Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 1a5k-C 79.0 0.0 566 566 100 PDB MOLECULE: UREASE (GAMMA SUBUNIT);
2
DSSP LEEEHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL Query SNISRQAYADMFGPTVGDKVRLADTELWIEVEDDLTTYGEEVKFGGGKVIRDGMGQGQML 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct SNISRQAYADMFGPTVGDKVRLADTELWIEVEDDLTTYGEEVKFGGGKVIRDGMGQGQML 60 DSSP LEEEHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLLLEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL DSSP HHHLLLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELEELLLLLLLLLEELLLLLEEEEL Query AADCVDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKAGNPDIQPNVTIPIGAATEVIAA 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct AADCVDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKAGNPDIQPNVTIPIGAATEVIAA 120 DSSP HHHLLLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELEELLLLLLLLLEELLLLLEEEEL DSSP LLLEEEELEEEEEEELLLLLHHHHHHHHLEEEEEEELLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHH Query EGKIVTAGGIDTHIHWICPQQAEEALVSGVTTMVGGGTGPAAGTHATTCTPGPWYISRML 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct EGKIVTAGGIDTHIHWICPQQAEEALVSGVTTMVGGGTGPAAGTHATTCTPGPWYISRML 180 DSSP LLLEEEELEEEEEEELLLLLHHHHHHHHLEEEEEEELLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHH DSSP HHHLLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLL Query QAADSLPVNIGLLGKGNVSQPDALREQVAAGVIGLEIHEDWGATPAAIDCALTVADEMDI 240 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct QAADSLPVNIGLLGKGNVSQPDALREQVAAGVIGLEIHEDWGATPAAIDCALTVADEMDI 240 DSSP HHHLLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLL DSSP EEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHLLLEEEEEEHHH Query QVALHSDTLNESGFVEDTLAAIGGRTIHTFHTEGAGGGHAPDIITACAHPNILPSSTNPT 300 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct QVALHSDTLNESGFVEDTLAAIGGRTIHTFHTEGAGGGHAPDIITACAHPNILPSSTNPT 300 DSSP EEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLLLLLLHHHHHHLLLEEEEEEHHH DSSP LLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLL Query LPYTLNTIDEHLDMLMVCHHLDPDIAEDVAFAESRIRRETIAAEDVLHDLGAFSLTSSDS 360 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct LPYTLNTIDEHLDMLMVCHHLDPDIAEDVAFAESRIRRETIAAEDVLHDLGAFSLTSSDS 360 DSSP LLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLL DSSP LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLL Query QAMGRVGEVILRTWQVAHRMKVQRGALAEETGDNDNFRVKRYIAKYTINPALTHGIAHEV 420 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct QAMGRVGEVILRTWQVAHRMKVQRGALAEETGDNDNFRVKRYIAKYTINPALTHGIAHEV 420 DSSP LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLL DSSP LLLLLLLLLLEEEELHHHLLLLLLEEEELLEEEEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELHHHLH Query GSIEVGKLADLVVWSPAFFGVKPATVIKGGMIAIAPMGDINASIPTPQPVHYRPMFGALG 480 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct GSIEVGKLADLVVWSPAFFGVKPATVIKGGMIAIAPMGDINASIPTPQPVHYRPMFGALG 480 DSSP LLLLLLLLLLEEEELHHHLLLLLLEEEELLEEEEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELHHHLH DSSP HHHHHHLEEEELHHHHHHLHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLHHHLLLLLLLLLEEELLLLL Query SARHHCRLTFLSQAAAANGVAERLNLRSAIAVVKGCRTVQKADMVHNSLQPNITVDAQTY 540 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct SARHHCRLTFLSQAAAANGVAERLNLRSAIAVVKGCRTVQKADMVHNSLQPNITVDAQTY 540 DSSP HHHHHHLEEEELHHHHHHLHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLHHHLLLLLLLLLEEELLLLL DSSP LEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLL Query EVRVDGELITSEPADVLPMAQRYFLF 566 ident |||||||||||||||||||||||||| Sbjct EVRVDGELITSEPADVLPMAQRYFLF 566 DSSP LEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLLL
DSSP leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll Query snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml 60 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 0 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhllLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELEelllllllllEELLLLLEEEEL Query aadcvDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKAgnpdiqpnvtIPIGAATEVIAA 120 ident | | | |||| | || |||| | Sbjct -----PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQN----------LEAPPGTEVIDA 45 DSSP -----LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELL----------LLLLLLLEEEEL DSSP LLLEEEELEEEEEEEL----------LLLL-HHHHHHHHLEEEEEEelllllhhhhhlLL Query EGKIVTAGGIDTHIHW----------ICPQ-QAEEALVSGVTTMVGggtgpaagthatTC 169 ident || | | || | | || | || | Sbjct TGKYVFPGFIDPHVHIylpfmatfakDTHEtGSKAALMGGTTTYIE------------MC 93 DSSP LLLEEEELEEEEEELLlleelleellLLHHhHHHHHHHLLEEEEEE------------EE DSSP LL-----HHHHHHHHHHHHL-LLLLEEEEEEELLLL---LHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH Query TP-----GPWYISRMLQAAD-SLPVNIGLLGKGNVS---QPDALREQVAAGVIGLEIHED 220 ident | | ||| || | | Sbjct CPsrnddALEGYQLWKSKAEgNSYCDYTFHMAVSKFdekTEGQLREIVADGISSFXIFLS 153 DSSP LLlllllHHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEELLLLlllHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEL DSSP ----HLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLL------------------------- Query ----WGATPAAIDCALTVADEMDIQVALHSDTLNE------------------------- 251 ident | | | | | | Sbjct yknfFGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENAELvgrlqqkllsegktgpewhepsrpe 213 DSSP llllLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLHHHhhhhhhhhhhlllllhhhllllllh DSSP ---lLLHHHHHHHHL--LLLEEELLLLLlllllllLHHH-HHHLL----LEEEEEEHHHL Query ---sGFVEDTLAAIG--GRTIHTFHTEGaggghapDIIT-ACAHP----NILPSSTNPTL 301 ident | | | | | | | | Sbjct aveaEGTARFATFLEttGATGYVVHLSC------kPALDaAMAAKargvPIYIESVIPHF 267 DSSP hhhhHHHHHHHHHHHhhLLEEEELLLLL------hHHHHhHHHHHhlllLEEEEEEHHHH DSSP LLlllHHHHH-------HHHHhhhhllllllhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLL Query PYtlnTIDEH-------LDMLmvchhldpdiaedvafaesrIRRETIAAEDVLHDLGAFS 354 ident | Sbjct LL---DKTYAerggveaMKYI---------------mspplRDKRNQKVLWDALAQGFID 309 DSSP HL---LHHHHhllhhhhHLLL---------------lllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLL DSSP EEELLLL-------------------LLLLLLLHHHHHH-HHHHHHHhhhllllllllll Query LTSSDSQ-------------------AMGRVGEVILRTW-QVAHRMKvqrgalaeetgdn 394 ident | | Sbjct TVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipnGIPAIEDRVNLLYtYGVSRGR------------- 356 DSSP EEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLLLHHHHHHhHHLLLLL------------- DSSP lhhHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELHHH---------------- Query dnfRVKRYIAKYTINPALTHGIAHEVGSIEVGKLADLVVWSPAF---------------- 438 ident | | | | | || ||||| | Sbjct --lDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQYrgtisvktqhvnndyn 414 DSSP --lLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLleellhhhllllllll DSSP ------llLLLLEEEELLEEEEEEellllllllllllleEEELhHHLHhhhhhHLEEEEl Query ------fgVKPATVIKGGMIAIAPmgdinasiptpqpvhYRPMfGALGsarhhCRLTFLs 492 ident | | | | | | Sbjct gfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRD---------------GQFV-GEKG-----WGKLLR- 452 DSSP llllleelLEEEEEEELLEEEEEL---------------LEEL-LLLL-----LLLLLL- DSSP hhhhhhlhhhhllllleeeeLLLLLLllhhhllllllllleeelllllleeelleellll Query qaaaangvaerlnlrsaiavVKGCRTvqkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelitse 552 ident Sbjct --------------------REPMYF---------------------------------- 458 DSSP --------------------LLLLLL---------------------------------- DSSP llllllllllllll Query padvlpmaqryflf 566 ident Sbjct -------------- 458 DSSP --------------
DSSP leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll Query snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml 60 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 0 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhLLLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELeellllllllLEELlllLEEEEL Query aadCVDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKagnpdiqpnvTIPIgaaTEVIAA 120 ident || | || || | | ||| || | Sbjct ---SFDLIIKNGTVILENEARVVDIAVKGGKIAAIGQ----------DLGD--aKEVXDA 45 DSSP ---LEEEEEELLEEELLLLEEELEEEEELLEEEEEEL----------LLLL--eEEEEEL DSSP LLLEEEELEEEEEEeLLLL-LHHHHHHHHLEEEEEEELllllHHHHhlllLLHHHHHHHH Query EGKIVTAGGIDTHIhWICP-QQAEEALVSGVTTMVGGGtgpaAGTHattcTPGPWYISRM 179 ident | | | | | | | | || | | Sbjct SGLVVSPGXVDAHT-HIGYeTGTRAAAKGGITTXIEXP----LNQL--paTVDRASIELK 98 DSSP LLLEEEELEEEEEE-LLLHhHHHHHHHHLLEEEEEELL----LLLL--llLLLHHHHHHH DSSP HHHHL-LLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEHhHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query LQAAD-SLPVNIGLLGKGNVSQPDALREQVAAGVIGLEIHEdWGATPAAIDCALTVADEM 238 ident || | || | | | || | | Sbjct FDAAKgKLTIDAAQLGGLVSYNIDRLHELDEVGVVGFXCFV-RDVNDWQFFKGAQKLGEL 157 DSSP HHHHLlLLLLEEEELEELLLLLLLLHHHHHHHLLLLEEEEL-LLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP LLEEEEELLLLLL----------------------------lLLHHHHHHHHLL--LLEE Query DIQVALHSDTLNE----------------------------sGFVEDTLAAIGG--RTIH 268 ident | | | | Sbjct GQPVLVHCENALIcdelgeeakregrvtahdyvasrpvftevEAIRRVLYLAKVagCRLH 217 DSSP LLLEEEELLLHHHhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHHHHhlLLEE DSSP ELLLLLlllllllLHHH-HHHLL----LEEEEEEHHHLLLlllHHHHH----HHHHhhhh Query TFHTEGaggghapDIIT-ACAHP----NILPSSTNPTLPYtlnTIDEH----LDMLmvch 319 ident | | | | Sbjct VCHVSS------pEGVEeVTRARqegqDITCESCPHYFVL---DTDQFeeigTLAK---- 264 DSSP ELLLLL------hHHHHhHHHHHhlllLEEEEELLHHHHL---LHHHHhhhlHHHL---- DSSP llllllhhhhhllllLLLH-HHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLL----------------L Query hldpdiaedvafaesRIRR-ETIAAEDVLHDLGAFSLTSSDSQ----------------A 362 ident || | | || Sbjct ------------cspPIRDlENQKGXWEKLFNGEIDCLVSDHSpcppexkagnixkawgG 312 DSSP ------------lllLLLLhHHHHHHHHHHHLLLLLEELLLLLllllllllllllllllL DSSP LLLLLLHHHHHH-HHHHHHHhhhlllllllllllhHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLlLLLL Query MGRVGEVILRTW-QVAHRMKvqrgalaeetgdndnFRVKRYIAKYTINPALTHGIaHEVG 421 ident | | | | Sbjct IAGLQSCXDVXFdEAVQKRG---------------XSLPXFGKLXATNAADIFGL-QQKG 356 DSSP LLLHHHHHHHHHhHHLLLLL---------------LLHHHHHHHHLHHHHHHLLL-LLLL DSSP LLLLLLLLLEEEELHHH----------------------llLLLLEEEELLEEEEEEEll Query SIEVGKLADLVVWSPAF----------------------fgVKPATVIKGGMIAIAPMgd 459 ident | || || | | | | Sbjct RIAPGKDADFVFIQPNSsyvltnddleyrhkvspyvgrtigARITKTILRGDVIYDIE-- 414 DSSP LLLLLLLLLEEEEELLLleellhhhllllllllllllleelLEEEEEEELLEEEEELL-- DSSP llllllllllleEEELHHHlhhhhhhHLEEEELHhhhhhlhhhhllllleeeelllllll Query inasiptpqpvhYRPMFGAlgsarhhCRLTFLSQaaaangvaerlnlrsaiavvkgcrtv 519 ident | Sbjct ------------QGFPVAP-------KGQFILKH-------------------------- 429 DSSP ------------LLLLLLL-------LLLEELLL-------------------------- DSSP lhhhllllllllleeelllllleeelleellllllllllllllllll Query qkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelitsepadvlpmaqryflf 566 ident Sbjct ----------------------------------------------- 429 DSSP -----------------------------------------------
DSSP leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll Query snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml 60 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 0 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhlllEEEEEEEEEELLEEEE-EEEEEELLEEEEEELEelllllllLLEELLllLEEEE Query aadcvdLVLTNALIVDHWGIVK-ADIGVKDGRIFAIGKAgnpdiqpnVTIPIGaaTEVIA 119 ident || | || | | | Sbjct ------YALTQGRIFTGHEFLDdHAVVIADGLIKSVCPV--------AELPPE--IEQRS 44 DSSP ------LEEELLEEELLLLEELlEEEEEELLEEEEEEEH--------HHLLLL--LLEEE DSSP LLLLEEEELEEEEEEEL----------------LLLLHHHHHHHHLEEEEEEELllllhh Query AEGKIVTAGGIDTHIHW----------------ICPQQAEEALVSGVTTMVGGGtgpaag 163 ident | | | || || | Sbjct LNGAILSPGFIDVQLNGcggvqfndtaeavsveTLEIMQKANEKSGCTNYLPTL------ 98 DSSP LLLLEEEELEEEEEELEelleelllllllllhhHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEE------ DSSP hhhllllLHHHHHHHHHHHHLLLLLE-EEEEEELLLllHHHHHHHHHH--LLLEEEEehh Query thattctPGPWYISRMLQAADSLPVN-IGLLGKGNVsqPDALREQVAA--GVIGLEIhed 220 ident | | || | Sbjct -ittsdeLMKQGVRVMREYLAKHPNQaLGLHLEGPWlnAALVDFLCENadVITKVTL--- 154 DSSP -llllhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLEEEELLLllLHHHHHHHHLhhHEEEEEE--- DSSP hlLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLlllllLHHHHHHHHLLLLEEELLLLLllLLLL Query wgATPAAIDCALTVADEMDIQVALHSDTlnesgFVEDTLAAIGGRTIHTFHTEGagGGHA 280 ident | | | | | Sbjct --APEMVPAEVISKLANAGIVVSAGHSN----aTLKEAKAGFRAGITFATHLYN--AMPY 206 DSSP --LHHHLLHHHHHHHHHHLLEEEELLLL----lLHHHHHHHHHHLEEEELLLLL--LLLL DSSP L-----LHHH-HHHLLLEEEEEEHH--HLLLlllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhll Query P-----DIIT-ACAHPNILPSSTNP--TLPYtlntidehldmlmvchhldpdiaedvafa 332 ident | | Sbjct ItgrepGLAGaILDEADIYCGIIADglHVDY----------------------------- 237 DSSP LlllllHHHHhHHHLLLLEEEEELLllLLLH----------------------------- DSSP lllllhhhhHHHHHHHhLLLL--LEEELLLLlLLLLlLHHHHHHHHHHHHHhhhllllll Query esrirretiAAEDVLHdLGAF--SLTSSDSQaMGRVgEVILRTWQVAHRMKvqrgalaee 390 ident | | | Sbjct ---------ANIRNAK-RLKGdkLCLVTDATsGSSL-TMIEGVRNLVEHCG--------- 277 DSSP ---------HHHHHHH-HHHHhhEEEELLLLlLLLL-LHHHHHHHHHHHHL--------- DSSP lllllhhHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELHHhllLLLLEEEELL Query tgdndnfRVKRYIAKYTINPALTHGIAHEVGSIEVGKLADLVVWSPAffgVKPATVIKGG 450 ident | || | | || | | | | | | Sbjct ------iALDEVLRMATLYPARAIGVEKRLGTLAAGKVANLTAFTPD---FKITKTIVNG 328 DSSP ------lLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL---LLEEEEEELL DSSP EEEEEEellllllllllllleeeelhhhlhhhhhhhleeeelhhhhhhlhhhhlllllee Query MIAIAPmgdinasiptpqpvhyrpmfgalgsarhhcrltflsqaaaangvaerlnlrsai 510 ident Sbjct NEVVTQ------------------------------------------------------ 334 DSSP EEEEEL------------------------------------------------------ DSSP eellllllllhhhllllllllleeelllllleeelleellllllllllllllllll Query avvkgcrtvqkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelitsepadvlpmaqryflf 566 ident Sbjct -------------------------------------------------------- 334 DSSP --------------------------------------------------------
DSSP leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll Query snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml 60 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 0 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhllLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELeellllllllLEELLLLLEEEEL Query aadcvDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKagnpdiqpnvTIPIGAATEVIAA 120 ident | | || || | || | | Sbjct ----dRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGE----------NLIVPGGVKTIEA 46 DSSP ----lEEEEEEEEEELLLLEEEEEEEEELLEEEEEEL----------LLLLLLLLEEEEL DSSP LLLEEEELEEEEEEELL------LLLHHHHHHHHLEEEEEEelllllhhhhhlLLLL--- Query EGKIVTAGGIDTHIHWI------CPQQAEEALVSGVTTMVGggtgpaagthatTCTP--- 171 ident | | |||| | ||| | | | Sbjct NGRMVIPGGIDVNTYLQktaaddFFQGTRAALVGGTTMIID------------HVVPepg 94 DSSP LLLEEEELEEEEEELLLllllllHHHHHHHHHHLLEEEEEE------------EELLlll DSSP --HHHHHHHHHHHHL-LLLLEEEEEEELLLL---LHHHHHHHHH-HLLLEEEEEHH---- Query --GPWYISRMLQAAD-SLPVNIGLLGKGNVS---QPDALREQVA-AGVIGLEIHED---- 220 ident ||| | | | || Sbjct ssLLTSFEKWHEAADtKSCCDYSLHVDITSWydgVREELEVLVQdKGVNSFQVYMAykdv 154 DSSP llHHHHHHHHHHHHHlLLLLEEEEEEELLLLlllHHHHHHHHHHlLLLLEEEEELLllll DSSP HLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLL----------------------------l Query WGATPAAIDCALTVADEMDIQVALHSDTLNE----------------------------s 252 ident | | | Sbjct YQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLiaqeqkrilemgitgpeghalsrpeelea 214 DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLHHHhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllhhhhh DSSP lLHHHHHHHHL--LLLEEELLLLLllllllLLHH-HHHHLL----LEEEEEEHHHLLLll Query gFVEDTLAAIG--GRTIHTFHTEGaggghaPDII-TACAHP----NILPSSTNPTLPYtl 305 ident | | | Sbjct eAVFRAITIAGriNCPVYITKVMS------KSAAdIIALARkkgpLVFGEPIAASLGT-- 266 DSSP hHHHHHHHHHHhhLLLEEEEEELL------HHHHhHHHHHHhhllLEEEEELHHHHHL-- DSSP lHHHHH--------HHHHhhhhllllllhhhhhllllLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLEEE Query nTIDEH--------LDMLmvchhldpdiaedvafaesRIRRETIAAEDVLHDLGAFSLTS 357 ident | | | | Sbjct -DGTHYwsknwakaAAFV--------------tspplSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTG 311 DSSP -LLHHHhlllhhhhHHLL--------------lllllLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLL DSSP LLLL-------------------LLLLLLLHHHHHHHHH-HHHHhhhlllllllllllhh Query SDSQ-------------------AMGRVGEVILRTWQVA-HRMKvqrgalaeetgdndnf 397 ident | | | | | Sbjct SGHCpystaqkavgkdnftlipeGVNGIEERMTVVWDKAvATGK---------------m 356 DSSP LLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLLLHHHHHHHHHlLLLL---------------l DSSP HHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELHHH------------------- Query RVKRYIAKYTINPALTHGIAHEVGSIEVGKLADLVVWSPAF------------------- 438 ident | | | | | || || | | | Sbjct DENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKlktitakshksaveynife 416 DSSP LHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEeeellllllllllllllll DSSP ---llLLLLEEEELLEEEEEEellllllllllllleEEELhhHLHHHhhhhLEEEElhhh Query ---fgVKPATVIKGGMIAIAPmgdinasiptpqpvhYRPMfgALGSArhhcRLTFLsqaa 495 ident | || | | Sbjct gmechGSPLVVISQGKIVFED---------------GNIN--VNKGM----GRFIP---- 451 DSSP lleeeEEEEEEEELLEEEEEL---------------LEEL--LLLLL----LLLLL---- DSSP hhhlhhhhllllleeeeLLLLLLLLhhhllllllllleeelllllleeelleelllllll Query aangvaerlnlrsaiavVKGCRTVQkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelitsepad 555 ident | Sbjct -----------------RKAFPEHL----------------------------yqrvkir 466 DSSP -----------------LLLLLHHH----------------------------hhhhhhh DSSP lllllllllll Query vlpmaqryflf 566 ident Sbjct nkvfglqgvsr 477 DSSP hhhllllllll
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