHHHHHHHhhHL
Query nanlrafaagVTPAQCFEMLALIREKHptIPIGLLM---yANLVfNNGIDAFYARCeqVG  122
ident             |           |        |                   |      
Sbjct ----------RHPESLLAKTRALNEEG-iSAWMLTGayhvPSRTiTGSVEKDVAII--DR  157
DSSP  ----------LLHHHHHHHHHHHHHHL-lEEEEEEEllllLLLLlLLLHHHHHHHL--LL


DSSP  LLEEEEL------llLHHH-LHHHHHHHHHLL------LEEEEEELLLLLhhhHHHH---
Query VDSVLVA------dvPVEE-SAPFRQAALRHN------IAPIFICPPNADddlLRQV---  166
ident |  |  |        |     |                    |          |      
Sbjct VIGVXCAisdhrsaaPDVYhLANMAAESRVGGllggkpGVTVFHMGDSKK--aLQPIydl  215
DSSP  EEEEEEEelllllllLLHHhHHHHHHHHHHHHhhhlllLEEEEEELLLLL--lLHHHhhh


DSSP  ------hHHLLlLEEEL--lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELlLLLL-hhHHHHHHHHL--
Query ------aSYGRgYTYLL--aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGfGISS-peQVSAAVRAG--  215
ident                      ||                                     
Sbjct lencdvpISKL-LPTHVnrnVPLFEQALEFARKGG-TIDIT-SSIDepvAPAEGIARAvq  272
DSSP  hhlllllHHHE-EEELHhhlHHHHHHHHHHHHLLL-LEEEE-LLLLlllLHHHHHHHHhh


DSSP  ------lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL--------------
Query ------aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfVSAMKAASR--------------  255
ident            |                                                
Sbjct agiplarVTLSSDG-NGSQ--pffddegnlthigvagFETLLETVQvlvkdydfsisdal  329
DSSP  llllhhhEEEELLL-LLEE--eeellllleeeeeellLHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct rpltssvagflnltgkgeilpgndadllvmtpelrieqvyargklmvkdgkacvkgtfet  389
DSSP  hhhlhhhhhhlllllllllllllllleeeellllleeeeeelleeeeelleellllllll


DSSP  -
Query -  255
ident  
Sbjct d  390
DSSP  l


No 28: Query=1bksA Sbjct=4qrnA Z-score=6.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEEELLL---------------------------------
Query meryenlfaqlndrregAFVPFVTLGD---------------------------------   27
ident                                                             
Sbjct -smtqdlktggeqgylrIATEEAFATReiidvylrmirdgtadkgmvslwgfyaqspser   59
DSSP  -llllllllllllllllEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ----llhhHHHH-HHHHHHH--LLLLLEEEE---LLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhllL
Query ----pgieQSLK-IIDTLID--AGADALELG---VPFSDpladgptiqnanlrafaagvT   77
ident           |        |      |                                 
Sbjct atqilerlLDLGeRRIADMDatGIDKAILALtspGVQPL------------hdldeartL  107
DSSP  hhhhhhhhHLLLhHHHHHHHhlLLLEEEEEElllLLLLL------------llhhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEELHHHHHllLHHHHHHHHH-HHLLLEEEELLL----
Query PAQCFEMLALIREKHPT-IPIGLLMYANLVFnnGIDAFYARCE-QVGVDSVLVADV----  131
ident        ||    | |                        |     |             
Sbjct ATRANDTLADACQKYPDrFIGMGTVAPQDPE--WSAREIHRGArELGFKGIQINSHtqgr  165
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLlEEELLLLLLLLHH--HHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLllll


DSSP  LHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEE----------------------eLLLL-lhhHHHHH
Query PVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFI----------------------cPPNA-dddLLRQV  166
ident    |    |   |                                          |||  
Sbjct YLDEefFDPIFRALVEVDQPLYIHpatspdsmidpmleagldgaifgFGVEtgmhLLRLI  225
DSSP  LLLLhhHHHHHHHHHHHLLLEEELlllllllllhhhhhhlllllllhHHHHhhhhHHHHH


DSSP  -------hhhlLLLEEEllllhhHHHHH-------------------------hhHHLL-
Query -------asygRGYTYLlalplhHLIEK-------------------------lkEYHA-  193
ident                         |                              |    
Sbjct tigifdkypslQIMVGH---mgeALPYWlyrldymhqagvrsqryermkplkktiEGYLk  282
DSSP  hhlhhhhllllLEEELH---hhhLHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhHHHHh


DSSP  --LLEEELLllllhhHHHH-HHHHL-------lLEEEELLHHhhhhhhllllhhhhhhhh
Query --APALQGFgisspeQVSA-AVRAG-------aAGAISGSAIvkiieknlaspkqmlael  243
ident                     |                                       
Sbjct snVLVTNSG------VAWEpAIKFCqqvmgedrVMYAMDYPY------------------  318
DSSP  hlEEEELLL------LLLHhHHHHHhhhhlhhhEELLLLLLL------------------


DSSP  hhHHHHHHHLLL-----------------------
Query rsFVSAMKAASR-----------------------  255
ident    |     |                         
Sbjct -qYVADEVRAMDamdmsaqtkkkffqtnaekwfkl  352
DSSP  -lLLHHHHHHHHlllllhhhhhhhhlhhhhhhlll


No 29: Query=1bksA Sbjct=2ob3A Z-score=6.6

back to top
DSSP  ------lhhhhhhHHHHhhlllleeEEEEE-----------llLLLHHHHHHHHHHHHHL
Query ------meryenlFAQLndrregafVPFVT-----------lgDPGIEQSLKIIDTLIDA   43
ident               |                                             
Sbjct drintvrgpitisEAGF-----tltHEHICgssagflrawpefFGSRKALAEKAVRGLRR   55
DSSP  lleeelleeelhhHHLL-----eeeEELLEellllhhhhlhhhHLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LL------LLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhHHHHHHHHL----l
Query GA------DALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagvtpaqcfeMLALIREKH----p   93
ident                                                  |  |       
Sbjct ARaagvrtIVDVSTFD---------------------------igrDVSLLAEVSraadv   88
DSSP  HHhlllleEEELLLHH---------------------------hllLHHHHHHHHhhhll


DSSP  LLLEEEEELHHH------hhllLHHHHHHHHHH-------HLLLEEEELL-----lLHHH
Query TIPIGLLMYANL------vfnnGIDAFYARCEQ-------VGVDSVLVAD-----vPVEE  135
ident  |                        |  |  |              ||         | 
Sbjct HIVAATGLWFDPplsmrlrsveELTQFFLREIQygiedtgIRAGIIXVATtgkatpFQEL  148
DSSP  EEELEEELLLLLlhhhhlllhhHHHHHHHHHHHlllllllLLLLEEEEELlllllhHHHH


DSSP  -LHHHHHHHHHLLLEEEEEE-LLLLlhhHHHHHHHH--------lLLLEEEL-llLHHHH
Query -SAPFRQAALRHNIAPIFIC-PPNAdddLLRQVASY--------gRGYTYLL-alPLHHL  184
ident        | |                     | |           |              
Sbjct vLKAAARASLATGVPVTTHTaASQR---DGEQQAAIfeseglspsRVCIGHSddtDDLSY  205
DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLEEEELlHHHL---HHHHHHHHhhhllllhhHEEELLHhhlLLHHH


DSSP  HHHHHHHLLlLEEELlLLLL-------------------hHHHHHHHHHL-------lLE
Query IEKLKEYHAaPALQGfGISS-------------------pEQVSAAVRAG-------aAG  218
ident    |             |                              |           
Sbjct LTALAARGY-LIGLD-HIPYsaiglednasasallgirswQTRALLIKALidqgymkqIL  263
DSSP  HHHHHHLLL-EEEEL-LLLLllllllllhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHhhlllhhhEE


DSSP  EEELL------hhhhHHHHllllhhhhhhhhHHHHHHHHHLLL-----------------
Query AISGS------aivkIIEKnlaspkqmlaelRSFVSAMKAASR-----------------  255
ident                |                                            
Sbjct VSNDWtfgfssyvtnIMDV-------mdrvnPDGMAFIPLRVIpflrekgvpqetlagit  316
DSSP  ELLLLlleellllllHHHH-------hhhhlLLHHHHHHHLHHhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  -------------
Query -------------  255
ident              
Sbjct vtnparflsptlr  329
DSSP  lhhhhhhhlllll


No 30: Query=1bksA Sbjct=3pnuA Z-score=6.6

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEEELLlllHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLllll
Query meryenlfaqlndrregAFVPFVTLGdpgIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDplad   60
ident                                    |          |             
Sbjct --enlyfqsnamklknpLDMHLHLRD---NQMLELIAPLSARDFCAAVIMPNLIPP----   51
DSSP  --llllllllleeeellEEEEELLLL---HHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLLLL----


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHH----hhllLLLEEEEELHhhhhlllHHHHHH
Query gptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALIR----ekhpTIPIGLLMYAnlvfnngIDAFYA  116
ident                            |         |    |              |  
Sbjct --------------lcnLEDLKAYKMRILkackdenfTPLMTLFFKN------yDEKFLY   91
DSSP  --------------lllHHHHHHHHHHHHhhhlllllEEEEEEELLL------lLHHHHH


DSSP  HHHHhLLLEEEEL-----------LLLHH--HLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL--------
Query RCEQvGVDSVLVA-----------DVPVE--ESAPFRQAALRHNIAPIFICP--------  155
ident                                   |   |    ||               
Sbjct SAKD-EIFGIXLYpagittnsnggVSSFDieYLKPTLEAMSDLNIPLLVHGEtndfvmdr  150
DSSP  HHLL-LLLEEEELlllllllllllLLLLLhhHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLllllhhhl


DSSP  LLLLHHHHHHHHHH---lLLLEEELlllHHHHHHHHHHHLLLLEEELlllllhhHHHH--
Query PNADDDLLRQVASY---gRGYTYLLalpLHHLIEKLKEYHAAPALQGfgisspeQVSA--  210
ident            |                   | | || |    |                
Sbjct ESNFAKIYEKLAKHfprlKIVMEHI--tTKTLCELLKDYENLYATIT------lHHLIit  202
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHllllLEEELLL--lLHHHHHHHHHLLLEEEEEL------lHHHLll


DSSP  --------------------------hHHHL------lLEEEELLHhhhHHHHllllhhh
Query --------------------------aVRAG------aAGAISGSAivkIIEKnlaspkq  238
ident                                           | ||      |       
Sbjct lddviggkmnphlfckpiakryedkeaLCELafsgyekVMFGSDSA---PHPK-------  252
DSSP  hhhhhlllllhhhllllllllhhhhhhHHHHhhlllllEEELLLLL---LLLL-------


DSSP  hhhhhhhHHHHHHHLLL-------------------------------------------
Query mlaelrsFVSAMKAASR-------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct gcaagvfSAPVILPVLAelfkqnsseenlqkflsdntckiydlkfkedkiltleekewqv  312
DSSP  lllllllLHHHHHHHHHhhhhhhllhhhhhhhhlhhhhhhhlllllllleeeeellleel


DSSP  --------------------------
Query --------------------------  255
ident                           
Sbjct pnvyedkynqvvpymageilkfqlkh  338
DSSP  llleelllleellllllleelleell


No 31: Query=1bksA Sbjct=1bf6A Z-score=6.5

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleeeeEEEL------------lLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLE
Query meryenlfaqlndrregafvpFVTL------------gDPGIEQSLKIIDTLIDAGADAL   48
ident                                                    |   |    
Sbjct ----------sfdptgytlahEHLHidlsgfknnvdcrLDQYAFICQEMNDLMTRGVRNV   50
DSSP  ----------lllllleeeeeELLLeelhhhhllhhheELLHHHHHHHHHHHHHLLEEEE


DSSP  EEellLLLLllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhHHHHHHHHHHHlllllEEEEELH-----
Query ELgvpFSDPladgptiqnanlrafaagvtpaqCFEMLALIREKhptipIGLLMYA-----  103
ident                                                             
Sbjct IEmtnRYMG----------------------rNAQFMLDVMRE-tginVVACTGYyqdaf   87
DSSP  EElllHHHL----------------------lLHHHHHHHHHH-hlleEEEEELLllhhh


DSSP  ---------hhhhllLHHHHHHH---hhHHLLLEEEEL-------lllHHHL-HHHHHHH
Query ---------nlvfnnGIDAFYAR---ceQVGVDSVLVA-------dvpVEES-APFRQAA  143
ident                                                  |        | 
Sbjct fpehvatrsvqelaqEMVDEIEQgidgtELKAGIIAEIgtsegkitplEEKVfIAAALAH  147
DSSP  lllhhhhllhhhhhhHHHHHHHLlllllLLLEEEEEEEelllllllhhHHHHhHHHHHHH


DSSP  HHLLLEEEEEELLLLlhhHHHHHHHH--------lLLLEEEL-lLLHHHHHHHHHHHLLl
Query LRHNIAPIFICPPNAdddLLRQVASY--------gRGYTYLL-aLPLHHLIEKLKEYHAa  194
ident                                    |              | |     | 
Sbjct NQTGRPISTHTSFST---MGLEQLALlqahgvdlsRVTVGHCdlKDNLDNILKMIDLGA-  203
DSSP  HHHLLLEEEELHHHL---LHHHHHHHhhhllllhhHEEELLLllLLLHHHHHHHHHLLL-


DSSP  LEEELLLLL----lHHHHHHHHHHL-------lLEEEELL--hhHHHHHHLlllhhhhhh
Query PALQGFGIS----sPEQVSAAVRAG-------aAGAISGS--aiVKIIEKNlaspkqmla  241
ident                |   |   |                                    
Sbjct YVQFDTIGKnsyypDEKRIAMLHALrdrgllnrVMLSMDItrrsHLKANGG---------  254
DSSP  EEEELLLLLlllllHHHHHHHHHHHhhlllhhhEEELLLLllhhHLHHHLL---------


DSSP  hhhHHHH-HHHHLLL----------------------
Query elrSFVS-AMKAASR----------------------  255
ident               |                      
Sbjct ygyDYLLtTFIPQLRqsgfsqadvdvmlrenpsqffq  291
DSSP  lllLHHHhLHHHHHHhllllhhhhhhhhlhhhhhhll


No 32: Query=1bksA Sbjct=3k2gB Z-score=6.5

back to top
DSSP  ------------lhhhhhhhhhhhhlllleeeeEEEL-----------------------
Query ------------meryenlfaqlndrregafvpFVTL-----------------------   25
ident                                                             
Sbjct slselspchvrsgrixtvdgpipssalghtlxhEHLQndcrcwwnppqeperqylaeapi   60
DSSP  llllllllllllleeeelleeeehhhllleellLLLLeelhhhllllllhhhhhhhhlll


DSSP  -------------------lLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELlLLLLllllhhhhh
Query -------------------gDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVpFSDPladgptiqn   66
ident                                      |                      
Sbjct sieilselrqdpfvnkhniaLDDLDLAIAEVKQFAAVGGRSIVDPTcRGIG---------  111
DSSP  lhhhhhhhhllhhhllllleELLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLlLLLL---------


DSSP  hhhhhhhhlllhhhHHHHHHHHHHHlllllEEEEELH--------------hhhhllLHH
Query anlrafaagvtpaqCFEMLALIREKhptipIGLLMYA--------------nlvfnnGID  112
ident                   |  |                                    | 
Sbjct -------------rDPVKLRRISAE-tgvqVVXGAGYylassxpetaarlsaddiadEIV  157
DSSP  -------------lLHHHHHHHHHH-hlleEEELLLLllhhhllhhhhlllhhhhhhHHH


DSSP  HHHHH---hhHHLLLEEEeLLLL-------HHHL-HHHHHHHHHLLLEEEEEE-LLLLlh
Query AFYAR---ceQVGVDSVLvADVP-------VEES-APFRQAALRHNIAPIFIC-PPNAdd  160
ident |                              | |      |  |                
Sbjct AEALEgtdgtDARIGLIG-EIGVssdftaeEEKSlRGAARAQVRTGLPLXVHLpGWFR--  214
DSSP  HHHHLlllllLLLLLLEE-EELLlllllhhHHHHhHHHHHHHHHHLLLEEELLlLLLL--


DSSP  hHHHHHHHH--------lLLLEEEL--llLHHHHHHHHHHhLLLLEEELlLLLL------
Query dLLRQVASY--------gRGYTYLL--alPLHHLIEKLKEyHAAPALQGfGISS------  204
ident  |   |                               |     |       |        
Sbjct -LAHRVLDLveeegadlrHTVLCHXnpshXDPVYQATLAQ-RGAFLEFD-XIGXdffyad  271
DSSP  -LHHHHHHHhhhllllhhHEEELLLhhhlLLHHHHHHHHH-HLLEEEEL-LLLLlleell


DSSP  -------HHHHHHHHHHL-------lLEEEELL--hhHHHHHHllllhhhhhhhhHHHHH
Query -------PEQVSAAVRAG-------aAGAISGS--aiVKIIEKnlaspkqmlaelRSFVS  248
ident           |  |                                              
Sbjct qgvqcpsDDEVARAILGLadhgyldrILLSHDVfvkxXLTRYG--------gngyAFVTK  323
DSSP  lleelllHHHHHHHHHHHhhlllhhhEEELLLLllhhHLHHHL--------llllLHHHH


DSSP  HHHHLLL----------------------------
Query AMKAASR----------------------------  255
ident       |                            
Sbjct HFLPRLRrhglddaaletlxvtnprrvfdasiegh  358
DSSP  LHHHHHHhllllhhhhhhhhlhhhhhhhlllllll


No 33: Query=1bksA Sbjct=2a3lA Z-score=6.5

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct qpdpiaadilrkepeqetfvrlnvplevptsdeveaykclqeclelrkryvfqetvapwe   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct keepfahypqgksdhcfemqdgvvhvfankdakedlfpvadatafftdlhhvlkviaagn  120
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ---------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLLEEE-EEEE--------
Query ---------------------------meryenlfaqlnDRREGAFV-PFVT--------   24
ident                                                             
Sbjct irtlchrrlvlleqkfnlhlmlnadkeflaqksaphrdfYNVRKVDThVHHSacmnqkhl  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllLLLLEEEEeEELLllllhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   24
ident                                                             
Sbjct lrfiksklrkepdevvifrdgtyltlrevfesldltgydlnvdlldvhadkstfhrfdkf  240
DSSP  hhhhhhhhhllllllleeelleeelhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllll


DSSP  --------------lLLLL-----HHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEELlllllll
Query --------------lGDPG-----IEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGVpfsdpla   59
ident                               |                             
Sbjct nlkynpcgqsrlreiFLKQdnliqGRFLGEITKQVFSDLeaskyqmAEYRISI-------  293
DSSP  hhhhllllllhhhhhHLLLlllllLLLHHHHHHHHHHHHllllleeEEEEEEL-------


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHhhHHLLLLLEEEEELHH-------------hh
Query dgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALirEKHPTIPIGLLMYAN-------------lv  106
ident                     |                                       
Sbjct -----------ygrkmsEWDQLASWIVNndLYSENVVWLIQLPRLyniykdmgivtsfqn  342
DSSP  -----------llllllHHHHHHHHHHLllLLLLLEEEEEEEELLhhhhlllllllllhh


DSSP  HLLLHHHHHH------------hhhHHLLLEEEELL------------------------
Query FNNGIDAFYA------------rceQVGVDSVLVAD------------------------  130
ident     |                       |      |                        
Sbjct ILDNIFIPLFeatvdpdshpqlhvfLKQVVGFDLVDdeskperrptkhmptpaqwtnafn  402
DSSP  HHHHHLLHHHhhhhlhhhllllhhhHLLEEEEEEELllllllllllllllllllllllll


DSSP  -lLHHHLHHHHHHHHHLL----------LEEEE-EELLLLLhHHHHHHHHHLLlLEEEL-
Query -vPVEESAPFRQAALRHN----------IAPIF-ICPPNADdDLLRQVASYGRgYTYLL-  177
ident                  |          |             | |               
Sbjct paFSYYVYYCYANLYVLNklreskgmttITLRPhSGEAGDI-DHLAATFLTCH-SIAHGi  460
DSSP  llHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllLEELLlLLLLLLL-HHHHHHHHHLL-LLLLLh


DSSP  -lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELLLL---llhhhhhhhHHHL-----lLEEEELLHHHhh
Query -aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGFGI---sspeqvsaaVRAG-----aAGAISGSAIVki  228
ident        |                                                    
Sbjct nlRKSPVLQYLYYLAQI-GLAMSPLSnnslfldyhrnpFPVFflrglnVSLSTDDPLQ--  517
DSSP  hhHHLHHHHHHHHHHLL-LEEELHHHhlllllllllllHHHHhhllllEEELLLLHHH--


DSSP  hhhllllhhhhhhhhhhhhHHHHHLLL---------------------------------
Query ieknlaspkqmlaelrsfvSAMKAASR---------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct ---------------ihltKEPLVEEYsiaasvwklsacdlceiarnsvyqsgfshalks  562
DSSP  ---------------hlllLLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------  255
ident                                                       
Sbjct hwigkdyykrgpdgndihktnvphirvefrdtiwkeemqqvylgkavisdevvp  616
DSSP  hhlllllllllhhhllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


No 34: Query=1bksA Sbjct=3e74A Z-score=6.5

back to top
DSSP  -------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEE
Query -------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPFV   23
ident                                                             
Sbjct sfdliikngtvilenearvvdiavkggkiaaigqdlgdakevxdasglvvspgxVDAHTH   60
DSSP  leeeeeelleeelllleeeleeeeelleeeeeellllleeeeeelllleeeeleEEEEEL


DSSP  elllllhhhHHHHHHHHHHL--LLLLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhlLLHH--
Query tlgdpgieqSLKIIDTLIDA--GADALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagVTPA--   79
ident                            |                                
Sbjct --------iGYETGTRAAAKggITTXIEXPLN---------------------qLPATvd   91
DSSP  --------lLHHHHHHHHHHllEEEEEELLLL---------------------lLLLLll


DSSP  -HHHHHHHHHHHH--llLLLEEEEELHHHHHlllhhhHHHHHHHHLLLEEEEL--LLLHH
Query -QCFEMLALIREK--hpTIPIGLLMYANLVFnngidaFYARCEQVGVDSVLVA--DVPVE  134
ident     |                                       |||        ||   
Sbjct rASIELKFDAAKGkltiDAAQLGGLVSYNID------RLHELDEVGVVGFXCFvrDVNDW  145
DSSP  hHHHHHHHHHHLLllllEEEELEELLLLLLL------LHHHHHHHLLLLEEEEllLLLHH


DSSP  HLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-----------------------------lLLLHhHHHH
Query ESAPFRQAALRHNIAPIFICP-----------------------------pNADDdLLRQ  165
ident       |            |                                      | 
Sbjct QFFKGAQKLGELGQPVLVHCEnalicdelgeeakregrvtahdyvasrpvfTEVE-AIRR  204
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllhhHHHH-HHHH


DSSP  HHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELlllllhhHHHH------
Query VASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgisspeQVSA------  210
ident |         |              |                                  
Sbjct VLYLAkvagcRLHVCHV--sSPEGVEEVTRARqegqdITCESC-------PHYFvldtdq  255
DSSP  HHHHHhhhllLEEELLL--lLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEL-------LHHHhllhhh


DSSP  --------------------------hhHHLLLEEEELlHHHHhhHHLLLL-hhhhhhhh
Query --------------------------avRAGAAGAISGsAIVKiiEKNLAS-pkqmlael  243
ident                                     |                       
Sbjct feeigtlakcsppirdlenqkgxweklfNGEIDCLVSD-HSPC--PPEXKAgnixkawgg  312
DSSP  hhhhlhhhllllllllhhhhhhhhhhhhLLLLLEELLL-LLLL--LLLLLLlllllllll


DSSP  hhHHHHHHHLLL------------------------------------------------
Query rsFVSAMKAASR------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct iaGLQSCXDVXFdeavqkrgxslpxfgklxatnaadifglqqkgriapgkdadfvfiqpn  372
DSSP  llLHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhlllllllllllllllleeeeell


DSSP  ---------------------------------------------------------
Query ---------------------------------------------------------  255
ident                                                          
Sbjct ssyvltnddleyrhkvspyvgrtigaritktilrgdviydieqgfpvapkgqfilkh  429
DSSP  lleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelllllllllllleelll


No 35: Query=1bksA Sbjct=2y1hB Z-score=6.4

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleeeeEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEElllllllll
Query meryenlfaqlndrregafvpFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGvpfsdplad   60
ident                                           |   ||            
Sbjct -------------gvglvdchCHLSAPDFDRDLDDVLEKAKKANVVALVAV---------   38
DSSP  -------------llleeeeeELLLLHHHLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEL---------


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHhlllLLEEEEELH-----------hhhHLL
Query gptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALIREkhptIPIGLLMYA-----------nlvFNN  109
ident                                        |                    
Sbjct -----------aehsgeFEKIMQLSERYNG----FVLPCLGVHpvqgldqrsvtlkdLDV   83
DSSP  -----------lllhhhHHHHHHHHHHLLL----LEEEEELLLleelllleellhhhHHH


DSSP  LHhHHHHHHHHhLLLEEEEL---------------llLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEE
Query GIdAFYARCEQvGVDSVLVA---------------dvPVEESAPFRQAALRHNIAPIFIC  154
ident                                               | | | |       
Sbjct AL-PIIENYKD-RLLAIGEVgldfsprfagtgeqkeeQRQVLIRQIQLAKRLNLPVNVHS  141
DSSP  HH-HHHHHHLL-LLLEEEEEeeellllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEE


DSSP  LLLLlHHHHHHHH--HHLLLLEEELlllHHHHHHHHHHhLLLLEEElllLLLHHH--hhh
Query PPNAdDDLLRQVA--SYGRGYTYLLalpLHHLIEKLKEyHAAPALQgfgISSPEQ--vsa  210
ident                                                   |         
Sbjct RSAG-RPTINLLQeqGAEKVLLHAF-dgRPSVAMEGVR-AGYFFSI--pPSIIRSgqkqk  196
DSSP  ELLH-HHHHHHHHhlLLLLEEEELL-llLHHHHHHHHH-LLLEEEE--lHHHHLLhhhhh


DSSP  HHHHL---lLEEEELLHHhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL------------
Query AVRAG---aAGAISGSAIvkiieknlaspkqmlaelrsFVSAMKAASR------------  255
ident  |             |                        |                   
Sbjct LVKQLpltsICLETDSPA--------lgpekqvrnepwNISISAEYIAqvkgisveevie  248
DSSP  HHHHLlhhhEEELLLLLL--------llllllllllhhHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhh


DSSP  -----------------
Query -----------------  255
ident                  
Sbjct vttqnalklfpklrhll  265
DSSP  hhhhhhhhhlllhhhhl


No 36: Query=1bksA Sbjct=3mtwA Z-score=6.4

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLL-------------------------------------------ll
Query meryenlfaqlNDRR-------------------------------------------eg   17
ident             |                                               
Sbjct aeikavsaarlLDVAsgkyvdnplvivtdgritsigkkgdavpagatavdlpgvtllpgl   60
DSSP  lleeeeeeeeeEELLlleeeeleeeeeelleeeeeeellllllllleeeeeeeeeeeele


DSSP  EEEEEEEL--------------llLLHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEE-EELLllllllll
Query AFVPFVTL--------------gdPGIEQSLKIIDTLIDAGA-DALE-LGVPfsdpladg   61
ident                                        ||                   
Sbjct IDMHVHLDslaevggynsleysdrFWSVVQTANAKKTLEAGFtTVRNvGAAD--------  112
DSSP  EEEEELLLllllllhhhhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEeEEEElLLLL--------


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhhHHHHHHHHHHH--lllLLEEE-EELH---------------
Query ptiqnanlrafaagvtpaqCFEMLALIREK--hptIPIGL-LMYA---------------  103
ident                           |                                 
Sbjct -----------------ydDVGLREAIDAGyvpgpRIVTAaISFGatgghcdstffppsm  155
DSSP  -----------------lhHHHHHHHHHLLlllllEEEELlLLEEllllllllllllhhh


DSSP  ---HHHH-------llLHHHHHHHHhhhlLLEEEEL---------------lllHHHLHH
Query ---NLVF-------nnGIDAFYARCeqvgVDSVLVA---------------dvpVEESAP  138
ident    |                                                   ||   
Sbjct dqkNPFNsdspdearkAVRTLKKYG----AQVIXICatggvfsrgnepgqqqltYEEMKA  211
DSSP  lllLLLLlllhhhhhhHHHHHHHLL----LLEEEEEllllllllllllllllllHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEELLLLlhhHHHHHH-HHLLlLEEELlllHHHHHHHHHHhLLLLEE
Query FRQAALRHNIAPIFICPPNAdddLLRQVA-SYGRgYTYLLalpLHHLIEKLKEyHAAPAL  197
ident     |    |               |                     |        |   
Sbjct VVDEAHMAGIKVAAHAHGAS---GIREAVrAGVD-TIEHAslvDDEGIKLAVQ-KGAYFS  266
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEELLHH---HHHHHHhLLLL-EEEELlllLHHHHHHHHH-HLLEEE


DSSP  ELlLLLL-----------------------hhhhhhhHHHL-----lLEEEELLhHHHHh
Query QGfGISS-----------------------peqvsaaVRAG-----aAGAISGSaIVKIi  229
ident                                       |                     
Sbjct MD-IYNTdytqaegkkngvlednlrkdrdigelqrenFRKAlkagvkMVYGTDA-GIYP-  323
DSSP  LL-LLLHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhlleEELLLLL-LLLL-


DSSP  hhllllhhhhhhhhhHHHHhHHHL------------------------------------
Query eknlaspkqmlaelrSFVSaMKAA------------------------------------  253
ident                        |                                    
Sbjct --------------hGDNA-KQFAvmvrygatplqaiqsatltaaealgrskdvgqvavg  368
DSSP  --------------lLLHH-HHHHhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ----------------------------------ll
Query ----------------------------------sr  255
ident                                     
Sbjct rygdmiavagdpladvttlekpvfvmkggavvkapx  404
DSSP  lllleeeelllllllhhhhhllleeeelleeeelll


No 37: Query=1bksA Sbjct=3gg7A Z-score=6.1

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlLLLE------------------------EEEEE-ELLLllhhhHHH
Query meryenlfaqlndrREGA------------------------FVPFV-TLGDpgieqSLK   35
ident                                                 |           
Sbjct --------------SLIDfhvhldlypdpvavaraceerqltVLSVTtTPAA-----WRG   41
DSSP  --------------LLEEeeelhhhlllhhhhhhhhhhllleEEELLlLHHH-----HHH


DSSP  HHhHHHH-LLLLLEEEEL---LLLLlllllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHhhh
Query IIdTLID-AGADALELGV---PFSDpladgptiqnanlrafaagVTPAQCFEMLALIrek   91
ident     |          ||      |                             |      
Sbjct TL-ALAAgRPHVWTALGFhpeVVSE-----------------raADLPWFDRYLPET---   80
DSSP  HH-HHHLlLLLEEELLLLlhhHLLL-----------------lhHHLHHHHHHHHHL---


DSSP  llllLEEEEE--------------LHHHHHlllhhhHHHHHHHHLLLEEEELL-lLHHHL
Query hptiPIGLLM--------------YANLVFnngidaFYARCEQVGVDSVLVAD-vPVEES  136
ident                                        |||  |             | 
Sbjct ----RFVGEVgldgspslrgtwtqQFAVFQ-----hILRRCEDHGGRILSIHSrrAESEV  131
DSSP  ----LEEEEEellllhhhhhhhhhHHHHHH-----hHHHHHHHLLLEEEEEELllLHHHH


DSSP  HHHHHHHHhLLLEEEEEELLllLHHHHHHHHHHLLlLEEEL--llLHHHHHHHHHHHLll
Query APFRQAALrHNIAPIFICPPnaDDDLLRQVASYGRgYTYLL--alPLHHLIEKLKEYHaa  194
ident      |       ||           ||   | |                          
Sbjct LNCLEANP-RSGTPILHWYS-gSVTELRRAISLGC-WFSVGptmvRTQKGAALIRSMPrd  188
DSSP  HHHHHHLH-HHEEEEEELLL-lLHHHHHHHHHLLL-EEEELhhhhLLHHHHHHHHHLLhh


DSSP  LEEELLL----------LLLHhHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query PALQGFG----------ISSPeQVSAAVRAGaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelr  244
ident   |                    |   |                                
Sbjct RVLTETDgpfleldgqaALPW-DVKSVVEGL---------------skiwqipaseveri  232
DSSP  HEEELLLlllleelleeLLHH-HHHHHHHHH---------------hhhhlllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlll
Query sfvsamkaasr  255
ident            
Sbjct vkenvsrllgt  243
DSSP  hhhhhhhhhhl


No 38: Query=1bksA Sbjct=2vc5A Z-score=6.0

back to top
DSSP  --------lhhhhhhHHHHhhlllleeEEEEEL----------llLLHHHHHHHHHHHHH
Query --------meryenlFAQLndrregafVPFVTL----------gdPGIEQSLKIIDTLID   42
ident                                                             
Sbjct mriplvgkdsieskdIGFT------liHEHLRVfseavrqqwphlYNEDEEFRNAVNEVK   54
DSSP  llllllllllllhhhLLLE------elLLLLLLllhhhhhhlhhhLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LL------lLLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhHHHHHH----hl
Query AG------aDALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagvtpaqcfemLALIRE----kh   92
ident                                                             
Sbjct RAmqfgvktIVDPTVMG---------------------------lgrdIRFMEKvvkatg   87
DSSP  HHhhlllleEEELLLLL---------------------------llllHHHHHHhhhlll


DSSP  lLLLEEE--------eelhhhhhllLHHHHHHHHHH-------HLLLEEEEL------ll
Query pTIPIGL--------lmyanlvfnnGIDAFYARCEQ-------VGVDSVLVA------dv  131
ident      |                    |                     |  |        
Sbjct iNLVAGTgiyiyidlpfyflnrsidEIADLFIHDIKegiqgtlNKAGFVXIAadepgitk  147
DSSP  lEEEELEellllllllhhhllllhhHHHHHHHHHHHlllllllLLLLLEEEElllllllh


DSSP  LHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEEEE-LLLLlhhHHHHHHHH--------lLLLEEEL-llL
Query PVEE-SAPFRQAALRHNIAPIFIC-PPNAdddLLRQVASY--------gRGYTYLL-alP  180
ident  ||        |        |      |                           |    
Sbjct DVEKvIRAAAIANKETKVPIITHSnAHNN---TGLEQQRIlteegvdpgKILIGHLgdtD  204
DSSP  HHHHhHHHHHHHHHHHLLLEEEELlLLLL---HHHHHHHHhhhllllhhHEEELLHhhlL


DSSP  HHHHHHHHHHHLlLLEEELlLLLL--hhHHHHHHHHL----------lLEEEELLhHHHH
Query LHHLIEKLKEYHaAPALQGfGISS--peQVSAAVRAG----------aAGAISGSaIVKI  228
ident     | |                      |                             |
Sbjct NIDYIKKIADKG-SFIGLD-RYGLdlflPVDKRNETTlrlikdgysdkIMISHDY-CCTI  261
DSSP  LHHHHHHHHHLL-LEEEEL-LLLLllllLHHHHHHHHhhhhhllllllEEELLLL-LLLL


DSSP  H--hHLLLLhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL--------------------------
Query I--eKNLASpkqmlaelrsFVSAMKAASR--------------------------  255
ident                                                        
Sbjct DwgtAKPEY--kpklaprwSITLIFEDTIpflkrngvneeviatifkenpkkffs  314
DSSP  LlllLLHHH--hhhhllllLLLHHHHLHHhhhhlllllhhhhhhhhlhhhhhhll


No 39: Query=1bksA Sbjct=3icjA Z-score=6.0

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLL---------------------------------------------
Query meryenlfaqlNDRR---------------------------------------------   15
ident                                                             
Sbjct cmkalingtiyTSFSpvkkvsglvisnervlyagdsstalriaelaggeiidlkgkfvmp   60
DSSP  leeeeelleeeEEELleeeeleeeeelleeeeeelhhhhhhhhhhhlleeeelllleeee


DSSP  llEEEEEEEL--------------------------------------------------
Query egAFVPFVTL--------------------------------------------------   25
ident                                                             
Sbjct afFDSHLHLDelgmslemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwptred  120
DSSP  leEEEEELHHhhhhhhhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllllhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   25
ident                                                             
Sbjct ldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesrkiinekil  180
DSSP  hlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  -llLLHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhHHHHH
Query -gdPGIEQSLKIIDTLIDAGA-DALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagvtpAQCFE   83
ident                |   |        |                               
Sbjct tvkDYKHYIESAQEHLLSLGVhSVGFMSVG-------------------------EKALK  215
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEeEEEEEEEL-------------------------HHHHH


DSSP  HHHHHHHH--llLLLEEEEElhhhhhlllHHHH---hHHHHHH---LLLEEEELL-----
Query MLALIREK--hpTIPIGLLMyanlvfnngIDAF---yARCEQV---GVDSVLVAD-----  130
ident  |                |           |                   |         
Sbjct ALFELEREgrlkMNVFAYLS------pelLDKLeelnLGKFEGrrlRIWGVXLFVdgslg  269
DSSP  HHHHHHHLllllLEEEEEEL------hhhHHHHhhhlLLLEELlleEEEEEEEELlllll


DSSP  ---------------------LLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLL-lhhhHHHHH-
Query ---------------------VPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNA-dddlLRQVA-  167
ident                          |       |                    |     
Sbjct artallsepytdnpttsgelvMNKDEIVEVIERAKPLGLDVAVHAIGDKavdvaLDAFEe  329
DSSP  lllllllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLHHhhhhhHHHHHh


DSSP  -HHLLlLEEELlllHHHHhHHHHHHLLLLEEELllLLLHH--------------hhhhhH
Query -SYGRgYTYLLalpLHHLiEKLKEYHAAPALQGfgISSPE--------------qvsaaV  212
ident                                                             
Sbjct aEFSG-RIEHAslvRDDQ-LERIKELKVRISAQ--PHFIVsdwwivnrvgeerakwayrL  385
DSSP  hLLLL-EEEELlllLHHH-HHHHHHHLLEEEEL--LLHHHhlllhhhhhhhhhhhhlllH


DSSP  HHLL----LEEEELlhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhHHHHH------------------
Query RAGA----AGAISGsaIVKIieknlaspkqmlaelrsFVSAM------------------  250
ident          |                                                  
Sbjct KTLSsitkLGFSTD--SPIE---------------paDPWVSidaavnryvvdpgervsr  428
DSSP  HHHHhhllEEELLL--LLLL---------------llLHHHHhhhhhhlllllhhhlllh


DSSP  hHLLL-----------------------------------
Query kAASR-----------------------------------  255
ident   |                                     
Sbjct eEALHlythgsaqvtlaedlgklergfraeyiildrdplk  468
DSSP  hHHHHhllhhhhhhlllllllllllllllleeeellllll


No 40: Query=1bksA Sbjct=4ofcA Z-score=5.9

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllLEEE-eEEELLLLL------------------------------
Query meryenlfaqlndrreGAFV-pFVTLGDPG------------------------------   29
ident                          |                                  
Sbjct ----------------MKIDihSHILPKEWpdlkkrfgyggwvqlqhhskgeakllkdgk   44
DSSP  ----------------LLEEeeEELLLLLLllhhhhhllllleeeeeeelleeeeeelle


DSSP  ----hhhhhHHHHHHHHLL-----lLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHH
Query ----ieqslKIIDTLIDAG-----aDALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQ   80
ident                |               ||                           
Sbjct vfrvvrencWDPEVRIREMdqkgvtVQALSTVPV---------mfsywakpedtlnLCQL   95
DSSP  eeeeeehhhLLHHHHHHHHhhhlllEEEEELLHH---------hhlllllhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLL-LLEEEeelhhHHHL-LLHHHHHHHHHH-HLLLEEEELLL----LH
Query CFEMLALIREKHPT-IPIGLlmyanLVFN-NGIDAFYARCEQ-VGVDSVLVADV----PV  133
ident     ||      |                         ||    |   |           
Sbjct LNNDLASTVVSYPRrFVGLG---tlPMQApELAVKEMERCVKeLGFPGVQIGTHvnewDL  152
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLlEEEEE---llLLLLhHHHHHHHHHHHHlLLLLEEEEELEelleEL


DSSP  HH--lHHHHHHHHHLLLEE-----------------------------------------
Query EE--sAPFRQAALRHNIAP-----------------------------------------  150
ident       |   || |                                              
Sbjct NAqelFPVYAAAERLKCSLfvhpwdmqmdgrmakywlpwlvgmpaettiaicsmimggvf  212
DSSP  LLhhhHHHHHHHHHHLLEEeeelllllllhhhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  -------EEEE--LLLL-------------------------LHHHHHHHhhhllllEEE
Query -------IFIC--PPNA-------------------------DDDLLRQVasygrgyTYL  176
ident                                               |          |  
Sbjct ekfpklkVCFAhgGGAFpftvgrishgfsmrpdlcaqdnpmnPKKYLGSF------yTDA  266
DSSP  hhlllllEEELhhHLLHhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllHHHHLLLL------eEEL


DSSP  L---llLHHHHHHHHHhhllLLEEEL------lLLLLhhhHHHHHHH--------lLLEE
Query L---alPLHHLIEKLKeyhaAPALQG------fGISSpeqVSAAVRA--------gAAGA  219
ident |      |  |              |       |                         |
Sbjct LvhdplSLKLLTDVIG---kDKVILGtdypfplGELE--pGKLIESMeefdeetknKLKA  321
DSSP  LlllhhHHHHHHHHHL---lLLEELLlllllllLLLL--lLHHHHHLllllhhhhhHHHL


DSSP  eellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query isgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                                     
Sbjct ----------------------gnalaflglerkqf  335
DSSP  ----------------------hhhhhhhlllhhhl


No 41: Query=1bksA Sbjct=4hk5D Z-score=5.8

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhLLLLE------------------------------------------
Query meryenlfaqlndRREGA------------------------------------------   18
ident                                                             
Sbjct -------------TPVVVdihthmyppsyiamlekrqtiplvrtfpqadeprlillssel   47
DSSP  -------------LLLLEeeeeeellhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeeellhhhh


DSSP  ----------------------------------------EEEEE----------elLLL
Query ----------------------------------------FVPFV----------tlGDP   28
ident                                          |                  
Sbjct aaldaaladpaaklpgrplsthfaslaqkmhfmdtngirvSVISLanpwfdflapdeAPG  107
DSSP  hhhhhhhhlllllllleellhhhllhhhhhhhhhhlllleEEEEEllllllllllllHHH


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLL--lLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHH
Query GIEQSLKIIDTLIDAG--aDALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagVTPAQCFEMLA   86
ident                           |                                 
Sbjct IADAVNAEFSDMCAQHvgrLFFFAALPL--------------------sAPVDAVKASIE  147
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLlllEEEEEELLL--------------------lLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLllllEEEEELHHH----HHLLLHHHHHHHHHHhLLLEEEELL------------
Query LIREKHptipIGLLMYANL----VFNNGIDAFYARCEQvGVDSVLVAD------------  130
ident            |                               |                
Sbjct RVKNLK--ycRGIILGTSGlgkgLDDPHLLPVFEAVAD-AKLLVFLHPhyglpnevygpr  204
DSSP  HHHLLL--leEEEEELLLLllllLLLHHHHHHHHHHHH-LLLEEEELLlllllhhhhlll


DSSP  -------------------lLHHHLH--HHHHHHHhlLLEEEEEElllllhHHHH-----
Query -------------------vPVEESA--PFRQAALrhNIAPIFICppnaddDLLR-----  164
ident                      |               |              |       
Sbjct seeyghvlplalgfpmettiAVARMYmaGVFDHVR--NLQMLLAH---sggTLPFlagri  259
DSSP  hhhlllhhhhhlhhhhhhhhHHHHHHhlLHHHHLL--LLLEEEHH---hhlLHHHhhhhh


DSSP  ------------------------hhHHHLLlLEEELlllHHHHHHHHHHHLL--LLEEe
Query ------------------------qvASYGRgYTYLLalpLHHLIEKLKEYHA--APALq  198
ident                                 |                           
Sbjct escivhdghlvktgkvpkdrrtiwtvLKEQI-YLDAV-iySEVGLQAAIASSGadRLMF-  316
DSSP  hhhhhllhhhhhllllllllllhhhhHHHLE-EEELL-llLHHHHHHHHHHHLhhHEEL-


DSSP  LLLLL-----------LHHHHHHHHHH-------------LLLEeeellhhhhhhhhlll
Query GFGIS-----------SPEQVSAAVRA-------------GAAGaisgsaivkiieknla  234
ident |                         |                |                
Sbjct GTDHPffppieedvqgPWDSSRLNAQAvikavgegssdaaAVMG----------------  360
DSSP  LLLLLlllllllllllLLHHHHHHHHHhhhhhllllhhhhHHHL----------------


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query spkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                      
Sbjct -lnavrvlslkaelehhhhhh  380
DSSP  -hhhhhhlllhhhhhhhhhhl


No 42: Query=1bksA Sbjct=3irsA Z-score=5.8

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct lkiidfrlrppamgflnariytrpdirnrftrqlgfepapsaeekslelmfeemaaagie   60
DSSP  llleelllllllhhhhhlhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhllhhhhhhhhhhllll


DSSP  --------------lhhhhhhhhhhhHLLLLEEEEEEEllLLLHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query --------------meryenlfaqlnDRREGAFVPFVTlgDPGIEQSLKIIDTLIDAGAD   46
ident                                  |                     | |  
Sbjct qgvcvgrnssvlgsvsnadvaavakaYPDKFHPVGSIE--AATRKEAMAQMQEILDLGIR  118
DSSP  eeeeelleellleellhhhhhhhhhhLLLLEEEEEELL--LLLHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LEEEELLLlllllllhhhhhhHHHHhhhlllHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEEEL----
Query ALELGVPFsdpladgptiqnaNLRAfaagvtPAQCFEMLALIREkhPTIPIGLLMY----  102
ident    |                                   |        ||          
Sbjct IVNLEPGV-------------WATP--mhvdDRRLYPLYAFCED--NGIPVIMMTGgnag  161
DSSP  LEEELHHH-------------LLLL--llllLHHHHHHHHHHHH--LLLLEEEELLllll


DSSP  --hHHHHlllhhhHHHHHHHH--LLLEEE-ELLLlhhHLHHHHHHHHHLL-LEEEEEE-L
Query --aNLVFnngidaFYARCEQV--GVDSVL-VADVpveESAPFRQAALRHN-IAPIFIC-P  155
ident                                              | |            
Sbjct pdiTYTN---pehIDRVLGDFpdLTVVSShGNWP---WVQEIIHVAFRRPnLYLSPDMyL  215
DSSP  llhHHHL---hhhHHHHHHHLllLLEEEEhHHLL---LHHHHHHHHHHLLlEEEELHHhH


DSSP  LLL--lhhhHHHH---hHHLLlLEEEL-----lLLHHHHHHHH----hhHLLLLeeelll
Query PNA--dddlLRQV---aSYGRgYTYLL-----aLPLHHLIEKL----keYHAAPalqgfg  201
ident  |                                        |                 
Sbjct YNLpghadfIQAAnsflADRM-LFGTAypmcplKEYTEWFLTLpikpdaMEKIL------  268
DSSP  LLLllhhhhHHHHllhhHHLL-LLLLLlllllhHHHHHHHHLLlllhhhHHHHH------


DSSP  lllhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query isspeqvsaavragaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                                                       
Sbjct -----------------------------------------hgnaerllaqagr  281
DSSP  -----------------------------------------lhhhhhhhhhlll


No 43: Query=1bksA Sbjct=3au2A Z-score=5.8

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg   60
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek  120
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv  180
DSSP  hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl  240
DSSP  leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriageteeev  300
DSSP  eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelllhhhh


DSSP  --------------------lhhhhhhhhhhHHLLLLEEE-eEEELLLllhhhHHHHHHH
Query --------------------meryenlfaqlNDRREGAFV-pFVTLGDpgieqSLKIIDT   39
ident                                                       |     
Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpklLELPQVKGDlqVHSTYS-dgqnTLEELWE  359
DSSP  hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllLLHHHLLEEeeELLLLL-llllLHHHHHH


DSSP  HHHL--LLLLE-EEELL-LLLLllllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLL--
Query LIDA--GADAL-ELGVP-FSDPladgptiqnanlrafaagVTPAQCFEMLALIREKHP--   93
ident                 |                         |         ||      
Sbjct AAKTmgYRYLAvTDHSPaVRVA----------------ggPSPEEALKRVGEIRRFNEth  403
DSSP  HHHHhlLLEEEeEEELHhHHLL----------------llLLHHHHHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ---LLLEEEEELHHhhhlllhhhHHHHHHhhLLLEEEELL------------lLHHHLhh
Query ---TIPIGLLMYANlvfnngidaFYARCEqvGVDSVLVAD------------vPVEESap  138
ident        |                         | |||                      
Sbjct gppYLLAGAEVDIH--pdgtldyPDWVLR--ELDLVLVSVhsrfnlpkadqtkRLLKA--  457
DSSP  lllEEEEEEEEELL--lllllllLHHHHL--LLLEEEEELlllllllhhhhhhHHHHH--


DSSP  hHHHHhhlllEEEE-EELL----------LLLHHHHHHHHHHLLlLEEEL-----lllHH
Query fRQAAlrhniAPIF-ICPP----------NADDDLLRQVASYGRgYTYLL-----alpLH  182
ident                                           |                 
Sbjct lENPF-----VHVLaHPTArllgrrapieADWEAVFQKAKEKGV-AVEIDgyydrmdlPD  511
DSSP  hLLLL-----LLEElLLLLllllllllllLLHHHHHHHHHHHLL-EEEEEllllllllLH


DSSP  HHHHHHHHHLLlLEEEllllllhhhhhhhhhhllleeEELLhHHHH--------------
Query HLIEKLKEYHAaPALQgfgisspeqvsaavragaagaISGSaIVKI--------------  228
ident  |                                                          
Sbjct DLARMAYGMGL-WISL---------------------STDA-HQTDhlrfmelavgtaqr  548
DSSP  HHHHHHHHLLL-LEEE---------------------ELLL-LLHHhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                            
Sbjct awigpervlntldyedllswlkarrgv  575
DSSP  llllllllhhhllhhhhhhhhhlllll


No 44: Query=1bksA Sbjct=1m65A Z-score=5.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllLEEE-eEEELLLLlhhhhhHHHHHHHHLL-----lLLEEEEL-L
Query meryenlfaqlndrreGAFV-pFVTLGDPgieqslKIIDTLIDAG-----aDALELGV-P   53
ident                         |                |                 |
Sbjct ----------------YPVDlhMHTVAST---haySTLSDYIAQAkqkgikLFAITDHgP   41
DSSP  ----------------LLEEllLLLLLLL---lllLLHHHHHHHHhhhlllEEEEEEElL


DSSP  LLLlllllhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHhHHHHhhHHLL----LLLEEEEELHHhhhll
Query FSDpladgptiqnanlrafaagvtPAQCFeMLALirEKHP----TIPIGLLMYANlvfnn  109
ident                             |                |  |           
Sbjct DME------------------dapHHWHFiNMRI--WPRVvdgvGILRGIEANIK--nvd   79
DSSP  LLL------------------lllLLHHHhHHHH--LLLEelleEEEEEEEEELL--lll


DSSP  lhhhHHHHHHHHlLLEEEELL--------------lLHHHL-HHHHhhhhhlllEEEE-E
Query gidaFYARCEQVgVDSVLVAD--------------vPVEES-APFRqaalrhniAPIF-I  153
ident               |                           |             |   
Sbjct geidCSGKMFDS-LDLIIAGFhepvfaphdkatntqAMIATiASGN--------VHIIsH  130
DSSP  llllLLHHHHHH-LLEEEEELlllllllllhhhhhhHHHHHhHLLL--------LLEElL


DSSP  ELL---LLLH-HHHHHHHHHLLlLEEEL-llLHHHHHHHHHHHLLLlEEEL---lllllh
Query CPP---NADD-DLLRQVASYGRgYTYLL-alPLHHLIEKLKEYHAApALQG---fgissp  205
ident         |        |                                |         
Sbjct PGNpkyEIDVkAVAEAAAKHQV-ALEINnssNCREVAAAVRDAGGW-VALGsdshtaftm  188
DSSP  LLLlllLLLHhHHHHHHHHHLL-EEEEElllLHHHHHHHHHHHLLL-EEEElllllhhhl


DSSP  hHHHHHHHHL---------LLEEeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query eQVSAAVRAG---------AAGAisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                                                            
Sbjct gEFEECLKILdavdfpperILNV-------------sprrllnflesrgmapiaefadl  234
DSSP  lLLHHHHHHHhhllllhhhLHHH-------------lhhhhhhhhhhllllllhhhlll


No 45: Query=1bksA Sbjct=2ogjA Z-score=5.7

back to top
DSSP  -----------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEE
Query -----------------------------------------meryenlfaqlndrregAF   19
ident                                                             
Sbjct qapilltnvkpvgfgkgasqsstdiliggdgkiaavgsalqapadtqridaafispgwVD   60
DSSP  llleeeeeeeellllllllllleeeeellllleeeeelllllllleeelllleeeeleEE


DSSP  EEEEEL--LLLLhhhhhhHHHHHHH--LLLLLE-EEELlllllllllhhhhhhhhhhhhh
Query VPFVTL--GDPGieqslkIIDTLID--AGADAL-ELGVpfsdpladgptiqnanlrafaa   74
ident         |                                                   
Sbjct LHVHIWhgGTDI----siRPSECGAerGVTTLVdAGSA----------------------   94
DSSP  EEELLLllLLLL----llLHHHLLHhhLEEEEEeELLL----------------------


DSSP  lllhhhHHHHHHH-HHHHL-lLLLEEEEEL----------------hHHHHlllhHHHHH
Query gvtpaqCFEMLAL-IREKH-pTIPIGLLMY----------------aNLVFnngiDAFYA  116
ident        |      | |     |   |                            |    
Sbjct ---geaNFHGFREyIIEPSreRIKAFLNLGsiglvacnrvpelrdikDIDL----DRILE  147
DSSP  ---lllLHHHHHHhLLLLLllEEEEEEELLlllllllllllllllhhHLLH----HHHHH


DSSP  HHHHHL--LLEEEEL-------llLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLllhhHHHHHH
Query RCEQVG--VDSVLVA-------dvPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNadddLLRQVA  167
ident              |           |         |                  |   | 
Sbjct CYAENSehIVGLXVRashvitgswGVTPVKLGKKIAKILKVPXXVHVGEP--paLYDEVL  205
DSSP  HHHLLLllEEEEEEEelhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL--llLHHHHH


DSSP  HHL--LLLEEE-----lLLLHH---hHHHHHHHHLlLLEEELLLL----llhhhhhhhhh
Query SYG--RGYTYL-----lALPLH---hLIEKLKEYHaAPALQGFGI----sspeqvsaavr  213
ident                           |              | |                
Sbjct EILgpGDVVTHcfngksGSSIXededLFNLAERCEgIRLDIGHGGasfsfkvaeaaiarg  265
DSSP  HHLllLLEEELllllllLLLLLllhhHHHHHHHLLlLEEELLLLLllllhhhhhhhhhll


DSSP  HLLLEEEELlhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhhhHHHHLLL------------------
Query AGAAGAISGsaIVKIieknlaspkqmlaelrsfvsAMKAASR------------------  255
ident                                       |                     
Sbjct LLPFSISTD-lHGHS---------------xnfpvWDLATTXskllsvdxpfenvveavt  309
DSSP  LLLLLLLLL-lLLLL---------------lllllLLHHHHHhhhhhllllhhhhhhlll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct rnpasvirldxenrldvgqradftvfdlvdadleatdsngdvsrlkrlfepryavigaea  369
DSSP  hhhhhhllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeeeeellee


DSSP  ----------
Query ----------  255
ident           
Sbjct iaasryipra  379
DSSP  eellllllll


No 46: Query=1bksA Sbjct=2dvtA Z-score=5.6

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlLLLE------------------------------------------
Query meryenlfaqlndrREGA------------------------------------------   18
ident                                                             
Sbjct -------------mQGKValeehfaipetlqdsagfvpgdywkelqhrlldiqdtrlklm   47
DSSP  -------------lLLEEeeeeeellhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhh


DSSP  -------EEEEE----------------eLLLLlhHHHHHHHHHhHHLLLlLEEEELLLL
Query -------FVPFV----------------tLGDPgiEQSLKIIDTlIDAGAdALELGVPFS   55
ident                                                          |  
Sbjct dahgietMILSLnapavqaipdrrkaieiARRA-nDVLAEECAK-RPDRF-LAFAALPLQ  104
DSSP  hhlleeeEEEEElllhhhhlllhhhhhhhHHHH-hHHHHHHHHH-LLLLE-EEEELLLLL


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHH-HHHHHhhlllllEEEEELHHH---------
Query dpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEM-LALIRekhptipIGLLMYANL---------  105
ident                                            | |              
Sbjct ------------------dpdAATEELQRcVNDLG------fVGALVNGFSqegdgqtpl  140
DSSP  ------------------lhhHHHHHHHHhHHLLL------lLEEEEELLLlllllllll


DSSP  --hHLLLhHHHHHHHHHHLLlEEEELL--------------------------LLHHHLH
Query --vFNNGiDAFYARCEQVGVdSVLVAD--------------------------VPVEESA  137
ident           |    |   |                                        
Sbjct yydLPQY-RPFWGEVEKLDV-PFYLHPrnplpqdsriydghpwllgptwafaqETAVHAL  198
DSSP  lllLHHH-HHHHHHHHHHLL-LEEEELllllhhhlhhhlllhhhlhhhlhhhhHHHHHHH


DSSP  HHH--HHHHHL-LLEEEEEELllllhhHHHH-------------------------hhHH
Query PFR--QAALRH-NIAPIFICPpnadddLLRQ-------------------------vaSY  169
ident           |     |          |                                
Sbjct RLMasGLFDEHpRLNIILGHM---gegLPYMmwridhrnawvklpprypakrrfmdyfNE  255
DSSP  HHHhlLHHHHLlLLLEEELHH---hllHHHHhhhhhhllllllllllllllllhhhhhHH


DSSP  LLlLEEELlllHHHHHHHHHHHLL--LLEEELLL--LLLHHHHHHHHHHllleeeellhh
Query GRgYTYLLalpLHHLIEKLKEYHA--APALQGFG--ISSPEQVSAAVRAgaagaisgsai  225
ident                                                             
Sbjct NF-HITTSgnfRTQTLIDAILEIGadRILFSTDWpfENIDHASDWFNAT-----------  303
DSSP  HE-EEELLlllLHHHHHHHHLLLLhhHEELLLLLllLLHHHHHHHHHHL-----------


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                               
Sbjct --------siaeadrvkigrtnarrlfkld  325
DSSP  --------lllhhhhhhhhlhhhhhhllll


No 47: Query=1bksA Sbjct=2gwgA Z-score=5.5

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEE-elLLLLHH---------------------------h
Query meryenlfaqlndrregAFVPFV-tlGDPGIE---------------------------q   32
ident                                |                            
Sbjct ---------------xiIDIHGHyttAPKALEdwrnrqiagikdpsvxpkvselkisdde   45
DSSP  ---------------llEEEEEElllLLHHHHhhhhhhhhhhhlhhhlllhhhllllhhh


DSSP  hhhHHHH-HHHLL-----lLLEEEELLllllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHH
Query slkIIDT-LIDAG-----aDALELGVPfsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLA   86
ident     |                                               | | |   
Sbjct lqaSIIEnQLKKXqergsdLTVFSPRA---------------gdfnvsstWAAICNELCY   90
DSSP  hhhHHHLlHHHHHhhhlllEEEEELLL---------------llhhhhhhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLL-LLEEEEELHH-hhhllLHHHHHHHHH-HHLLLEEEELL----------lLH
Query LIREKHPT-IPIGLLMYAN-lvfnnGIDAFYARCE-QVGVDSVLVAD----------vPV  133
ident       |                          |    |                     
Sbjct RVSQLFPDnFIGAAXLPQSpgvdpkTCIPELEKCVkEYGFVAINLNPdpsgghwtsppLT  150
DSSP  HHHHHLLLlEEEEEELLLLllllhhHHHHHHHHHHhLLLLLEEEELLlllllllllllLL


DSSP  HH-LHHHHHHHHHLLlEEEEE----------eLLLLlHHHHHH-----hhHHLLllEEEL
Query EE-SAPFRQAALRHNiAPIFI----------cPPNAdDDLLRQ-----vaSYGRgyTYLL  177
ident      |           |  |              |                        
Sbjct DRiWYPIYEKXVELE-IPAXIhvstgahylnaDTTAfXQCVAGdlfkdfpELKF--VIPH  207
DSSP  LHhHHHHHHHHHHHL-LLEEEllllllhhhhhHHHHhHHHHHLlhhhhllLLLE--EELH


DSSP  ----llLHHH---------hhhhHHHH--LLLLEEELllLLLHHhhHHHHHHL---lLEE
Query ----alPLHH---------liekLKEY--HAAPALQGfgISSPEqvSAAVRAG---aAGA  219
ident                        |                                    
Sbjct gggavpYHWGrfrglaqexkkplLEDHvlNNIFFDTC--VYHQPgiDLLNTVIpvdnVLF  265
DSSP  hhlllhHHHHhhhhhhhhlllllHHHHllLLEEEELL--LLLHHhhHHHHHHLlhhhEEL


DSSP  EELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhhhHHHHLLL------------------------
Query ISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfvsAMKAASR------------------------  255
ident  |   |                         |                            
Sbjct ASEX-IGAV--------rgidprtgfyydDTKRYIEastiltpeekqqiyegnarrvypr  316
DSSP  LLLL-LLLL--------lleelllleellLLHHHHHhlllllhhhhhhhhlhhhhhhlhh


DSSP  -------------
Query -------------  255
ident              
Sbjct ldaalkakgkleh  329
DSSP  hhhhhhhhhhhll


No 48: Query=1bksA Sbjct=1a5kC Z-score=5.4

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml   60
DSSP  leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll


DSSP  -----lhhhhhhhhHHHH------------------------------------------
Query -----meryenlfaQLND------------------------------------------   13
ident                                                             
Sbjct aadcvdlvltnaliVDHWgivkadigvkdgrifaigkagnpdiqpnvtipigaateviaa  120
DSSP  hhhllleeeeeeeeEELLeeeeeeeeeelleeeeeeleellllllllleellllleeeel


DSSP  ---lllleEEEE-EELLlllhhhHHHHHHHHHHLLLLLEEEELL-LLLLllllhhhhhhh
Query ---rregaFVPF-VTLGdpgieqSLKIIDTLIDAGADALELGVP-FSDPladgptiqnan   68
ident                                   |      |                  
Sbjct egkivtagGIDThIHWI------CPQQAEEALVSGVTTMVGGGTgPAAG--------tha  166
DSSP  llleeeelEEEEeEELL------LLLHHHHHHHHLEEEEEEELLlLLHH--------hhh


DSSP  hhhhhhllLHHHHHHHHHHHhhhlllllEEEEELhhhhhllLHHHHHHHHhhhlLLEEEE
Query lrafaagvTPAQCFEMLALIrekhptipIGLLMYanlvfnnGIDAFYARCeqvgVDSVLV  128
ident                             ||||               |      |     
Sbjct ttctpgpwYISRMLQAADSL-----pvnIGLLGKgnvsqpdALREQVAAG----VIGLEI  217
DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHLLL-----lleEEEEEElllllhhHHHHHHHHL----LLEEEE


DSSP  L--LLLHHHL-hhhHHHHHHLLLEEEEEELLL----LLHHHHHHHhHHLLlLEEEL----
Query A--DVPVEES-apfRQAALRHNIAPIFICPPN----ADDDLLRQVaSYGRgYTYLL----  177
ident                  |    |                | |          |       
Sbjct HedWGATPAAidcaLTVADEMDIQVALHSDTLnesgFVEDTLAAIgGRTI-HTFHTegag  276
DSSP  EhhHLLLHHHhhhhHHHHHHHLLEEEEELLLLllllLHHHHHHHHlLLLE-EELLLllll


DSSP  ----LLLHhHHHHhhhhHLLLLEEELllLLLHH---------------------------
Query ----ALPLhHLIEklkeYHAAPALQGfgISSPE---------------------------  206
ident                                                             
Sbjct gghaPDII-TACA----HPNILPSST--NPTLPytlntidehldmlmvchhldpdiaedv  329
DSSP  llllLLHH-HHHH----LLLEEEEEE--HHHLLllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhh


DSSP  -------------hhHHHHH-HLLLEEEEL---LHHHhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHH
Query -------------qvSAAVR-AGAAGAISG---SAIVkiieknlaspkqmlaelrsFVSA  249
ident                             |       |                    |  
Sbjct afaesrirretiaaeDVLHDlGAFSLTSSDsqaMGRV------------------gEVIL  371
DSSP  hlllllllhhhhhhhHHHHHlLLLLEEELLlllLLLL------------------lLHHH


DSSP  HHHLLL------------------------------------------------------
Query MKAASR------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct RTWQVAhrmkvqrgalaeetgdndnfrvkryiakytinpalthgiahevgsievgkladl  431
DSSP  HHHHHHhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllllllllllllllle


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct vvwspaffgvkpatvikggmiaiapmgdinasiptpqpvhyrpmfgalgsarhhcrltfl  491
DSSP  eeelhhhlllllleeeelleeeeeeellllllllllllleeeelhhhlhhhhhhhleeee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  255
ident                                                             
Sbjct sqaaaangvaerlnlrsaiavvkgcrtvqkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelits  551
DSSP  lhhhhhhlhhhhllllleeeellllllllhhhllllllllleeelllllleeelleelll


DSSP  ---------------
Query ---------------  255
ident                
Sbjct epadvlpmaqryflf  566
DSSP  lllllllllllllll


No 49: Query=1bksA Sbjct=4dziC Z-score=5.3

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEEELLL---------------------------------
Query meryenlfaqlndrregAFVPFVTLGD---------------------------------   27
ident                    |                                        
Sbjct -----------alnyrvIDVDNHYYEPldsftrhldkkfkrrgvqmlsdgkrtwavigdr   49
DSSP  -----------llllleEEEEEELLLLlllllllllhhhlllleeeeelllleeeeelle


DSSP  --------------------------------------------llhhHHHHHHHHHH-H
Query --------------------------------------------pgieQSLKIIDTLI-D   42
ident                                                 |           
Sbjct vnhfipnptfdpiivpgcldllfrgeipdgvdpaslmkverladhpeyQNRDARIAVMdE  109
DSSP  ellllllllllleelllllhhhhhllllllllhhhllleelhhhlhhhLLHHHHHHHHhH


DSSP  LLL-LLEEEE-lLLLLLLlllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHhhHHHLlLLLEEEE
Query AGA-DALELG-vPFSDPLadgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLAliREKHpTIPIGLL  100
ident      |  |                                 |     |  |  |     
Sbjct QDIeTAFMLPtfGCGVEE---alkhdieatmasvhaFNLWLDEDWGfdRPDH-RIIAAPI  165
DSSP  HLEeEEEEELlhHHHHHH---hllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHLLllLLLL-LEEELLL


DSSP  ELHHhhHLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL---------llLHHH--lHHHHHHHHHLLLE
Query MYANlvFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVA---------dvPVEE--sAPFRQAALRHNIA  149
ident                      |   |||                    |           
Sbjct VSLA--DPTRAVEEVDFVLARGAKLVLVRpapvpglvkprSLGDrshDPVWARLAEAGVP  223
DSSP  LLLL--LHHHHHHHHHHHHHLLLLLEELLlllllllllllLLLLhhhHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEE------------------------eLLLLlhHHHHHHH--------hhlLLLEEEL
Query PIFI------------------------cPPNAddDLLRQVA--------sygRGYTYLL  177
ident   |                             |  |                        
Sbjct VGFHlsdsgylhiaaawggakdpldqvllDDRAihDTMASMIvhgvftrhpklKAVSIEN  283
DSSP  EEEEllllllhhhhhhllllllhhhhhhhLLHHhhHHHHHHHhllhhhhllllLEEEELL


DSSP  lllhhHHHHH------------------hhHHLL---LLEEEllllllhhhHHHHHHHL-
Query alplhHLIEK------------------lkEYHA---APALQgfgisspeqVSAAVRAG-  215
ident                                                             
Sbjct ---gsYFVHRlikrlkkaantqpqyfpedpVEQLrnnVWIAP--------yYEDDLPELa  332
DSSP  ---llLHHHHhhhhhhhhhhhlhhhllllhHHHHhhhEEELL--------lLLLLHHHHh


DSSP  ------lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhHHHHHHhHLLL--------------
Query ------aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrSFVSAMkAASR--------------  255
ident            |                               |                
Sbjct rvigvdkILFGSDW-PHGE--------------glASPVSF-TAELkgfsesdirkimrd  376
DSSP  hhhlhhhLLLLLLL-LLLL--------------llLLHHHH-HHHHllllhhhhhhhhlh


DSSP  ------------
Query ------------  255
ident             
Sbjct naldllgvqvgs  388
DSSP  hhhhhhllllll


No 50: Query=1bksA Sbjct=2qpxA Z-score=5.1

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct gxddlsefvdqvplldhhchflidgkvpnrddrlaqvsteadkdypladtknrlayhgfl   60
DSSP  lllllhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------lhhhhhhhhhHHHLL---
Query ------------------------------------------meryenlfaqLNDRR---   15
ident                                                     |       
Sbjct alakefaldannplaaxndpgyatynhrifghfhfkellidtgfvpddpildLDQTAelv  120
DSSP  hhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeelllllllllllHHHHHhhh


DSSP  --LLEEEEEEE-lLLLL----------HHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELlLLLL-----
Query --EGAFVPFVT-lGDPG----------IEQSLKIIDTLIDAGADALELGVpFSDP-----   57
ident                                          |                  
Sbjct giPVKAIYRLEthAEDFxlehdnfaawWQAFSNDVKQAKAHGFVGFXSIAaYRVGlhlep  180
DSSP  llLEEEEEEHHhhHHHHhlllllhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEELHhHHLLlllll


DSSP  ----------llllhhhhHHHHhhhhhLLLHHHHHHHHHHHHHHLllLLEEEEE------
Query ----------ladgptiqNANLrafaaGVTPAQCFEMLALIREKHptIPIGLLM------  101
ident                                         |       |           
Sbjct vnvieaaagfdtwkhsgeKRLT---skPLIDYXLYHVAPFIIAQD--XPLQFHVgygdad  235
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllLLLL---lhHHHHHHHHHHHHHHHHHL--LLEEEEEllllll


DSSP  ------lHHHHhlllhHHHHHHHHH-HLLLEEEellllHHHLHHHHHHHHHLL-LEEEEE
Query ------yANLVfnngiDAFYARCEQ-VGVDSVLvadvpVEESAPFRQAALRHN-IAPIFI  153
ident          |                      |               |           
Sbjct tdxylgnPLLX-----RDYLKAFTKkGLKVVLL---hcYPYHREAGYLASVFPnLYFDIS  287
DSSP  llhhhllHHHH-----HHHHHHHHHhLLLEEEE---elLLLHHHHHHHHHHLLlEEEELL


DSSP  EL-lLLLHhHHHHHHHH-------lLLLEEEL----lLLHHHHHHHHHHHL---------
Query CP-pNADDdLLRQVASY-------gRGYTYLL----aLPLHHLIEKLKEYH---------  192
ident              |           |                     |            
Sbjct LLdnLGPS-GASRVFNEavelapytRILFASDastypEXYGLAARQFKQALvahfnqlpf  346
DSSP  LHhhHLHH-HHHHHHHHhlllllhhHEELLLLllllhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllll


DSSP  -----------llleeellllllhHHHHHhhhhllleeeellhhhhhhhhllllhhhhhh
Query -----------aapalqgfgisspEQVSAavragaagaisgsaivkiieknlaspkqmla  241
ident                         |                                   
Sbjct vdlaqkkawinaicwqtsaklyhqERELR-------------------------------  375
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllHHHHL-------------------------------


DSSP  hhhhhhhhhhhlll
Query elrsfvsamkaasr  255
ident               
Sbjct -------------v  376
DSSP  -------------l


No 51: Query=1bksA Sbjct=2anuA Z-score=4.8

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhLLLLEEE-eEEELLlllhhHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEL------
Query meryenlfaqlndRREGAFV-pFVTLGdpgieQSLKIIDTLIDAGA-DALELGV------   52
ident                         |             |     |               
Sbjct -------------TEWLLCDfhVHTNXsdghlPLGEVVDLFGKHGVdVVSITDHivdrrt   47
DSSP  -------------LEEEEEEeeELLLLlllllLHHHHHHHHHHLLLlEEEEEEEeelhhh


DSSP  ------------LLLLlllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLL----LLL
Query ------------PFSDpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHP----TIP   96
ident                                             |             | 
Sbjct leqrkrngeplgAITE-------------------dKFQDYLKRLWREQKRAWeeygXIL   88
DSSP  hhhhhhllllllLLLL-------------------lLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLEE


DSSP  E-EEEELHHhhhlllhhhhhhhhhhhllleeeellllhhHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL
Query I-GLLMYANlvfnngidafyarceqvgvdsvlvadvpveESAPFRQAALRHNIAPIFICP  155
ident | |     |                                          |   |   |
Sbjct IpGVEITNN-----------tdlyhivavdvkeyvdpslPVEEIVEKLKEQNALVIAAHP  137
DSSP  EeEEEEEEL-----------llleeeeeellllllllllLHHHHHHHHHHLLLEEEELLL


DSSP  -----llllhHHHHHHHHHLLlLEEEL--lllHHHHHHHHHhhlllLEEEllllllhhhh
Query -----pnaddDLLRQVASYGRgYTYLL--alpLHHLIEKLKeyhaaPALQgfgisspeqv  208
ident                                       |                     
Sbjct drkklswylwANXERFKDTFD-AWEIAnrddlFNSVGVKKY-----RYVA----------  181
DSSP  lllllllhhhHLLLLLLLLLL-EEEEEelleeLHHHHHLLL-----LEEE----------


DSSP  hhhhhhllleeEELLhHHHH-----------hhhllllhhhhhhhhhhhhhHHHHlll
Query saavragaagaISGSaIVKI-----------ieknlaspkqmlaelrsfvsAMKAasr  255
ident             |                                             
Sbjct -----------NSDF-HELWhvyswktlvkseknieaikeairkntdvaiyLXRK---  224
DSSP  -----------ELLL-LLHHhhlleeeeeeelllhhhhhhhhhhllleeeeELLL---


No 52: Query=1bksA Sbjct=1v77A Z-score=4.8

back to top
DSSP  ------lhhhhhhhhhhhHLLLLEEEEEEELLLllhhhHHHHHHHHHHL-LLLLEEEELL
Query ------meryenlfaqlnDRREGAFVPFVTLGDpgieqSLKIIDTLIDA-GADALELGVP   53
ident                          |                        |  |  |  |
Sbjct vkfiemdirdkeayelakEWFDEVVVSIKFNEE----vDKEKLREARKEyGKVAILLSNP   56
DSSP  llleeeeellhhhhhhhhHHLLEEEEEEEELLL----lLHHHHHHHHHHhLLEEEEEELL


DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHhhllLLLEEEEEL-HHHHhlllhh
Query fsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIRekhpTIPIGLLMY-ANLVfnngid  112
ident                         |                  |                
Sbjct -----------------------KPSLVRDTVQKFK----SYLIYVESNdLRVI-----r   84
DSSP  -----------------------LHHHHHHHHHHLL----LLEEEEELLlHHHH-----h


DSSP  hhHHHHhhhlLLEEEELLL---lhhhLHHHHHHHHHLLLEEEEEE--LLLL---------
Query afYARCeqvgVDSVLVADV---pveeSAPFRQAALRHNIAPIFIC--PPNA---------  158
ident           ||      |                  | |  |                 
Sbjct ysIEKG----VDAIISPWVnrkdpgiDHVLAKLMVKKNVALGFSLrpLLYSnpyeranll  140
DSSP  hhHHLL----LLEEELLLLlllllllLHHHHHHHHHHLLEEEEELhhHHHLlhhhhhhhh


DSSP  ---lhhhhhhhhhhlLLLEEE------llllhHHHHHHHH-------hHLLLLeeellll
Query ---dddllrqvasygRGYTYL------lalplHHLIEKLK-------eYHAAPalqgfgi  202
ident                |                  ||              |         
Sbjct rfmmkawklvekykvRRFLTSsaqekwdvrypRDLISLGVvigmeipqAKASI-------  193
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllLEEEELllllhhhlllhHHHHHHHHhllllhhhHHHLL-------


DSSP  llhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query sspeqvsaavragaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                                                      
Sbjct --------------------------------------------smypeiilk  202
DSSP  --------------------------------------------lhhhhhhhl


No 53: Query=1bksA Sbjct=1j5sA Z-score=4.7

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct hmflgedylltnraavrlfnevkdlpivdphnhldakdivenkpwndiwevegatdhyvw   60
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhhlllleeellllllhhhhhhllllllhhhhhllllhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct elmrrcgvseeyitgsrsnkekwlalakvfprfvgnptyewihldlwrrfnikkviseet  120
DSSP  hhhhhllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllllllhhh


DSSP  -----------lhhhhhhhhhhhhlLLLEEEEE-------------------------EE
Query -----------meryenlfaqlndrREGAFVPF-------------------------VT   24
ident                           |                                 
Sbjct aeeiweetkkklpemtpqkllrdmkVEILCTTDdpvstlehhrkakeavegvtilptwRP  180
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllEEEEELLLllllllhhhhhhhhhlllleeelllLL


DSSP  LLL---------------------------lLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEL-----
Query LGD---------------------------pGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGV-----   52
ident                                      |        |  |          
Sbjct DRAmnvdkegwreyvekmgerygedtstldgFLNALWKSHEHFKEHGCVASDHALlepsv  240
DSSP  HHHhllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEElllll


DSSP  ----lllllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEL------
Query ----pfsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHPtIPIGLLMY------  102
ident                               |                   |         
Sbjct yyvdenraravhekafsgekltqdeindYKAFMMVQFGKMNQETN-WVTQLHIGalrdyr  299
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHL-LEEEEEELeellll


DSSP  ------------------HHHHhlllHHHHHHHHHHH---LLLEEEELllLHHHLHHHHH
Query ------------------ANLVfnngIDAFYARCEQV---GVDSVLVAdvPVEESAPFRQ  141
ident                                               |             
Sbjct dslfktlgpdsggdistnFLRI----AEGLRYFLNEFdgkLKIVLYVL--DPTHLPTIST  353
DSSP  hhhhhhlllllllleellLLLH----HHHHHHHHHHLlllLLEEEEEL--LHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLL-LEEE-EEELllLLHHHHHHHHHH--------lLLLEEEL---llLHHHHHHHH
Query AALRHN-IAPI-FICPpnADDDLLRQVASY--------gRGYTYLL---alPLHHLIEKL  188
ident  |                           |                           |  
Sbjct IARAFPnVYVGaPWWF-nDSPFGMEMHLKYlasvdllynLAGMVTDsrkllSFGSRTEMF  412
DSSP  HHHHLLlEEELlLLLL-lLLHHHHHHHHHHhhllllhhhLLLLLLLlllllHHHHHHHHH


DSSP  HHHLllleeellllllhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhh
Query KEYHaapalqgfgisspeqvsaavragaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvs  248
ident                                                             
Sbjct RRVL----------------------------snvvgemvekgqipikearelvkhvsyd  444
DSSP  HHHH----------------------------hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  hhhhlll
Query amkaasr  255
ident        
Sbjct gpkalff  451
DSSP  hhhhhhl


No 54: Query=1bksA Sbjct=3qy6A Z-score=4.6

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllleEEEE--EELL-----LLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELL
Query meryenlfaqlndrregaFVPF--VTLG-----DPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVP   53
ident                           |            |          |         
Sbjct ------------------MIDIhcHILPamddgAGDSADSIEMARAAVRQGIRTIIATPH   42
DSSP  ------------------LEELllLLLLlllllLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLE


DSSP  --LLLLllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHH------hhhhllllleeEEELHHh
Query --FSDPladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLAL------irekhptipigLLMYANl  105
ident                           ||   |                            
Sbjct hnNGVY-----------------knEPAAVREAADQlnkrlikediplhvlpgQEIRIY-   84
DSSP  elLLLL-----------------llLHHHHHHHHHHhhhhhhhllllleeellLEEELL-


DSSP  hhllLHHHHHH---hhhhhLLLEEEELL--lLHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEE-EELL--
Query vfnnGIDAFYA---rceqvGVDSVLVAD--vPVEE-SAPFRQAALRHNIAPIF-ICPP--  156
ident           |             |       |                 |         
Sbjct ---gEVEQDLAkrqllslnDTKYILIEFpfdHVPRyAEQLFYDLQLKGYIPVIaHPERnr  141
DSSP  ---lLHHHHHHllllllhhHLLEEEEELlllLLLLlHHHHHHHHHHLLLEEEEeLHHHlh


DSSP  --LLLHHHHHHHH-HHLLllEEEL------------lLLHHHHHHHHhhhlllLEEEL--
Query --NADDDLLRQVA-SYGRgyTYLL------------aLPLHHLIEKLkeyhaaPALQG--  199
ident        ||                                 | |               
Sbjct eiRENPSLLYHLVeKGAA--SQITsgslagifgkqlkAFSLRLVEAN-----lIHFVAsd  194
DSSP  hhHHLLHHHHHHHhLLLE--EEEEhhhhlllllhhhhHHHHHHHHLL-----lLLEEEll


DSSP  --------lLLLLhhHHHHHHHHLlleeeellhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query --------fGISSpeQVSAAVRAGaagaisgsaivkiieknlaspkqmlaelrsfvsamk  251
ident                                                             
Sbjct ahnvktrnfHTQE--ALYVLEKEF---------gselpymltenaelllrnqtifrqppq  243
DSSP  lllllllllLHHH--HHHHHHHHH---------llhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  hlll
Query aasr  255
ident     
Sbjct pvkr  247
DSSP  llll


No 55: Query=1bksA Sbjct=3f2bA Z-score=4.5

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct vrrletiveeerrvvvqgyvfdaevselksgrtlltmkitdytnsilvkmfsrdkedael   60
DSSP  lllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeelllhhhhhh


DSSP  -------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEE-eEELL--
Query -------------------------------meryenlfaqlndrregAFVP-fVTLG--   26
ident                                                   |         
Sbjct msgvkkgmwvkvrgsvqndtfvrdlviiandlneiaanerqdtapegeKRVElhLHTPms  120
DSSP  hhlllllleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeelllllllllllllLLLLllLLLLll


DSSP  ---LLLHhhHHHHHHHHHHLLLLLEEEELlllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHH
Query ---DPGIeqSLKIIDTLIDAGADALELGVpfsdpladgptiqnanlrafaagvtpaQCFE   83
ident            | |      |  |                                | | 
Sbjct qmdAVTS--VTKLIEQAKKWGHPAIAVTD-----------------------havvQSFP  155
DSSP  lllLLLL--HHHHHHHHHHLLLLLEEELL-----------------------llllLLHH


DSSP  HHHHHHHHLLlLLEEEEELH---------hhhhlllhhHHHHhhhhhllleeeellllhh
Query MLALIREKHPtIPIGLLMYA---------nlvfnngidAFYArceqvgvdsvlvadvpve  134
ident        ||    |  |                                           
Sbjct EAYSAAKKHGmKVIYGLEANivddpfhvtllaqnetglKNLF-klvslshiqyfhrvpri  214
DSSP  HHHHHHHHHLlLEEEEEEEEeellleeeeeeellhhhhHHHH-hhhhhhhllllllllle


DSSP  HLHHHHHHHhhLLLEEEEEEL--llLLHHhHHHHhHHLLlLEEEL---------------
Query ESAPFRQAAlrHNIAPIFICP--pnADDDlLRQVaSYGRgYTYLL---------------  177
ident                    |      |                                 
Sbjct PRSVLVKHR--DGLLVGSGCDkgelFDNV-EDIA-RFYD-FLEVHppdvykplyvkdeem  269
DSSP  EHHHHHHLL--LLEEEELLLLllllLLLL-LLLH-HHLL-LEEELlhhhhlllllllhhh


DSSP  -lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELL-----------------------------------l
Query -aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGF-----------------------------------g  201
ident                   |                                         
Sbjct ikNIIRSIVALGEKLDI-PVVATGnvhylnpedkiyrkilihsqgganplnrhelpdvyf  328
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHLLL-LEEELLllllllhhhhhhhhhhhhllhhhlllllllllllll


DSSP  lllHHHHHHHHHH-----lLLEE-------------------------------------
Query issPEQVSAAVRA-----gAAGA-------------------------------------  219
ident     |                                                       
Sbjct rttNEMLDCFSFLgpekakEIVVdntqkiasligdvkpikdelytpriegadeeiremsy  388
DSSP  llhHHHHHHHHHHhhhhhhHHHLhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  219
ident                                                             
Sbjct rrakeiygdplpklveerlekelksiighgfaviylishklvkkslddgylvgsrgsvgs  448
DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  219
ident                                                             
Sbjct sfvatmteitevnplpphyvcpnckhseffndgsvgsgfdlpdkncprcgtkykkdghdi  508
DSSP  lhhhhhllllllllllleeelllllleeellllllllhhhllllllllllllleeellll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  219
ident                                                             
Sbjct pfetflgfkgdkvpdidlnfsgeyqprahnytkvlfgednvyragtigtvadktaygfvk  568
DSSP  llhhhhllllllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellhhhhhhhhh


DSSP  -------eellhhhhhhhHLLLL-------------------------------------
Query -------isgsaivkiieKNLAS-------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct ayasdhnlelrgaeidrlAAGCTgvkrttgqhpggiivvpdymeiydftpiqypaddtss  628
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhHHHHLlleeeeeeeeeeeeellllllhhhllleelhhhllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct ewrtthfdfhsihdnllkldilghddptvirmlqdlsgidpktiptddpdvmgifsstep  688
DSSP  llleeeeehhhhllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhlllllhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct lgvtpeqimcnvgtigipefgtrfvrqmleetrpktfselvqisglshgtdvwlgnaqel  748
DSSP  hlllhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct iqngtctlsevigcrddimvyliyrglepslafkimesvrkgkgltpefeaemrkhdvpe  808
DSSP  hhlllllhhhllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhllllh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct wyidsckkikymfpkahaaayvlmavriayfkvhhpllyyasyftvraedfdldamikgs  868
DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  235
ident                                                             
Sbjct aairkrieeinakgiqatakekslltvlevalemcergfsfknidlyrsqatefvidgns  928
DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllllleeelle


DSSP  ----------------------------------------------hhhhhhhhhhhhhh
Query ----------------------------------------------pkqmlaelrsfvsa  249
ident                                                             
Sbjct lippfnaipglgtnvaqaivrareegeflskedlqqrgklsktlleylesrgcldslpdh  988
DSSP  eellhhhlllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  hhhlll
Query mkaasr  255
ident       
Sbjct nqlslf  994
DSSP  llllll


No 56: Query=1bksA Sbjct=3iacA Z-score=4.2

back to top
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct atfxtedfllkndiartlyhkyaapxpiydfhchlspqeiaddrrfdnlgqiwlegdhyk   60
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhhlllllleeellllllhhhhhhllllllhhhhhhllllhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct wralrsagvdeslitgketsdyekyxawantvpktlgnplyhwthlelrrpfgitgtlfg  120
DSSP  hhhhhhllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  -------------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLL
Query -------------------------------------------meryenlfaqlnDRREG   17
ident                                                           | 
Sbjct pdtaesiwtqcneklatpafsargixqqxnvrxvgttddpidsleyhrqiaaddsIDIEV  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhlleeeeelllllllllhhhhhhhhlllLLLEE


DSSP  EEEEEEE-LLLL---------------------lhhHHHHHHHHHHHLL----LLLEEEE
Query AFVPFVT-LGDP---------------------gieQSLKIIDTLIDAG----ADALELG   51
ident |                                             |        |   |
Sbjct APSWRPDkVFKIeldgfvdylrkleaaadvsitrfdDLRQALTRRLDHFaacgCRASDHG  240
DSSP  ELLLLLHhHHLLllllhhhhhhhhhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHhhllLLEEEEE


DSSP  LLL-------lllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLL--LLLEEEEEL
Query VPF-------sdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHP--TIPIGLLMY  102
ident                                         |               |   
Sbjct IETlrfapvpddaqldailgkrlagetlseleIAQFTTAVLVWLGRQYAarGWVXQLHIG  300
DSSP  ELLllllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEEL


DSSP  -----------------------HHHHhlllhHHHHHHHHHHL-------lLEEEELLLL
Query -----------------------ANLVfnngiDAFYARCEQVG-------vDSVLVADVP  132
ident                         |            |                      
Sbjct airnnntrxfrllgpdtgfdsigDNNI-----SWALSRLLDSXdvtnelpkTILYCLNPR  355
DSSP  eellllhhhhhhhllllllleelLLLL-----HHHHHHHHHHHhlllllleEEEEELLHH


DSSP  hhhLHHHHHHHHHLL-------LEEEEEelllLLHHHHHHHHHHL-------llLEEEL-
Query veeSAPFRQAALRHN-------IAPIFIcppnADDDLLRQVASYG-------rgYTYLL-  177
ident                                    |                     |  
Sbjct --dNEVLATXIGNFQgpgiagkVQFGSGwwfnDQKDGXLRQLEQLsqxgllsqfVGXLTd  413
DSSP  --hHHHHHHHHHHLLlllllllEEELLLlhhhLLHHHHHHHHHHHhhhllhhhlLLLLLl


DSSP  --llLHHHHHHHHHHHLllleeellllllhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhllll
Query --alPLHHLIEKLKEYHaapalqgfgisspeqvsaavragaagaisgsaivkiieknlas  235
ident           |                                                 
Sbjct srsfLSYTRHEYFRRIL------------------------cnllgqwaqdgeipddeax  449
DSSP  llllLLLHHHHHHHHHH------------------------hhhhhhhhhlllllllhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query pkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                     
Sbjct lsrxvqdicfnnaqryftik  469
DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhllll


No 57: Query=1bksA Sbjct=3e38A Z-score=3.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhHHHL--LLLEEEE-EEELLL-llhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLL
Query meryenlfaqLNDR--REGAFVP-FVTLGD-pgieQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSD   56
ident             |                            |     | ||  |      
Sbjct --aqrrneiqVPDLdgYTTLKCDfHXHSVFsdglvWPTVRVDEAYRDGLDAISLTEHIEY   58
DSSP  --llllllllLLLLllLEEEEEElLLLLLLlllllLHHHHHHHHHHLLLLEELLEEELLL


DSSP  lllllhhhhhhHHHHhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEElhhhhhlllhhhhhh
Query pladgptiqnaNLRAfAAGVTPAQCFEMLALIREKHPtIPIGLLMyanlvfnngidafya  116
ident                          |       ||   |                     
Sbjct -----------RPHKqDVVSDHNRSFDLCREQAEKLG-ILLIKGS----------eitra   96
DSSP  -----------LLLLlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL-LEELLEE----------eeell


DSSP  hhhhhlllEEEE------llllhhHLHHHHHHHhhlllEEEEE----------elLLLLH
Query rceqvgvdSVLV------advpveESAPFRQAAlrhniAPIFI----------cpPNADD  160
ident           |                           |  |                  
Sbjct xapghfnaIFLSdsnpleqkdykdAFREAKKQG-----AFXFWnhpgwdsqqpdtTKWWP  151
DSSP  lllleeeeELLLllhhhllllhhhHHHHHHHLL-----LEEEEllllllllllllLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHLlllEEEL------llLHHHHHHHHHhhllllEEELlllllhhhhhhhhhh
Query DLLRQVASYGrgyTYLL------alPLHHLIEKLKeyhaapALQGfgisspeqvsaavra  214
ident                                             |               
Sbjct EHTALYQEGC-xhGIEVanghlyxpEAIQWCLDKN-----lTXIG---------------  190
DSSP  HHHHHHHLLL-llEEEEeelleellHHHHHHHHHL-----lEEEE---------------


DSSP  llleeEELLhhHHHH---------------------------------------------
Query gaagaISGSaiVKII---------------------------------------------  229
ident       |       |                                             
Sbjct -----TSDI--HQPIqtdydfekgehrtxtfvfakerslqgirealdnrrtaayfhelli  243
DSSP  -----ELLL--LLLHhhhllhhhllllleeeeeellllhhhhhhhhhllleeeeelleee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  229
ident                                                             
Sbjct gredllrpffekcvkieevsrneqgvtlsitnvtdlvlklkktahdtllvyfrdxtlkph  303
DSSP  llhhhhhhhhhhheeeeeeeeelleeeeeeeellllleeeeelllllleellleeeelll


DSSP  -------------hhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query -------------eknlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident                                        
Sbjct trytvrigfkqgikggdvnfevtnfivapdkglkytisl  342
DSSP  eeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeel


No 58: Query=1bksA Sbjct=3ooqA Z-score=3.7

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhHHLL---------------------------------------lleeee
Query meryenlfaqlNDRR---------------------------------------egafvp   21
ident                                                             
Sbjct --kilfknatvFPITsrpfkgdvlvsngkvekvgeniedpdaeivdltgkflfpgfvdah   58
DSSP  --leeeeeeeeLLLLllleeeeeeeelleeeeeelllllllleeeelllleeeeleeeee


DSSP  EEELLLL--------------------------lHHHHhHHHHHHHHLLLLLEEEELlll
Query FVTLGDP--------------------------gIEQSlKIIDTLIDAGADALELGVpfs   55
ident                                     |    |      |           
Sbjct SHIGLFEegvgyyysdgneatdpvtphvkaldgfNPQD-PAIERALAGGVTSVXIVP---  114
DSSP  ELLLLLLllllhhhlllllllllllllllhhhhlLLLL-HHHHHHHLLLEEEEEELL---


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhHHHHHLLLlleeeeelhhhhhlllhhhhh
Query dpladgptiqnanlrafaagvtpaqcfemlaLIREKHPTipigllmyanlvfnngidafy  115
ident                                 | |                         
Sbjct --------------gsanpvggqgsvikfrsIIVEECIV---------------------  139
DSSP  --------------llllleeeeeeeeelllLLHHHHEE---------------------


DSSP  hhhhhhLLLEEEEL-------------------llLHHHLH-------------------
Query arceqvGVDSVLVA-------------------dvPVEESA-------------------  137
ident              |                                              
Sbjct -----kDPAGLKXAfgenpkrvygerkqtpstrxgTAGVIRdyftkvknyxkkkelaqke  194
DSSP  -----eEEEEEEEEllhhhhhhhhhlllllllhhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  -----------hhHHHHHHLLLEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHL-----LLLEEELlllH
Query -----------pfRQAALRHNIAPIFICPPNAdddLLRQVASYG-----RGYTYLLalpL  181
ident                  ||  |                                      
Sbjct gkeftetdlkxevGEXVLRKKIPARXHAHRAD---DILTAIRIAeefgfNLVIEHG-teA  250
DSSP  llllllllhhhhhHHHHHLLLLLEEEEELLHH---HHHHHHHHHhhhllLEEEEEL-llH


DSSP  HHHHHHHHHHLLlLEEELlLLLL-------hhhhHHHHHHL-----lLEEEEL--LHHHh
Query HHLIEKLKEYHAaPALQGfGISS-------peqvSAAVRAG-----aAGAISG--SAIVk  227
ident       | |    |   |                                          
Sbjct YKISKVLAEKKI-PVVVG-PLLTfrtklelkdltXETIAKLlkdgvlIALXCDhpVIPL-  307
DSSP  HHHHHHHHHHLL-LEEEL-LLLLllllhhhllllLLHHHHHhhllllEEELLLllLLLH-


DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHH----------HLLL----------------------
Query iieknlaspkqmlaelrsFVSAMK----------AASR----------------------  255
ident                   |                                         
Sbjct -----------------eFATVQAataxrygakeEDLLkiltvnpakilgledrigsiep  350
DSSP  -----------------hHHHHHHhhhhhhlllhHHHHhlllhhhhhhllllllllllll


DSSP  ----------------------------------
Query ----------------------------------  255
ident                                   
Sbjct gkdadlvvwsghpfdxksvvervyidgvevfrre  384
DSSP  llllleeeelllllllllleeeeeelleeeeell


No 59: Query=1bksA Sbjct=2yb1A Z-score=3.3

back to top
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllLEEE-eEEELLlllhhhhHHHHHHHHHLLL-LLEEEELllllll
Query meryenlfaqlndrreGAFV-pFVTLGdpgieqsLKIIDTLIDAGA-DALELGVpfsdpl   58
ident                       |              ||                     
Sbjct ----------------ANIDlhFHSRTsdgaltpTEVIDRAAARAPaLLALTDH------   38
DSSP  ----------------LLEEllLLLLLllllllhHHHHHHHHLLLLlEEEELLL------


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHLL----LLLEEEEELH-hhhhlllhhh
Query adgptiqnanlrafaagvtpaqcfEMLALIREKHP----TIPIGLLMYA-nlvfnngida  113
ident                           ||               |                
Sbjct ---------------------dctGGLAEAAAAAArrgiPFLNGVEVSVswgrhtvhivg   77
DSSP  ---------------------lllLLHHHHHHHHHhlllLEEEEEEEEEeelleeeeeee


DSSP  hhhHHHH-----------------------------------------------------
Query fyaRCEQ-----------------------------------------------------  120
ident                                                             
Sbjct lgiDPAEpalaaglksiregrlerarqmgasleaagiagcfdgamrwcdnpemisrthfa  137
DSSP  ellLLLLhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhlllllhhhllhhhhh


DSSP  -------------------hllleeeellllhhHLHHHHHHHHHLLLEEEEE-ELLL---
Query -------------------vgvdsvlvadvpveESAPFRQAALRHNIAPIFI-CPPN---  157
ident                                                             
Sbjct rhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvshqwaSLEDAVGWIVGAGGMAVIAhPGRYdmg  197
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhlllllllllllllllLHHHHHHHHHHLLLEEEELlHHHLlll


DSSP  --lLHHHHHHHH-HHLLlLEEE--------llllhhHHHHHHHhhllLLEEellllllhh
Query --aDDDLLRQVA-SYGRgYTYL--------lalplhHLIEKLKeyhaAPALqgfgisspe  206
ident       |        |                                 |          
Sbjct rtlIERLILDFQaAGGQ-GIEVasgshslddmhkfaLHADRHG----LYAS---------  243
DSSP  hhhHHHHHHHHHhLLLL-EEEEeellllhhhhhhhhHHHHHHL----LEEE---------


DSSP  hhhhhhhhllleEEELLhhHHHHH------hllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qvsaavragaagAISGSaiVKIIE------knlaspkqmlaelrsfvsamkaasr  255
ident               |        |                               
Sbjct ------------SGSDF--HAPGEdvghtedlppicrpiwrelearilrpadaen  284
DSSP  ------------EELLL--LLLLLllllllllllllllhhhhlhhhlllllhhhl